More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3250 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2851  Phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 401 aa  799    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3250  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 401 aa  799    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2891  phosphoglycerate kinase  70.1 
 
 		 392 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2388  Phosphoglycerate kinase  68.84 
 
 		 392 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2842  phosphoglycerate kinase  66.92 
 
 		 392 aa  538  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295.1  phosphoglycerate kinase  68.17 
 
 		 397 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266807  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0995  phosphoglycerate kinase  68.17 
 
 		 442 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157349  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0246  phosphoglycerate kinase  67.42 
 
 		 393 aa  533  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000372515  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2425  phosphoglycerate kinase  68.17 
 
 		 397 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0833  phosphoglycerate kinase  68.17 
 
 		 442 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0037  phosphoglycerate kinase  68.17 
 
 		 442 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0591  phosphoglycerate kinase  68.17 
 
 		 442 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2806  phosphoglycerate kinase  66.67 
 
 		 392 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.19528  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5959  phosphoglycerate kinase  68.17 
 
 		 398 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2657  phosphoglycerate kinase  68.17 
 
 		 398 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03158  3-phosphoglycerate kinase  65.99 
 
 		 391 aa  528  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0670  phosphoglycerate kinase  68.17 
 
 		 398 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0663  phosphoglycerate kinase  67.92 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.318598  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1085  phosphoglycerate kinase  67.34 
 
 		 391 aa  528  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00353094  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2548  phosphoglycerate kinase  68.42 
 
 		 448 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.142886  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0838  phosphoglycerate kinase  67.92 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0790  phosphoglycerate kinase  66.5 
 
 		 391 aa  529  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250302  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2675  phosphoglycerate kinase  68.42 
 
 		 398 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2628  phosphoglycerate kinase  67.92 
 
 		 398 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2017  phosphoglycerate kinase  69.43 
 
 		 470 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3328  phosphoglycerate kinase  65.32 
 
 		 391 aa  525  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.465511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0754  phosphoglycerate kinase  65.99 
 
 		 391 aa  525  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.729853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0828  phosphoglycerate kinase  64.93 
 
 		 438 aa  521  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2630  phosphoglycerate kinase  66.75 
 
 		 414 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0876  phosphoglycerate kinase  65.74 
 
 		 391 aa  523  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4317  phosphoglycerate kinase  65.74 
 
 		 387 aa  521  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0649  phosphoglycerate kinase  66.58 
 
 		 391 aa  521  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3216  phosphoglycerate kinase  67.34 
 
 		 391 aa  518  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0459  phosphoglycerate kinase  68.42 
 
 		 397 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.307105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2757  phosphoglycerate kinase  67.09 
 
 		 393 aa  521  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3874  phosphoglycerate kinase  66.25 
 
 		 391 aa  517  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3038  phosphoglycerate kinase  63.8 
 
 		 386 aa  515  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.586189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5101  Phosphoglycerate kinase  66.42 
 
 		 410 aa  512  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3690  phosphoglycerate kinase  64.43 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0689  phosphoglycerate kinase  67.33 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3277  phosphoglycerate kinase  67.83 
 
 		 397 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02116  phosphoglycerate kinase  64.99 
 
 		 391 aa  512  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.817646  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2021  phosphoglycerate kinase  65.91 
 
 		 391 aa  510  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0932  phosphoglycerate kinase  65.32 
 
 		 391 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3538  phosphoglycerate kinase  64.56 
 
 		 391 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0478  phosphoglycerate kinase  68 
 
 		 403 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0874  phosphoglycerate kinase  64.81 
 
 		 391 aa  511  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0491  phosphoglycerate kinase  67 
 
 		 403 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.29999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0775  phosphoglycerate kinase  65.06 
 
 		 391 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3657  phosphoglycerate kinase  64.81 
 
 		 391 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3463  phosphoglycerate kinase  65.06 
 
 		 391 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0571  phosphoglycerate kinase  67.5 
 
 		 419 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0878  phosphoglycerate kinase  65.24 
 
 		 391 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3248  phosphoglycerate kinase  64.81 
 
 		 391 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3084  phosphoglycerate kinase  64.99 
 
 		 387 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3351  phosphoglycerate kinase  64.81 
 
 		 391 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0163277  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02757  phosphoglycerate kinase  64.99 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0767  Phosphoglycerate kinase  64.99 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365965  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3306  phosphoglycerate kinase  64.74 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1041  phosphoglycerate kinase  63.38 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3701  phosphoglycerate kinase  64.48 
 
 		 387 aa  501  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4223  phosphoglycerate kinase  64.99 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3231  phosphoglycerate kinase  64.74 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3351  phosphoglycerate kinase  64.74 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63382  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0554  phosphoglycerate kinase  65.24 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3254  phosphoglycerate kinase  64.99 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.533189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0784  phosphoglycerate kinase  64.99 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356928  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3339  phosphoglycerate kinase  64.48 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.470052 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3411  phosphoglycerate kinase  64.74 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02720  hypothetical protein  64.99 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3242  phosphoglycerate kinase  64.74 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3063  phosphoglycerate kinase  64.99 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.18176  normal  0.182974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3309  phosphoglycerate kinase  64.74 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0460  phosphoglycerate kinase  64.48 
 
 		 386 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0655  phosphoglycerate kinase  64.32 
 
 		 387 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2027  phosphoglycerate kinase  63.89 
 
 		 481 aa  501  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0513  phosphoglycerate kinase  64.74 
 
 		 387 aa  498  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1949  phosphoglycerate kinase  63.64 
 
 		 500 aa  499  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0852  phosphoglycerate kinase  63.48 
 
 		 387 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00852625  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0849  phosphoglycerate kinase  63.48 
 
 		 387 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05590  phosphoglycerate kinase  63.98 
 
 		 386 aa  498  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4635  phosphoglycerate kinase  63.68 
 
 		 443 aa  500  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3816  phosphoglycerate kinase  63.48 
 
 		 387 aa  501  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.795406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0355  phosphoglycerate kinase  62.94 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1987  phosphoglycerate kinase  63.84 
 
 		 400 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3874  phosphoglycerate kinase  61.44 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3898  phosphoglycerate kinase  63.98 
 
 		 387 aa  495  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0407  phosphoglycerate kinase  61.5 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.873778  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0829  phosphoglycerate kinase  64.81 
 
 		 391 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07190  phosphoglycerate kinase  63.57 
 
 		 387 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4693  phosphoglycerate kinase  64.43 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.517032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1495  phosphoglycerate kinase  62.72 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3594  phosphoglycerate kinase  61.87 
 
 		 393 aa  494  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000956602 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0556  phosphoglycerate kinase  62.72 
 
 		 387 aa  492  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.983171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0501  phosphoglycerate kinase  64.09 
 
 		 418 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4078  phosphoglycerate kinase  63.32 
 
 		 412 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2247  phosphoglycerate kinase  62.31 
 
 		 393 aa  491  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0371  phosphoglycerate kinase  65.74 
 
 		 387 aa  490  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0289  phosphoglycerate kinase  62.44 
 
 		 397 aa  491  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.018111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0473  phosphoglycerate kinase  62.69 
 
 		 391 aa  486  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.565132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>