More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0295.1 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2548  phosphoglycerate kinase  95.72 
 
 
448 aa  759    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.142886  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0571  phosphoglycerate kinase  85.89 
 
 
419 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0670  phosphoglycerate kinase  95.21 
 
 
398 aa  756    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295.1  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
397 aa  789    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266807  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0559  phosphoglycerate kinase  84.89 
 
 
398 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0995  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
442 aa  793    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157349  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5959  phosphoglycerate kinase  95.21 
 
 
398 aa  758    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0663  phosphoglycerate kinase  98.99 
 
 
397 aa  783    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.318598  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0478  phosphoglycerate kinase  86.9 
 
 
403 aa  669    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0689  phosphoglycerate kinase  90.68 
 
 
397 aa  709    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3277  phosphoglycerate kinase  90.68 
 
 
397 aa  711    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0501  phosphoglycerate kinase  84.89 
 
 
418 aa  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0491  phosphoglycerate kinase  86.9 
 
 
403 aa  671    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.29999  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2017  phosphoglycerate kinase  95.47 
 
 
470 aa  759    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0838  phosphoglycerate kinase  99.75 
 
 
397 aa  787    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0037  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
442 aa  793    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2675  phosphoglycerate kinase  95.21 
 
 
398 aa  759    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2628  phosphoglycerate kinase  95.47 
 
 
398 aa  761    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0833  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
442 aa  793    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0459  phosphoglycerate kinase  90.68 
 
 
397 aa  705    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.307105 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2657  phosphoglycerate kinase  95.72 
 
 
398 aa  762    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437017  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0591  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
442 aa  793    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2425  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
397 aa  789    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0828  phosphoglycerate kinase  77.47 
 
 
438 aa  614  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3690  phosphoglycerate kinase  76.46 
 
 
397 aa  608  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0355  phosphoglycerate kinase  75.19 
 
 
397 aa  605  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5101  Phosphoglycerate kinase  77.72 
 
 
410 aa  605  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1817  phosphoglycerate kinase  74.81 
 
 
403 aa  598  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.363039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4635  phosphoglycerate kinase  74.74 
 
 
443 aa  591  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4693  phosphoglycerate kinase  77.22 
 
 
397 aa  591  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.517032  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1532  Phosphoglycerate kinase  74.06 
 
 
403 aa  588  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0289  phosphoglycerate kinase  74.18 
 
 
397 aa  588  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.018111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3874  phosphoglycerate kinase  73.72 
 
 
397 aa  589  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4078  phosphoglycerate kinase  73.74 
 
 
412 aa  586  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3401  phosphoglycerate kinase  77.47 
 
 
397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780201  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4056  phosphoglycerate kinase  76.96 
 
 
397 aa  579  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.352775  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1516  phosphoglycerate kinase  75.7 
 
 
396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0183024  decreased coverage  0.0000800022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1987  phosphoglycerate kinase  72.15 
 
 
400 aa  569  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246493  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3594  phosphoglycerate kinase  72.15 
 
 
393 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000956602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1495  phosphoglycerate kinase  71.07 
 
 
394 aa  549  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669202  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2891  phosphoglycerate kinase  67 
 
 
392 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2851  Phosphoglycerate kinase  68.17 
 
 
401 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222311  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3250  phosphoglycerate kinase  68.17 
 
 
401 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2806  phosphoglycerate kinase  67.44 
 
 
392 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.19528  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0790  phosphoglycerate kinase  67.98 
 
 
391 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2247  phosphoglycerate kinase  66.75 
 
 
393 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0655  phosphoglycerate kinase  67.51 
 
 
387 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02116  phosphoglycerate kinase  66.92 
 
 
391 aa  511  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.817646  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2842  phosphoglycerate kinase  64.97 
 
 
392 aa  512  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07190  phosphoglycerate kinase  67.51 
 
 
387 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2388  Phosphoglycerate kinase  65.49 
 
 
392 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2021  phosphoglycerate kinase  65.65 
 
 
391 aa  508  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1085  phosphoglycerate kinase  66.67 
 
 
391 aa  511  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00353094  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0649  phosphoglycerate kinase  68.29 
 
 
391 aa  510  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2757  phosphoglycerate kinase  67.94 
 
 
393 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05590  phosphoglycerate kinase  67.01 
 
 
386 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3538  phosphoglycerate kinase  68.5 
 
 
391 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0460  phosphoglycerate kinase  67.51 
 
 
386 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0876  phosphoglycerate kinase  66.32 
 
 
391 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236749  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0161  phosphoglycerate kinase  64.8 
 
 
393 aa  503  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.278455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0386  phosphoglycerate kinase  64.56 
 
 
395 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03158  3-phosphoglycerate kinase  66.4 
 
 
391 aa  502  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0754  phosphoglycerate kinase  67.19 
 
 
391 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.729853  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3463  phosphoglycerate kinase  67.98 
 
 
391 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1949  phosphoglycerate kinase  64.56 
 
 
500 aa  498  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0246  phosphoglycerate kinase  64.3 
 
 
393 aa  499  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000372515  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3657  phosphoglycerate kinase  68.24 
 
 
391 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0932  phosphoglycerate kinase  67.45 
 
 
391 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0387  phosphoglycerate kinase  68.02 
 
 
387 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5265  phosphoglycerate kinase  67.77 
 
 
387 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670287  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4317  phosphoglycerate kinase  66.23 
 
 
387 aa  495  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2027  phosphoglycerate kinase  64.56 
 
 
481 aa  497  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0878  phosphoglycerate kinase  66.84 
 
 
391 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0874  phosphoglycerate kinase  66.67 
 
 
391 aa  496  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3216  phosphoglycerate kinase  64.63 
 
 
391 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4790  phosphoglycerate kinase  67.77 
 
 
387 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4963  phosphoglycerate kinase  67.51 
 
 
387 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37087  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3874  phosphoglycerate kinase  64.86 
 
 
391 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0503  phosphoglycerate kinase  67.51 
 
 
387 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5012  phosphoglycerate kinase  67.77 
 
 
387 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.420454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4836  phosphoglycerate kinase  67.77 
 
 
387 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96599  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0775  phosphoglycerate kinase  66.4 
 
 
391 aa  488  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121552  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3248  phosphoglycerate kinase  66.4 
 
 
391 aa  488  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3038  phosphoglycerate kinase  62.85 
 
 
386 aa  488  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.586189  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0407  phosphoglycerate kinase  62.44 
 
 
399 aa  487  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.873778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3328  phosphoglycerate kinase  62.94 
 
 
391 aa  484  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.465511  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3351  phosphoglycerate kinase  66.4 
 
 
391 aa  487  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0163277  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0829  phosphoglycerate kinase  66.67 
 
 
391 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2630  phosphoglycerate kinase  62.78 
 
 
414 aa  478  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462751  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2792  phosphoglycerate kinase  61.1 
 
 
393 aa  480  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.259716  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3023  Phosphoglycerate kinase  62.99 
 
 
393 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0922941  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0371  phosphoglycerate kinase  65.56 
 
 
387 aa  477  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0767  Phosphoglycerate kinase  63.73 
 
 
387 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0784  phosphoglycerate kinase  63.73 
 
 
387 aa  472  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356928  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3351  phosphoglycerate kinase  63.48 
 
 
387 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63382  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3084  phosphoglycerate kinase  63.73 
 
 
387 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3063  phosphoglycerate kinase  63.73 
 
 
387 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.18176  normal  0.182974 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02720  hypothetical protein  63.73 
 
 
387 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3254  phosphoglycerate kinase  63.73 
 
 
387 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.533189  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1041  phosphoglycerate kinase  60.25 
 
 
394 aa  472  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>