More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1738 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1738  putative transmembrane protein  100 
 
 		 429 aa  842    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3600  HI0933 family protein  64.73 
 
 		 422 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.777632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2458  hypothetical protein  65.86 
 
 		 424 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4677  HI0933 family protein  64.73 
 
 		 422 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3158  putative transmembrane protein  63.42 
 
 		 425 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1785  hypothetical protein  69.76 
 
 		 419 aa  514  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.928092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4919  hypothetical protein  64.36 
 
 		 425 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5009  putative flavoprotein oxidoreductase  64.94 
 
 		 421 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.35364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2266  HI0933-like protein  57.48 
 
 		 468 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2737  hypothetical protein  63.02 
 
 		 422 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2187  hypothetical protein  60.36 
 
 		 458 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2326  HI0933 family protein  65.3 
 
 		 412 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4663  hypothetical protein  61.98 
 
 		 412 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3538  HI0933 family protein  61.62 
 
 		 421 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12770  hypothetical protein  64.29 
 
 		 391 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4296  hypothetical protein  61.23 
 
 		 424 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0420  putative transmembrane protein, NAD(FAD)-binding  61.71 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0655  hypothetical protein  61.45 
 
 		 424 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000115775  normal  0.464819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4765  hypothetical protein  60.44 
 
 		 412 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0079112  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10020  HI0933-like protein  65.36 
 
 		 410 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148718  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3007  hypothetical protein  62.07 
 
 		 402 aa  480  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2642  hypothetical protein  59.28 
 
 		 482 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148126  normal  0.0148984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  58.33 
 
 		 458 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4640  hypothetical protein  60.58 
 
 		 412 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626559  hitchhiker  0.00685408 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2895  HI0933-like protein  57.05 
 
 		 452 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4778  hypothetical protein  60.19 
 
 		 413 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1159  hypothetical protein  62.08 
 
 		 491 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0455  HI0933 family protein  63.81 
 
 		 432 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2353  hypothetical protein  59.86 
 
 		 447 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1505  HI0933 family protein  60.09 
 
 		 447 aa  464  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0087  hypothetical protein  59.75 
 
 		 413 aa  455  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3724  hypothetical protein  63.57 
 
 		 413 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1005  hypothetical protein  51.47 
 
 		 402 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1040  hypothetical protein  51.72 
 
 		 402 aa  411  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0364  hypothetical protein  50.86 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113097  normal  0.426406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2553  HI0933-like protein  54.52 
 
 		 409 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01510  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  53.45 
 
 		 420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1434  HI0933 family protein  54.68 
 
 		 415 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3818  hypothetical protein  54.21 
 
 		 404 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2154  hypothetical protein  55.77 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1520  hypothetical protein  53.06 
 
 		 411 aa  401  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  51.38 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2481  HI0933 family protein  51.84 
 
 		 411 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0212712  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  53.55 
 
 		 410 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3585  hypothetical protein  54.04 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3087  HI0933-like protein  53.4 
 
 		 409 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1089  hypothetical protein  55.13 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0839  HI0933 family protein  52.36 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.612434  normal  0.0181973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4321  hypothetical protein  51.15 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3503  HI0933 family protein  51.98 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849047 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3798  HI0933 family protein  50.99 
 
 		 402 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2251  HI0933-like protein  50.62 
 
 		 414 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294962  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0879  hypothetical protein  52.36 
 
 		 407 aa  365  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4431  hypothetical protein  49.51 
 
 		 409 aa  361  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803445  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3248  hypothetical protein  50.62 
 
 		 402 aa  359  5e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3911  HI0933 family protein  49.04 
 
 		 428 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4913  HI0933 family protein  52.35 
 
 		 419 aa  349  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4371  hypothetical protein  51.96 
 
 		 404 aa  345  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0593  HI0933 family protein  51.52 
 
 		 416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568345  hitchhiker  0.000690115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0453  hypothetical protein  48.64 
 
 		 406 aa  343  4e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.881492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1928  hypothetical protein  52.23 
 
 		 429 aa  342  9e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744933  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  49.37 
 
 		 392 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  49.37 
 
 		 392 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0041  HI0933-like protein  48.39 
 
 		 399 aa  326  6e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.32138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0805  HI0933 family protein  51.21 
 
 		 414 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.0281532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0053  HI0933 family protein  50.36 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000927745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2010  hypothetical protein  52.85 
 
 		 405 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0407  HI0933-like protein  44.96 
 
 		 397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  48.25 
 
 		 402 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2768  hypothetical protein  47.3 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0628  flavoprotein  35.88 
 
 		 398 aa  262  8e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0929211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  29.95 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  28.6 
 
 		 414 aa  126  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  28.71 
 
 		 412 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  23.8 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  28.57 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 409 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  28.75 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  27.67 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  23.08 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  27.47 
 
 		 419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  24.11 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  28.89 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  25.63 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.86 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  29.13 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  24.33 
 
 		 424 aa  106  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  25.6 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  25.48 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  26.87 
 
 		 408 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  25.29 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  28.47 
 
 		 457 aa  103  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  27 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  25.3 
 
 		 435 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  26.76 
 
 		 436 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  26.01 
 
 		 435 aa  98.2  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  26.67 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  26.01 
 
 		 435 aa  97.4  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  22.64 
 
 		 406 aa  97.4  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  22.64 
 
 		 406 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>