More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3248 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3248  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  802    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3911  HI0933 family protein  60.15 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2553  HI0933-like protein  58.75 
 
 		 409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  58.63 
 
 		 410 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3585  hypothetical protein  57.29 
 
 		 395 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2251  HI0933-like protein  58.5 
 
 		 414 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294962  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0839  HI0933 family protein  60.4 
 
 		 407 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.612434  normal  0.0181973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2481  HI0933 family protein  56.25 
 
 		 411 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0212712  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3087  HI0933-like protein  57.22 
 
 		 409 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2154  hypothetical protein  57 
 
 		 408 aa  411  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0879  hypothetical protein  59.55 
 
 		 407 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4371  hypothetical protein  57.5 
 
 		 404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4913  HI0933 family protein  57.29 
 
 		 419 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0805  HI0933 family protein  58.57 
 
 		 414 aa  375  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.0281532 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0455  HI0933 family protein  52.35 
 
 		 432 aa  362  6e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0593  HI0933 family protein  50 
 
 		 416 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568345  hitchhiker  0.000690115 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3158  putative transmembrane protein  49.15 
 
 		 425 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0087  hypothetical protein  51.88 
 
 		 413 aa  359  5e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2010  hypothetical protein  56.62 
 
 		 405 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170272 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3600  HI0933 family protein  49.01 
 
 		 422 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.777632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4431  hypothetical protein  50.77 
 
 		 409 aa  354  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803445  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2187  hypothetical protein  47.47 
 
 		 458 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4677  HI0933 family protein  49.01 
 
 		 422 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3007  hypothetical protein  49.63 
 
 		 402 aa  353  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3538  HI0933 family protein  48.72 
 
 		 421 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1928  hypothetical protein  52.03 
 
 		 429 aa  353  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744933  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2266  HI0933-like protein  46.15 
 
 		 468 aa  352  5e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1005  hypothetical protein  46.94 
 
 		 402 aa  352  5e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1738  putative transmembrane protein  50.5 
 
 		 429 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4321  hypothetical protein  49.5 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1040  hypothetical protein  46.94 
 
 		 402 aa  350  3e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2326  HI0933 family protein  51.44 
 
 		 412 aa  349  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2737  hypothetical protein  45.91 
 
 		 422 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3798  HI0933 family protein  49.23 
 
 		 402 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3503  HI0933 family protein  50.77 
 
 		 416 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0453  hypothetical protein  48.48 
 
 		 406 aa  344  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.881492 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3818  hypothetical protein  48.99 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2458  hypothetical protein  47.5 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2642  hypothetical protein  46.7 
 
 		 482 aa  342  8e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148126  normal  0.0148984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1520  hypothetical protein  48.25 
 
 		 411 aa  341  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1785  hypothetical protein  52.3 
 
 		 419 aa  341  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.928092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0420  putative transmembrane protein, NAD(FAD)-binding  47.83 
 
 		 430 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4919  hypothetical protein  47.88 
 
 		 425 aa  338  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0364  hypothetical protein  44.72 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113097  normal  0.426406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  45.66 
 
 		 406 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4296  hypothetical protein  48.37 
 
 		 424 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5009  putative flavoprotein oxidoreductase  46.77 
 
 		 421 aa  335  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.35364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1505  HI0933 family protein  47.03 
 
 		 447 aa  331  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2353  hypothetical protein  47.03 
 
 		 447 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2895  HI0933-like protein  43.38 
 
 		 452 aa  329  6e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01510  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  45.25 
 
 		 420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4663  hypothetical protein  47.37 
 
 		 412 aa  325  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  44.96 
 
 		 458 aa  323  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10020  HI0933-like protein  49.25 
 
 		 410 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12770  hypothetical protein  47.12 
 
 		 391 aa  318  9e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4640  hypothetical protein  46.12 
 
 		 412 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626559  hitchhiker  0.00685408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4765  hypothetical protein  45.86 
 
 		 412 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0079112  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0655  hypothetical protein  46.4 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000115775  normal  0.464819 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  48.34 
 
 		 392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4778  hypothetical protein  46.37 
 
 		 413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  48.34 
 
 		 392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0053  HI0933 family protein  48.72 
 
 		 406 aa  309  4e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000927745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0041  HI0933-like protein  46.52 
 
 		 399 aa  308  8e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.32138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0628  flavoprotein  41.09 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0929211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0407  HI0933-like protein  46.55 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1159  hypothetical protein  46.12 
 
 		 491 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1434  HI0933 family protein  45.15 
 
 		 415 aa  295  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  47.06 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3724  hypothetical protein  45.66 
 
 		 413 aa  290  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2768  hypothetical protein  45.66 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1089  hypothetical protein  46.04 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  31.81 
 
 		 419 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  31.11 
 
 		 408 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  31.33 
 
 		 430 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  28.35 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  31.01 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  31.66 
 
 		 433 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  30.23 
 
 		 412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  27.06 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  30.36 
 
 		 435 aa  126  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  30.29 
 
 		 435 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  30.26 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  28.97 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  29.11 
 
 		 426 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  27.43 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  25.71 
 
 		 403 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  25 
 
 		 446 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  25.58 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  29.19 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  28.61 
 
 		 426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  29.85 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  26.38 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  28.68 
 
 		 423 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  27.99 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  28.17 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  27.06 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  27.99 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  26.8 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  28.93 
 
 		 415 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>