More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2604 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2604  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 397 aa  789    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1318  phosphoglycerate kinase  77.53 
 
 		 398 aa  593  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.575519  normal  0.28013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1965  phosphoglycerate kinase  76.57 
 
 		 395 aa  573  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.159546  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  65.99 
 
 		 400 aa  518  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  64.9 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  63.13 
 
 		 400 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  64.3 
 
 		 400 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  64.47 
 
 		 396 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  64.3 
 
 		 400 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  62.94 
 
 		 398 aa  491  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  64.56 
 
 		 400 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  63.45 
 
 		 395 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  63.09 
 
 		 401 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  62.94 
 
 		 395 aa  481  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  63.89 
 
 		 398 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  63.13 
 
 		 396 aa  483  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  63.13 
 
 		 398 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3538  phosphoglycerate kinase  62.63 
 
 		 400 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  63.1 
 
 		 398 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  63.54 
 
 		 398 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  61.42 
 
 		 396 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0158  phosphoglycerate kinase  64.14 
 
 		 400 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  62.28 
 
 		 398 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  61.17 
 
 		 398 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0766  phosphoglycerate kinase  61.62 
 
 		 396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  60.91 
 
 		 398 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0520  phosphoglycerate kinase  60.51 
 
 		 407 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  61.68 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4044  phosphoglycerate kinase  64.65 
 
 		 397 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1152  phosphoglycerate kinase  64.65 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1097  phosphoglycerate kinase  64.39 
 
 		 397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0221  phosphoglycerate kinase  61.27 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2596  phosphoglycerate kinase  60.05 
 
 		 403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  58.02 
 
 		 407 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2106  phosphoglycerate kinase  59.45 
 
 		 402 aa  441  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.811046  normal  0.0646104 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  56.49 
 
 		 409 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1222  phosphoglycerate kinase  62.6 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2155  phosphoglycerate kinase  60.2 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1918  phosphoglycerate kinase  60.66 
 
 		 398 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.253475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1694  phosphoglycerate kinase  59.7 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0140  phosphoglycerate kinase  51.65 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  52.02 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  50.5 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0449  phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0576652  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  48.61 
 
 		 395 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  46.6 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  48.5 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  48.06 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  48.06 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 		 394 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  44.72 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 		 393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  43.97 
 
 		 398 aa  355  5e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  44.22 
 
 		 399 aa  354  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  46.25 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  47.25 
 
 		 401 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  43.72 
 
 		 399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  46.25 
 
 		 402 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  43.72 
 
 		 399 aa  352  5e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  47 
 
 		 401 aa  352  7e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  46.33 
 
 		 394 aa  352  8e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  44.75 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.06 
 
 		 650 aa  350  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  45.64 
 
 		 402 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  47.38 
 
 		 401 aa  348  6e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  45.8 
 
 		 393 aa  349  6e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  47 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  47.16 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  46.45 
 
 		 394 aa  346  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  46.19 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  48 
 
 		 401 aa  346  5e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  45.45 
 
 		 399 aa  345  6e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  46.58 
 
 		 393 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  45.45 
 
 		 399 aa  345  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  45.59 
 
 		 402 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  46.91 
 
 		 401 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0879  Phosphoglycerate kinase  44.81 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.436803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  44.81 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  44.56 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  44.81 
 
 		 394 aa  342  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  48.11 
 
 		 402 aa  343  5e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  44.81 
 
 		 394 aa  342  5e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  44.81 
 
 		 394 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  44.56 
 
 		 394 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.62 
 
 		 654 aa  342  7e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  44.81 
 
 		 394 aa  342  8e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  44.56 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  46.37 
 
 		 402 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  48.03 
 
 		 406 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  44.56 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  45.59 
 
 		 402 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0371  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 387 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  44.56 
 
 		 394 aa  341  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5959  phosphoglycerate kinase  48.46 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  44.56 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0838  phosphoglycerate kinase  48.72 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  46.6 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  47.47 
 
 		 389 aa  339  5e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>