More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0716 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0716  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 393 aa  777    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0975  phosphoglycerate kinase  83.93 
 
 		 393 aa  620  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.182019 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2891  phosphoglycerate kinase  70.26 
 
 		 392 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2630  phosphoglycerate kinase  72.31 
 
 		 414 aa  547  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462751  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2388  Phosphoglycerate kinase  67.44 
 
 		 392 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2806  phosphoglycerate kinase  66.58 
 
 		 392 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.19528  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2842  phosphoglycerate kinase  68.29 
 
 		 392 aa  535  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2021  phosphoglycerate kinase  67.18 
 
 		 391 aa  525  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3874  phosphoglycerate kinase  64.62 
 
 		 391 aa  522  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0246  phosphoglycerate kinase  63.61 
 
 		 393 aa  511  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000372515  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0790  phosphoglycerate kinase  62.47 
 
 		 391 aa  511  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250302  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0876  phosphoglycerate kinase  64.78 
 
 		 391 aa  514  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03158  3-phosphoglycerate kinase  63.5 
 
 		 391 aa  513  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0754  phosphoglycerate kinase  63.24 
 
 		 391 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.729853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1085  phosphoglycerate kinase  62.92 
 
 		 391 aa  509  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00353094  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3328  phosphoglycerate kinase  62.66 
 
 		 391 aa  510  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.465511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2757  phosphoglycerate kinase  64.63 
 
 		 393 aa  510  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3038  phosphoglycerate kinase  64.52 
 
 		 386 aa  511  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.586189  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3411  phosphoglycerate kinase  63.01 
 
 		 387 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0878  phosphoglycerate kinase  65.3 
 
 		 391 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3231  phosphoglycerate kinase  63.01 
 
 		 387 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3242  phosphoglycerate kinase  63.01 
 
 		 387 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3306  phosphoglycerate kinase  63.01 
 
 		 387 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3351  phosphoglycerate kinase  63.01 
 
 		 387 aa  504  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63382  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3309  phosphoglycerate kinase  63.01 
 
 		 387 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0655  phosphoglycerate kinase  64.36 
 
 		 387 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3084  phosphoglycerate kinase  63.01 
 
 		 387 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07190  phosphoglycerate kinase  64.1 
 
 		 387 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4317  phosphoglycerate kinase  63.33 
 
 		 387 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02757  phosphoglycerate kinase  63.01 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0767  Phosphoglycerate kinase  63.01 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365965  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3463  phosphoglycerate kinase  63.68 
 
 		 391 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3063  phosphoglycerate kinase  63.01 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.18176  normal  0.182974 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0784  phosphoglycerate kinase  63.01 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356928  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02720  hypothetical protein  63.01 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05590  phosphoglycerate kinase  64.1 
 
 		 386 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3254  phosphoglycerate kinase  63.01 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.533189  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0649  phosphoglycerate kinase  63.17 
 
 		 391 aa  504  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3538  phosphoglycerate kinase  63.68 
 
 		 391 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4223  phosphoglycerate kinase  63.01 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0932  phosphoglycerate kinase  63.43 
 
 		 391 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0874  phosphoglycerate kinase  62.66 
 
 		 391 aa  498  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3657  phosphoglycerate kinase  63.68 
 
 		 391 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0503  phosphoglycerate kinase  64.87 
 
 		 387 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0460  phosphoglycerate kinase  63.59 
 
 		 386 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3248  phosphoglycerate kinase  62.92 
 
 		 391 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3339  phosphoglycerate kinase  60.71 
 
 		 387 aa  491  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.470052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1041  phosphoglycerate kinase  63.68 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0775  phosphoglycerate kinase  62.66 
 
 		 391 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3351  phosphoglycerate kinase  62.92 
 
 		 391 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0163277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4963  phosphoglycerate kinase  64.36 
 
 		 387 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37087  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0387  phosphoglycerate kinase  63.59 
 
 		 387 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5012  phosphoglycerate kinase  64.36 
 
 		 387 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0513  phosphoglycerate kinase  61.22 
 
 		 387 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4836  phosphoglycerate kinase  64.36 
 
 		 387 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3701  phosphoglycerate kinase  60.71 
 
 		 387 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3216  phosphoglycerate kinase  62.4 
 
 		 391 aa  489  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0554  phosphoglycerate kinase  61.22 
 
 		 387 aa  491  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3898  phosphoglycerate kinase  60.46 
 
 		 387 aa  488  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0829  phosphoglycerate kinase  63.5 
 
 		 391 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4790  phosphoglycerate kinase  63.33 
 
 		 387 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02116  phosphoglycerate kinase  61.44 
 
 		 391 aa  481  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.817646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5265  phosphoglycerate kinase  63.33 
 
 		 387 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0152  phosphoglycerate kinase  59.69 
 
 		 396 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0137  phosphoglycerate kinase  59.18 
 
 		 396 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0849  phosphoglycerate kinase  59.95 
 
 		 387 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3816  phosphoglycerate kinase  59.95 
 
 		 387 aa  481  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.795406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0371  phosphoglycerate kinase  64.43 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0030  phosphoglycerate kinase  60.26 
 
 		 392 aa  478  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0377211  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0852  phosphoglycerate kinase  59.95 
 
 		 387 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00852625  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0556  phosphoglycerate kinase  59.49 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.983171  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2851  Phosphoglycerate kinase  61.87 
 
 		 401 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3250  phosphoglycerate kinase  61.87 
 
 		 401 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002472  phosphoglycerate kinase  59.23 
 
 		 386 aa  471  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3945  phosphoglycerate kinase  59.18 
 
 		 386 aa  472  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.869162 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0407  phosphoglycerate kinase  58.12 
 
 		 399 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.873778  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0386  phosphoglycerate kinase  57.61 
 
 		 395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03565  phosphoglycerate kinase  59.23 
 
 		 386 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0479  Phosphoglycerate kinase  60.51 
 
 		 389 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0828  phosphoglycerate kinase  60.25 
 
 		 438 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0478  phosphoglycerate kinase  60.81 
 
 		 403 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2247  phosphoglycerate kinase  58.06 
 
 		 393 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0670  phosphoglycerate kinase  60 
 
 		 398 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0371  phosphoglycerate kinase  58.52 
 
 		 390 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0527184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1949  phosphoglycerate kinase  60 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0226  phosphoglycerate kinase  55.87 
 
 		 404 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.846581  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1979  phosphoglycerate kinase  55.61 
 
 		 399 aa  461  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.577028  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0491  phosphoglycerate kinase  60.05 
 
 		 403 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.29999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0663  phosphoglycerate kinase  59.64 
 
 		 397 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.318598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3874  phosphoglycerate kinase  59.09 
 
 		 397 aa  461  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4078  phosphoglycerate kinase  60.71 
 
 		 412 aa  463  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0571  phosphoglycerate kinase  60.56 
 
 		 419 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5101  Phosphoglycerate kinase  59.6 
 
 		 410 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0995  phosphoglycerate kinase  59.64 
 
 		 442 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0037  phosphoglycerate kinase  59.64 
 
 		 442 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0838  phosphoglycerate kinase  59.39 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0833  phosphoglycerate kinase  59.64 
 
 		 442 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0591  phosphoglycerate kinase  59.64 
 
 		 442 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2425  phosphoglycerate kinase  59.64 
 
 		 397 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2628  phosphoglycerate kinase  58.99 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>