More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3076 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 396 aa  782    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  68.51 
 
 		 400 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  69.27 
 
 		 400 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  68.77 
 
 		 400 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  65.9 
 
 		 398 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  66.16 
 
 		 398 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0158  phosphoglycerate kinase  69.02 
 
 		 400 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  67.51 
 
 		 398 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  68.01 
 
 		 398 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  65.99 
 
 		 398 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  65.74 
 
 		 398 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  65.56 
 
 		 398 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  64.3 
 
 		 396 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  66.16 
 
 		 398 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  63.57 
 
 		 398 aa  511  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  63.71 
 
 		 395 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  63.75 
 
 		 401 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  64.32 
 
 		 400 aa  507  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  62.94 
 
 		 395 aa  501  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0520  phosphoglycerate kinase  62.85 
 
 		 407 aa  498  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  61.52 
 
 		 409 aa  495  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  65.57 
 
 		 399 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  62.72 
 
 		 400 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  62.28 
 
 		 407 aa  496  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  61.58 
 
 		 396 aa  482  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1318  phosphoglycerate kinase  64.23 
 
 		 398 aa  483  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.575519  normal  0.28013 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2106  phosphoglycerate kinase  62.09 
 
 		 402 aa  478  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.811046  normal  0.0646104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3538  phosphoglycerate kinase  61.46 
 
 		 400 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2604  phosphoglycerate kinase  64.47 
 
 		 397 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1152  phosphoglycerate kinase  66.75 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1097  phosphoglycerate kinase  66.08 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4044  phosphoglycerate kinase  66.75 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2596  phosphoglycerate kinase  59.24 
 
 		 403 aa  462  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0221  phosphoglycerate kinase  61.87 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0766  phosphoglycerate kinase  60.31 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1965  phosphoglycerate kinase  63.13 
 
 		 395 aa  455  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.159546  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1694  phosphoglycerate kinase  62.09 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0140  phosphoglycerate kinase  52.28 
 
 		 400 aa  428  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2155  phosphoglycerate kinase  61.73 
 
 		 393 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1918  phosphoglycerate kinase  60.96 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.253475 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1222  phosphoglycerate kinase  57.22 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  54.1 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  50.88 
 
 		 395 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0449  phosphoglycerate kinase  52.16 
 
 		 400 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0576652  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  51.92 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  49.11 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.47 
 
 		 650 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  47.3 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  49.23 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.85 
 
 		 655 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  47.22 
 
 		 399 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  48.75 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  49.36 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  47.22 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  49.36 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  50.26 
 
 		 402 aa  364  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  47.22 
 
 		 399 aa  363  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  46.1 
 
 		 443 aa  363  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1617  phosphoglycerate kinase  50.76 
 
 		 397 aa  363  4e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0893272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 		 393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.57 
 
 		 654 aa  361  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 401 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 		 394 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  47.83 
 
 		 393 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  46.85 
 
 		 402 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  47.12 
 
 		 399 aa  357  9.999999999999999e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  46.46 
 
 		 398 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 		 401 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  49.12 
 
 		 394 aa  356  5e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  46.33 
 
 		 394 aa  355  5.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  48.61 
 
 		 395 aa  355  5.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  46.97 
 
 		 394 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  46.98 
 
 		 399 aa  354  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  46.72 
 
 		 402 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  45.71 
 
 		 397 aa  353  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  46.68 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  46.97 
 
 		 402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 		 389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.46 
 
 		 646 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  46.94 
 
 		 394 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  46.94 
 
 		 394 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  46.68 
 
 		 394 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07140  phosphoglycerate kinase  48.49 
 
 		 398 aa  352  5e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.954732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  49.63 
 
 		 402 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  46.68 
 
 		 394 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  46.68 
 
 		 394 aa  352  7e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 396 aa  352  8e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  46.68 
 
 		 394 aa  352  8e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  46.43 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  46.43 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  46.68 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  46.43 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  46.46 
 
 		 402 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>