More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3241 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3538  phosphoglycerate kinase  95.5 
 
 
400 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3651  phosphoglycerate kinase  81.61 
 
 
400 aa  654    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3241  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
400 aa  802    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  78.59 
 
 
398 aa  630  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2653  phosphoglycerate kinase  79.9 
 
 
399 aa  626  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1671  phosphoglycerate kinase  70.81 
 
 
395 aa  566  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1729  phosphoglycerate kinase  70.05 
 
 
395 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1187  phosphoglycerate kinase  70.75 
 
 
401 aa  560  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.831944  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2368  phosphoglycerate kinase  69.6 
 
 
400 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  69.35 
 
 
400 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2645  Phosphoglycerate kinase  69.6 
 
 
400 aa  548  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.554953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7284  phosphoglycerate kinase  69.02 
 
 
398 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6003  phosphoglycerate kinase  69.1 
 
 
398 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104827  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  68.43 
 
 
398 aa  532  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  68.77 
 
 
396 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4468  phosphoglycerate kinase  68.61 
 
 
398 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4770  phosphoglycerate kinase  69.62 
 
 
398 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4314  phosphoglycerate kinase  68.61 
 
 
398 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  68.69 
 
 
398 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0158  phosphoglycerate kinase  69.35 
 
 
400 aa  528  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1013  phosphoglycerate kinase  69.62 
 
 
398 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1084  phosphoglycerate kinase  66.24 
 
 
396 aa  510  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  62.72 
 
 
396 aa  505  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2106  phosphoglycerate kinase  63.75 
 
 
402 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.811046  normal  0.0646104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0520  phosphoglycerate kinase  63.2 
 
 
407 aa  489  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1318  phosphoglycerate kinase  62.81 
 
 
398 aa  487  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.575519  normal  0.28013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2604  phosphoglycerate kinase  63.13 
 
 
397 aa  485  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0451422  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  59.95 
 
 
407 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3467  phosphoglycerate kinase  59.19 
 
 
409 aa  480  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.546306 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1097  phosphoglycerate kinase  66.08 
 
 
397 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1152  phosphoglycerate kinase  65.32 
 
 
397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4044  phosphoglycerate kinase  65.32 
 
 
397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0221  phosphoglycerate kinase  61.71 
 
 
397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1965  phosphoglycerate kinase  63.29 
 
 
395 aa  470  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.159546  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1222  phosphoglycerate kinase  63.13 
 
 
397 aa  457  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0766  phosphoglycerate kinase  58.59 
 
 
396 aa  451  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0140  phosphoglycerate kinase  54.96 
 
 
400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1694  phosphoglycerate kinase  62.72 
 
 
396 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2596  phosphoglycerate kinase  58.88 
 
 
403 aa  450  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2155  phosphoglycerate kinase  62.47 
 
 
393 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1918  phosphoglycerate kinase  61.96 
 
 
398 aa  428  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.253475 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  53.32 
 
 
392 aa  401  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0449  phosphoglycerate kinase  52.41 
 
 
400 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0576652  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  51.52 
 
 
393 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  50.77 
 
 
393 aa  381  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 
394 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 
396 aa  375  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  48.99 
 
 
395 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 
394 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  48.86 
 
 
397 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 
397 aa  372  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  50.26 
 
 
394 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  50.5 
 
 
395 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 
394 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 
394 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 
394 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 
394 aa  368  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 
394 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 
394 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 
394 aa  368  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.37 
 
 
650 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 
394 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  49.25 
 
 
394 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 
394 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 
400 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 
394 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  48.5 
 
 
399 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  48.14 
 
 
401 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 
400 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 
400 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 
394 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  50.87 
 
 
400 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.11 
 
 
646 aa  363  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  47.83 
 
 
402 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  46.82 
 
 
443 aa  362  7.0000000000000005e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  47.33 
 
 
393 aa  362  8e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  48.45 
 
 
396 aa  362  8e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 
402 aa  362  9e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  48.75 
 
 
403 aa  361  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1167  phosphoglycerate kinase  46.65 
 
 
398 aa  360  2e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  46.58 
 
 
394 aa  360  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  49.63 
 
 
400 aa  359  6e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  46.68 
 
 
393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  47.86 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0677  phosphoglycerate kinase  49.5 
 
 
396 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  48.38 
 
 
402 aa  356  3.9999999999999996e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  48.62 
 
 
401 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  48.77 
 
 
406 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  47.36 
 
 
402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  47.69 
 
 
399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  46.91 
 
 
398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  47.44 
 
 
399 aa  353  4e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  45.8 
 
 
402 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  45.75 
 
 
397 aa  350  3e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  48.21 
 
 
401 aa  347  2e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  45.8 
 
 
402 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  48.09 
 
 
396 aa  346  4e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  46.73 
 
 
398 aa  346  4e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  48.46 
 
 
401 aa  346  5e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  44.42 
 
 
393 aa  345  6e-94  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>