More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0766 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0766  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
396 aa  791    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  62.37 
 
 
400 aa  488  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2596  phosphoglycerate kinase  64.54 
 
 
403 aa  478  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  60.76 
 
 
398 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  59.8 
 
 
395 aa  463  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  60.31 
 
 
396 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  60.35 
 
 
396 aa  462  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  59.75 
 
 
401 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  59.29 
 
 
395 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  59.54 
 
 
400 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  60.15 
 
 
398 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  59.54 
 
 
400 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  57.36 
 
 
398 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  59.29 
 
 
400 aa  455  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  58.59 
 
 
400 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  58.38 
 
 
398 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  57.36 
 
 
396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2604  phosphoglycerate kinase  61.62 
 
 
397 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0451422  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  57.76 
 
 
398 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  57.87 
 
 
398 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  59.85 
 
 
399 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  57.51 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0158  phosphoglycerate kinase  61.17 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  56.6 
 
 
398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  59.29 
 
 
398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0140  phosphoglycerate kinase  54.57 
 
 
400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1318  phosphoglycerate kinase  60.66 
 
 
398 aa  441  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.575519  normal  0.28013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  55.58 
 
 
407 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3538  phosphoglycerate kinase  57.83 
 
 
400 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0221  phosphoglycerate kinase  57.76 
 
 
397 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4044  phosphoglycerate kinase  60.2 
 
 
397 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1152  phosphoglycerate kinase  60.45 
 
 
397 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0520  phosphoglycerate kinase  54.57 
 
 
407 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1965  phosphoglycerate kinase  56.93 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.159546  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1694  phosphoglycerate kinase  58.73 
 
 
396 aa  415  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1097  phosphoglycerate kinase  59.7 
 
 
397 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2106  phosphoglycerate kinase  55.81 
 
 
402 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.811046  normal  0.0646104 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1222  phosphoglycerate kinase  57.65 
 
 
397 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  52.79 
 
 
409 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1918  phosphoglycerate kinase  60.41 
 
 
398 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.253475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2155  phosphoglycerate kinase  59.49 
 
 
393 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 
395 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  50.26 
 
 
400 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  50.26 
 
 
400 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  48.73 
 
 
393 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  51.91 
 
 
402 aa  365  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  49.49 
 
 
393 aa  360  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 
402 aa  359  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  50 
 
 
401 aa  359  5e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  48.09 
 
 
393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  51.15 
 
 
401 aa  356  2.9999999999999997e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  46.97 
 
 
402 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  48.23 
 
 
402 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  48.1 
 
 
393 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  47.59 
 
 
392 aa  353  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  49.24 
 
 
402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  46.21 
 
 
395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  47.73 
 
 
402 aa  352  5e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  45.71 
 
 
394 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 
395 aa  350  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  50.64 
 
 
401 aa  349  4e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  47.73 
 
 
395 aa  349  4e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0449  phosphoglycerate kinase  47.09 
 
 
400 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0576652  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  44.87 
 
 
396 aa  348  7e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  48.1 
 
 
401 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  47.34 
 
 
394 aa  346  4e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.71 
 
 
650 aa  346  5e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  47.85 
 
 
401 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  48.63 
 
 
400 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  45.59 
 
 
393 aa  344  1e-93  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 
401 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  45.69 
 
 
394 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  45.69 
 
 
394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  45.43 
 
 
394 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  45.32 
 
 
399 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  43.72 
 
 
399 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  45.06 
 
 
399 aa  340  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  43.72 
 
 
399 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  45.18 
 
 
394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  45.18 
 
 
394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 
406 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  45.18 
 
 
394 aa  340  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  45.18 
 
 
394 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  45.18 
 
 
394 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  43.97 
 
 
398 aa  338  7e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  44.92 
 
 
394 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  44.67 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  48.85 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1167  phosphoglycerate kinase  42.17 
 
 
398 aa  337  2.9999999999999997e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  45.57 
 
 
394 aa  336  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  45 
 
 
399 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 
394 aa  336  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1617  phosphoglycerate kinase  45.11 
 
 
397 aa  335  9e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0893272  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  47.07 
 
 
398 aa  335  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  44.42 
 
 
394 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.56 
 
 
655 aa  334  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3023  Phosphoglycerate kinase  48.49 
 
 
393 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0922941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  42.89 
 
 
443 aa  334  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>