More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0479 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0479  Phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 389 aa  771    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2021  phosphoglycerate kinase  60.26 
 
 		 391 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2806  phosphoglycerate kinase  60.51 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.19528  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0790  phosphoglycerate kinase  59.9 
 
 		 391 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250302  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2891  phosphoglycerate kinase  60.51 
 
 		 392 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0754  phosphoglycerate kinase  59.38 
 
 		 391 aa  461  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.729853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0874  phosphoglycerate kinase  59.13 
 
 		 391 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3538  phosphoglycerate kinase  59.13 
 
 		 391 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0932  phosphoglycerate kinase  59.38 
 
 		 391 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4317  phosphoglycerate kinase  60 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0876  phosphoglycerate kinase  58.61 
 
 		 391 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3657  phosphoglycerate kinase  58.87 
 
 		 391 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2842  phosphoglycerate kinase  60.77 
 
 		 392 aa  455  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0649  phosphoglycerate kinase  58.35 
 
 		 391 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3351  phosphoglycerate kinase  59.13 
 
 		 391 aa  455  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0163277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0716  phosphoglycerate kinase  60.51 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3874  phosphoglycerate kinase  58.72 
 
 		 391 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0878  phosphoglycerate kinase  59.38 
 
 		 391 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1085  phosphoglycerate kinase  58.1 
 
 		 391 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00353094  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3328  phosphoglycerate kinase  58.87 
 
 		 391 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.465511  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0775  phosphoglycerate kinase  58.87 
 
 		 391 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3248  phosphoglycerate kinase  58.87 
 
 		 391 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3463  phosphoglycerate kinase  58.87 
 
 		 391 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2757  phosphoglycerate kinase  58.87 
 
 		 393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05590  phosphoglycerate kinase  59.49 
 
 		 386 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0975  phosphoglycerate kinase  60.77 
 
 		 393 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.182019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02116  phosphoglycerate kinase  59.38 
 
 		 391 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.817646  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3038  phosphoglycerate kinase  59.74 
 
 		 386 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.586189  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0829  phosphoglycerate kinase  58.35 
 
 		 391 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2630  phosphoglycerate kinase  59.49 
 
 		 414 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462751  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2388  Phosphoglycerate kinase  57.69 
 
 		 392 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1041  phosphoglycerate kinase  56.92 
 
 		 394 aa  444  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0246  phosphoglycerate kinase  57.29 
 
 		 393 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000372515  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2027  phosphoglycerate kinase  55.9 
 
 		 481 aa  433  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3216  phosphoglycerate kinase  57.58 
 
 		 391 aa  432  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0460  phosphoglycerate kinase  57.95 
 
 		 386 aa  431  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07190  phosphoglycerate kinase  58.21 
 
 		 387 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0655  phosphoglycerate kinase  58.21 
 
 		 387 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2657  phosphoglycerate kinase  57.87 
 
 		 398 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437017  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0137  phosphoglycerate kinase  56.41 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0670  phosphoglycerate kinase  57.61 
 
 		 398 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5959  phosphoglycerate kinase  57.87 
 
 		 398 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03158  3-phosphoglycerate kinase  55.78 
 
 		 391 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0226  phosphoglycerate kinase  54.36 
 
 		 404 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.846581  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1949  phosphoglycerate kinase  55.9 
 
 		 500 aa  431  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2017  phosphoglycerate kinase  57.61 
 
 		 470 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2628  phosphoglycerate kinase  57.61 
 
 		 398 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4963  phosphoglycerate kinase  57.95 
 
 		 387 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0833  phosphoglycerate kinase  57.36 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1979  phosphoglycerate kinase  54.36 
 
 		 399 aa  427  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.577028  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0037  phosphoglycerate kinase  57.36 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5012  phosphoglycerate kinase  57.95 
 
 		 387 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420454 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295.1  phosphoglycerate kinase  57.36 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266807  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0152  phosphoglycerate kinase  56.67 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0995  phosphoglycerate kinase  57.36 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157349  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4836  phosphoglycerate kinase  57.95 
 
 		 387 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2548  phosphoglycerate kinase  57.87 
 
 		 448 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.142886  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0663  phosphoglycerate kinase  57.61 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.318598  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0503  phosphoglycerate kinase  58.21 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2425  phosphoglycerate kinase  57.36 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2675  phosphoglycerate kinase  57.61 
 
 		 398 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0838  phosphoglycerate kinase  57.36 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0591  phosphoglycerate kinase  57.36 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02757  phosphoglycerate kinase  56.67 
 
 		 387 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0767  Phosphoglycerate kinase  56.67 
 
 		 387 aa  423  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365965  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3411  phosphoglycerate kinase  55.9 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02720  hypothetical protein  56.67 
 
 		 387 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0387  phosphoglycerate kinase  57.69 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0852  phosphoglycerate kinase  55.64 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00852625  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3306  phosphoglycerate kinase  55.9 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0784  phosphoglycerate kinase  56.67 
 
 		 387 aa  423  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356928  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3242  phosphoglycerate kinase  55.9 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3084  phosphoglycerate kinase  56.67 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3063  phosphoglycerate kinase  56.67 
 
 		 387 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.18176  normal  0.182974 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3231  phosphoglycerate kinase  55.9 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3254  phosphoglycerate kinase  56.67 
 
 		 387 aa  423  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.533189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4223  phosphoglycerate kinase  56.67 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0849  phosphoglycerate kinase  55.64 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3351  phosphoglycerate kinase  56.41 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63382  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3309  phosphoglycerate kinase  55.9 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0554  phosphoglycerate kinase  55.64 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3816  phosphoglycerate kinase  55.64 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.795406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3701  phosphoglycerate kinase  55.13 
 
 		 387 aa  421  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3898  phosphoglycerate kinase  54.87 
 
 		 387 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0513  phosphoglycerate kinase  55.38 
 
 		 387 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5265  phosphoglycerate kinase  57.44 
 
 		 387 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0371  phosphoglycerate kinase  58.25 
 
 		 387 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4790  phosphoglycerate kinase  57.18 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0459  phosphoglycerate kinase  58.12 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.307105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0689  phosphoglycerate kinase  57.87 
 
 		 397 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0501  phosphoglycerate kinase  56.49 
 
 		 418 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3277  phosphoglycerate kinase  57.36 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3339  phosphoglycerate kinase  54.87 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.470052 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0556  phosphoglycerate kinase  54.36 
 
 		 387 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.983171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0473  phosphoglycerate kinase  54.57 
 
 		 391 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.565132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0559  phosphoglycerate kinase  56.23 
 
 		 398 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2851  Phosphoglycerate kinase  55.81 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3690  phosphoglycerate kinase  54.43 
 
 		 397 aa  408  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2247  phosphoglycerate kinase  55.5 
 
 		 393 aa  411  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0371  phosphoglycerate kinase  54.45 
 
 		 390 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0527184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>