More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3351 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02757  phosphoglycerate kinase  99.74 
 
 		 387 aa  775    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0767  Phosphoglycerate kinase  99.74 
 
 		 387 aa  775    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365965  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3306  phosphoglycerate kinase  97.67 
 
 		 387 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02720  hypothetical protein  99.74 
 
 		 387 aa  775    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3898  phosphoglycerate kinase  89.15 
 
 		 387 aa  707    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3254  phosphoglycerate kinase  99.74 
 
 		 387 aa  775    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.533189  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3339  phosphoglycerate kinase  95.09 
 
 		 387 aa  745    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.470052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4223  phosphoglycerate kinase  99.48 
 
 		 387 aa  772    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3351  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 387 aa  776    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0849  phosphoglycerate kinase  88.37 
 
 		 387 aa  698    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3945  phosphoglycerate kinase  83.46 
 
 		 386 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.869162 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3411  phosphoglycerate kinase  97.67 
 
 		 387 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0513  phosphoglycerate kinase  89.41 
 
 		 387 aa  706    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3701  phosphoglycerate kinase  88.89 
 
 		 387 aa  703    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0554  phosphoglycerate kinase  88.89 
 
 		 387 aa  702    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3309  phosphoglycerate kinase  97.67 
 
 		 387 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0784  phosphoglycerate kinase  99.74 
 
 		 387 aa  775    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356928  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3816  phosphoglycerate kinase  88.37 
 
 		 387 aa  698    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.795406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3242  phosphoglycerate kinase  97.67 
 
 		 387 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3063  phosphoglycerate kinase  99.74 
 
 		 387 aa  775    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.18176  normal  0.182974 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3084  phosphoglycerate kinase  99.48 
 
 		 387 aa  773    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0852  phosphoglycerate kinase  88.37 
 
 		 387 aa  698    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00852625  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3231  phosphoglycerate kinase  97.67 
 
 		 387 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0207  phosphoglycerate kinase  80.42 
 
 		 384 aa  612  9.999999999999999e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0556  phosphoglycerate kinase  77.98 
 
 		 387 aa  606  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.983171  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0030  phosphoglycerate kinase  78.5 
 
 		 392 aa  604  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0377211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002472  phosphoglycerate kinase  77.98 
 
 		 386 aa  599  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03565  phosphoglycerate kinase  76.94 
 
 		 386 aa  596  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2891  phosphoglycerate kinase  74.17 
 
 		 392 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3874  phosphoglycerate kinase  73.66 
 
 		 391 aa  577  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0371  phosphoglycerate kinase  74.48 
 
 		 390 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0527184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0754  phosphoglycerate kinase  72.89 
 
 		 391 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.729853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3328  phosphoglycerate kinase  74.81 
 
 		 391 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.465511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2757  phosphoglycerate kinase  75.51 
 
 		 393 aa  568  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1085  phosphoglycerate kinase  73.26 
 
 		 391 aa  565  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00353094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0876  phosphoglycerate kinase  72.38 
 
 		 391 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0790  phosphoglycerate kinase  71.87 
 
 		 391 aa  565  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250302  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0874  phosphoglycerate kinase  74.04 
 
 		 391 aa  559  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3657  phosphoglycerate kinase  74.04 
 
 		 391 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0878  phosphoglycerate kinase  73.66 
 
 		 391 aa  561  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2388  Phosphoglycerate kinase  71.61 
 
 		 392 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3463  phosphoglycerate kinase  74.29 
 
 		 391 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0932  phosphoglycerate kinase  73.78 
 
 		 391 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03158  3-phosphoglycerate kinase  71.1 
 
 		 391 aa  556  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3538  phosphoglycerate kinase  73.78 
 
 		 391 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3351  phosphoglycerate kinase  73.26 
 
 		 391 aa  551  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0163277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0246  phosphoglycerate kinase  72.01 
 
 		 393 aa  548  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000372515  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0775  phosphoglycerate kinase  73.01 
 
 		 391 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3248  phosphoglycerate kinase  73.01 
 
 		 391 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0649  phosphoglycerate kinase  73.01 
 
 		 391 aa  550  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0655  phosphoglycerate kinase  70.47 
 
 		 387 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07190  phosphoglycerate kinase  70.73 
 
 		 387 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3038  phosphoglycerate kinase  70.05 
 
 		 386 aa  549  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.586189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0460  phosphoglycerate kinase  71.5 
 
 		 386 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05590  phosphoglycerate kinase  69.69 
 
 		 386 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0829  phosphoglycerate kinase  73.78 
 
 		 391 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5012  phosphoglycerate kinase  72.28 
 
 		 387 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4836  phosphoglycerate kinase  72.28 
 
 		 387 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4963  phosphoglycerate kinase  72.02 
 
 		 387 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0503  phosphoglycerate kinase  71.5 
 
 		 387 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0645  phosphoglycerate kinase  67.96 
 
 		 387 aa  540  9.999999999999999e-153  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.27792  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4317  phosphoglycerate kinase  70.21 
 
 		 387 aa  537  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2021  phosphoglycerate kinase  68.72 
 
 		 391 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0473  phosphoglycerate kinase  68.46 
 
 		 391 aa  532  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.565132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0387  phosphoglycerate kinase  69.95 
 
 		 387 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5265  phosphoglycerate kinase  70.73 
 
 		 387 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4790  phosphoglycerate kinase  69.95 
 
 		 387 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2806  phosphoglycerate kinase  66.07 
 
 		 392 aa  527  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.19528  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0371  phosphoglycerate kinase  69.77 
 
 		 387 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2842  phosphoglycerate kinase  66.67 
 
 		 392 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0161  phosphoglycerate kinase  66.07 
 
 		 393 aa  501  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.278455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0386  phosphoglycerate kinase  65.47 
 
 		 395 aa  502  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2247  phosphoglycerate kinase  65.82 
 
 		 393 aa  504  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0975  phosphoglycerate kinase  65.82 
 
 		 393 aa  501  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.182019 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0152  phosphoglycerate kinase  62.66 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0137  phosphoglycerate kinase  62.4 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0407  phosphoglycerate kinase  65.9 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.873778  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2851  Phosphoglycerate kinase  64.74 
 
 		 401 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2630  phosphoglycerate kinase  64.96 
 
 		 414 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462751  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3250  phosphoglycerate kinase  64.74 
 
 		 401 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0716  phosphoglycerate kinase  63.01 
 
 		 393 aa  494  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3216  phosphoglycerate kinase  64.01 
 
 		 391 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02116  phosphoglycerate kinase  62.4 
 
 		 391 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.817646  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1949  phosphoglycerate kinase  61.03 
 
 		 500 aa  482  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2027  phosphoglycerate kinase  61.03 
 
 		 481 aa  481  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3594  phosphoglycerate kinase  62.5 
 
 		 393 aa  480  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000956602 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1041  phosphoglycerate kinase  61.28 
 
 		 394 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0670  phosphoglycerate kinase  63.73 
 
 		 398 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0478  phosphoglycerate kinase  63.96 
 
 		 403 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2425  phosphoglycerate kinase  63.48 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295.1  phosphoglycerate kinase  63.48 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266807  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0706  phosphoglycerate kinase  61.46 
 
 		 400 aa  471  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0995  phosphoglycerate kinase  63.48 
 
 		 442 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157349  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2548  phosphoglycerate kinase  63.73 
 
 		 448 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.142886  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0663  phosphoglycerate kinase  63.48 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.318598  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0037  phosphoglycerate kinase  63.48 
 
 		 442 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2675  phosphoglycerate kinase  63.73 
 
 		 398 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0591  phosphoglycerate kinase  63.48 
 
 		 442 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2628  phosphoglycerate kinase  63.22 
 
 		 398 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0838  phosphoglycerate kinase  63.48 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>