More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2027 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2027  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 481 aa  960    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1949  phosphoglycerate kinase  98.75 
 
 		 500 aa  944    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02116  phosphoglycerate kinase  79.69 
 
 		 391 aa  631  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.817646  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3216  phosphoglycerate kinase  80.21 
 
 		 391 aa  630  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2388  Phosphoglycerate kinase  64.62 
 
 		 392 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2891  phosphoglycerate kinase  64.62 
 
 		 392 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0460  phosphoglycerate kinase  64.62 
 
 		 386 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05590  phosphoglycerate kinase  64.87 
 
 		 386 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2842  phosphoglycerate kinase  64.62 
 
 		 392 aa  513  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0655  phosphoglycerate kinase  64.62 
 
 		 387 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0387  phosphoglycerate kinase  65.38 
 
 		 387 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07190  phosphoglycerate kinase  64.1 
 
 		 387 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4963  phosphoglycerate kinase  64.62 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5959  phosphoglycerate kinase  65.23 
 
 		 398 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4836  phosphoglycerate kinase  64.62 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0503  phosphoglycerate kinase  64.62 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0790  phosphoglycerate kinase  62.98 
 
 		 391 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250302  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5012  phosphoglycerate kinase  64.62 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420454 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2657  phosphoglycerate kinase  64.97 
 
 		 398 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0670  phosphoglycerate kinase  64.97 
 
 		 398 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0838  phosphoglycerate kinase  64.56 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4790  phosphoglycerate kinase  64.36 
 
 		 387 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0754  phosphoglycerate kinase  61.7 
 
 		 391 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.729853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4635  phosphoglycerate kinase  61.19 
 
 		 443 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1085  phosphoglycerate kinase  62.47 
 
 		 391 aa  499  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00353094  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2628  phosphoglycerate kinase  65.23 
 
 		 398 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0833  phosphoglycerate kinase  64.72 
 
 		 442 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295.1  phosphoglycerate kinase  64.56 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266807  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0995  phosphoglycerate kinase  64.72 
 
 		 442 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5265  phosphoglycerate kinase  64.36 
 
 		 387 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0663  phosphoglycerate kinase  64.56 
 
 		 397 aa  498  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.318598  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3690  phosphoglycerate kinase  64.05 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2017  phosphoglycerate kinase  65.23 
 
 		 470 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2548  phosphoglycerate kinase  64.56 
 
 		 448 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.142886  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2675  phosphoglycerate kinase  64.72 
 
 		 398 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0591  phosphoglycerate kinase  64.72 
 
 		 442 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0037  phosphoglycerate kinase  64.72 
 
 		 442 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2425  phosphoglycerate kinase  64.56 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0876  phosphoglycerate kinase  61.44 
 
 		 391 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2757  phosphoglycerate kinase  63.75 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03158  3-phosphoglycerate kinase  61.54 
 
 		 391 aa  495  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2021  phosphoglycerate kinase  64.1 
 
 		 391 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3874  phosphoglycerate kinase  62.31 
 
 		 391 aa  492  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0828  phosphoglycerate kinase  63.54 
 
 		 438 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0649  phosphoglycerate kinase  62.47 
 
 		 391 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3038  phosphoglycerate kinase  62.72 
 
 		 386 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.586189  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3657  phosphoglycerate kinase  62.98 
 
 		 391 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3463  phosphoglycerate kinase  62.98 
 
 		 391 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2851  Phosphoglycerate kinase  63.89 
 
 		 401 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3538  phosphoglycerate kinase  62.72 
 
 		 391 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0246  phosphoglycerate kinase  61.86 
 
 		 393 aa  489  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000372515  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3250  phosphoglycerate kinase  63.89 
 
 		 401 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5101  Phosphoglycerate kinase  63.29 
 
 		 410 aa  491  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3328  phosphoglycerate kinase  62.72 
 
 		 391 aa  491  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.465511  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4317  phosphoglycerate kinase  63.08 
 
 		 387 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1987  phosphoglycerate kinase  64.81 
 
 		 400 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3874  phosphoglycerate kinase  63.29 
 
 		 397 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3309  phosphoglycerate kinase  61.79 
 
 		 387 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3411  phosphoglycerate kinase  61.79 
 
 		 387 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2806  phosphoglycerate kinase  61.79 
 
 		 392 aa  487  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.19528  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3306  phosphoglycerate kinase  61.79 
 
 		 387 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3231  phosphoglycerate kinase  61.79 
 
 		 387 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0355  phosphoglycerate kinase  63.8 
 
 		 397 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3242  phosphoglycerate kinase  61.79 
 
 		 387 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0878  phosphoglycerate kinase  61.7 
 
 		 391 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0478  phosphoglycerate kinase  63.61 
 
 		 403 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0459  phosphoglycerate kinase  64.05 
 
 		 397 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.307105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0689  phosphoglycerate kinase  64.3 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0491  phosphoglycerate kinase  63.87 
 
 		 403 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.29999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3339  phosphoglycerate kinase  61.28 
 
 		 387 aa  481  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.470052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02757  phosphoglycerate kinase  61.28 
 
 		 387 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0767  Phosphoglycerate kinase  61.28 
 
 		 387 aa  481  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365965  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0571  phosphoglycerate kinase  64.21 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0932  phosphoglycerate kinase  62.21 
 
 		 391 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3063  phosphoglycerate kinase  61.28 
 
 		 387 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.18176  normal  0.182974 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02720  hypothetical protein  61.28 
 
 		 387 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0784  phosphoglycerate kinase  61.28 
 
 		 387 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356928  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0874  phosphoglycerate kinase  61.95 
 
 		 391 aa  481  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2630  phosphoglycerate kinase  60.91 
 
 		 414 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462751  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4223  phosphoglycerate kinase  61.28 
 
 		 387 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3084  phosphoglycerate kinase  61.03 
 
 		 387 aa  480  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3277  phosphoglycerate kinase  63.29 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4078  phosphoglycerate kinase  63.27 
 
 		 412 aa  478  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3254  phosphoglycerate kinase  61.28 
 
 		 387 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.533189  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1041  phosphoglycerate kinase  59.74 
 
 		 394 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3351  phosphoglycerate kinase  61.03 
 
 		 387 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3898  phosphoglycerate kinase  61.28 
 
 		 387 aa  478  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0152  phosphoglycerate kinase  61.54 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3701  phosphoglycerate kinase  61.28 
 
 		 387 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0849  phosphoglycerate kinase  61.03 
 
 		 387 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3816  phosphoglycerate kinase  61.03 
 
 		 387 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.795406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0289  phosphoglycerate kinase  62.53 
 
 		 397 aa  477  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.018111 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0371  phosphoglycerate kinase  64.71 
 
 		 387 aa  476  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0775  phosphoglycerate kinase  61.7 
 
 		 391 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3248  phosphoglycerate kinase  61.7 
 
 		 391 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3351  phosphoglycerate kinase  61.7 
 
 		 391 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0163277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0852  phosphoglycerate kinase  61.03 
 
 		 387 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00852625  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0137  phosphoglycerate kinase  61.28 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0829  phosphoglycerate kinase  62.47 
 
 		 391 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0554  phosphoglycerate kinase  61.03 
 
 		 387 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>