More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2283 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  77.28 
 
 		 409 aa  651    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 407 aa  830    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  62.28 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  62.78 
 
 		 398 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  62.44 
 
 		 398 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  62.12 
 
 		 400 aa  481  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  62.37 
 
 		 400 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  60.45 
 
 		 398 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  60.71 
 
 		 399 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  61.17 
 
 		 398 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  60.7 
 
 		 398 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  61.87 
 
 		 400 aa  477  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0158  phosphoglycerate kinase  61.81 
 
 		 400 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  59.95 
 
 		 400 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  59.8 
 
 		 395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  59.55 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  59.03 
 
 		 400 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  60.31 
 
 		 395 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  59.55 
 
 		 401 aa  467  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  60.81 
 
 		 398 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  59.3 
 
 		 398 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  60.91 
 
 		 398 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2106  phosphoglycerate kinase  57.58 
 
 		 402 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.811046  normal  0.0646104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  58.52 
 
 		 396 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3538  phosphoglycerate kinase  59.19 
 
 		 400 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  55.98 
 
 		 396 aa  435  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0520  phosphoglycerate kinase  55.1 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1318  phosphoglycerate kinase  57.61 
 
 		 398 aa  430  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.575519  normal  0.28013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0766  phosphoglycerate kinase  55.58 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2596  phosphoglycerate kinase  54.22 
 
 		 403 aa  427  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0221  phosphoglycerate kinase  55.98 
 
 		 397 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2604  phosphoglycerate kinase  58.02 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1965  phosphoglycerate kinase  56.89 
 
 		 395 aa  418  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.159546  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0140  phosphoglycerate kinase  51.28 
 
 		 400 aa  411  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4044  phosphoglycerate kinase  57 
 
 		 397 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1152  phosphoglycerate kinase  57 
 
 		 397 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1097  phosphoglycerate kinase  57.51 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1222  phosphoglycerate kinase  55.01 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0449  phosphoglycerate kinase  51.66 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0576652  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  50.77 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1694  phosphoglycerate kinase  53.27 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2155  phosphoglycerate kinase  54.2 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1918  phosphoglycerate kinase  54.71 
 
 		 398 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.253475 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  49.74 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  50.77 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  48.59 
 
 		 394 aa  365  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  47.31 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 		 393 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  49.5 
 
 		 402 aa  358  7e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 402 aa  356  3.9999999999999996e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  47.1 
 
 		 443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  47.46 
 
 		 400 aa  355  5e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  46 
 
 		 399 aa  355  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  48.47 
 
 		 394 aa  355  1e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  48.34 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 		 394 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  47.44 
 
 		 394 aa  352  8e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.83 
 
 		 650 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  48.22 
 
 		 397 aa  352  8.999999999999999e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  47.87 
 
 		 403 aa  349  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  46.58 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  46.68 
 
 		 389 aa  346  3e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  47.07 
 
 		 393 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  46.17 
 
 		 396 aa  346  5e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  45.82 
 
 		 399 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.29 
 
 		 646 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  47.19 
 
 		 397 aa  344  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  46.15 
 
 		 400 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  45.57 
 
 		 399 aa  344  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  46.15 
 
 		 400 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  46.8 
 
 		 397 aa  342  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  47.92 
 
 		 401 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  46.43 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  46.15 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  45.29 
 
 		 441 aa  340  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  45.9 
 
 		 394 aa  338  8e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  45.9 
 
 		 394 aa  338  8e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  45.94 
 
 		 398 aa  338  8e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  45.64 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  45.64 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.56 
 
 		 655 aa  337  1.9999999999999998e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  43.44 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  46.43 
 
 		 397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03315  phosphoglycerate kinase  43.77 
 
 		 420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1167  phosphoglycerate kinase  43.77 
 
 		 398 aa  336  3.9999999999999995e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  45.38 
 
 		 394 aa  336  5e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  44.27 
 
 		 394 aa  335  5.999999999999999e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  45.38 
 
 		 394 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  45.13 
 
 		 394 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  47.72 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  45.23 
 
 		 398 aa  335  1e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  46.82 
 
 		 397 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  45.38 
 
 		 394 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1979  phosphoglycerate kinase  45.82 
 
 		 399 aa  334  2e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.577028  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  45.13 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  47.96 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  44.62 
 
 		 394 aa  331  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  46.95 
 
 		 393 aa  332  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  46.43 
 
 		 397 aa  331  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  46.94 
 
 		 401 aa  331  2e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>