298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3724 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3724  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  819    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4296  hypothetical protein  70.73 
 
 		 424 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4765  hypothetical protein  72.29 
 
 		 412 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0079112  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4919  hypothetical protein  70.17 
 
 		 425 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4640  hypothetical protein  71.79 
 
 		 412 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626559  hitchhiker  0.00685408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4663  hypothetical protein  69.02 
 
 		 412 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4778  hypothetical protein  71.5 
 
 		 413 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0655  hypothetical protein  71.21 
 
 		 424 aa  554  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000115775  normal  0.464819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12770  hypothetical protein  70.1 
 
 		 391 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10020  HI0933-like protein  71.75 
 
 		 410 aa  538  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1159  hypothetical protein  70.25 
 
 		 491 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4677  HI0933 family protein  62.44 
 
 		 422 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3600  HI0933 family protein  62.44 
 
 		 422 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.777632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2458  hypothetical protein  63.28 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1738  putative transmembrane protein  63.57 
 
 		 429 aa  483  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3158  putative transmembrane protein  60.72 
 
 		 425 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3007  hypothetical protein  64.16 
 
 		 402 aa  481  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2737  hypothetical protein  58.67 
 
 		 422 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5009  putative flavoprotein oxidoreductase  61.54 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.35364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3538  HI0933 family protein  59.9 
 
 		 421 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0420  putative transmembrane protein, NAD(FAD)-binding  60.51 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1785  hypothetical protein  61.71 
 
 		 419 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.928092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  56.84 
 
 		 458 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2895  HI0933-like protein  54.12 
 
 		 452 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2326  HI0933 family protein  60.72 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2642  hypothetical protein  55.08 
 
 		 482 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148126  normal  0.0148984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2266  HI0933-like protein  53.59 
 
 		 468 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2187  hypothetical protein  53.57 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0087  hypothetical protein  57.64 
 
 		 413 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2353  hypothetical protein  54.84 
 
 		 447 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0364  hypothetical protein  53.38 
 
 		 411 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113097  normal  0.426406 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01510  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  56.97 
 
 		 420 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1505  HI0933 family protein  54.84 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0455  HI0933 family protein  57.01 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1434  HI0933 family protein  56.58 
 
 		 415 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2553  HI0933-like protein  54.32 
 
 		 409 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1040  hypothetical protein  52.75 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3818  hypothetical protein  54.25 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1005  hypothetical protein  52.5 
 
 		 402 aa  398  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4321  hypothetical protein  54.9 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  51 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2481  HI0933 family protein  53.85 
 
 		 411 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0212712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1520  hypothetical protein  52.76 
 
 		 411 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2154  hypothetical protein  53.58 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3798  HI0933 family protein  53.33 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3087  HI0933-like protein  53.19 
 
 		 409 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  54.36 
 
 		 410 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2251  HI0933-like protein  53.85 
 
 		 414 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294962  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4913  HI0933 family protein  54.23 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3503  HI0933 family protein  53.73 
 
 		 416 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4431  hypothetical protein  52.93 
 
 		 409 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803445  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3585  hypothetical protein  53.06 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4371  hypothetical protein  55.36 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0879  hypothetical protein  53.12 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1089  hypothetical protein  55.43 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0453  hypothetical protein  52.23 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.881492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0839  HI0933 family protein  52.62 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.612434  normal  0.0181973 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3911  HI0933 family protein  50.12 
 
 		 428 aa  358  7e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0041  HI0933-like protein  48.99 
 
 		 399 aa  333  5e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.32138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0593  HI0933 family protein  50.25 
 
 		 416 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568345  hitchhiker  0.000690115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3248  hypothetical protein  45.66 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1928  hypothetical protein  49.5 
 
 		 429 aa  319  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744933  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2010  hypothetical protein  53 
 
 		 405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0407  HI0933-like protein  47.46 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  47.72 
 
 		 392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  47.72 
 
 		 392 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0805  HI0933 family protein  50.37 
 
 		 414 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.0281532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0053  HI0933 family protein  48.36 
 
 		 406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000927745 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2768  hypothetical protein  47.3 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  46.67 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0628  flavoprotein  38.04 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0929211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  32.76 
 
 		 412 aa  146  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  29.18 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  30.22 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  26.92 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  27.98 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  27.27 
 
 		 419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  30.73 
 
 		 419 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  28.64 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  22.57 
 
 		 403 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  22.33 
 
 		 403 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  27.53 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  27.44 
 
 		 408 aa  106  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  25.42 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  26.82 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  26.06 
 
 		 436 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  24.11 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  26.27 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  26.07 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  27.08 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  26.02 
 
 		 406 aa  99.8  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  22.63 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  25.81 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  25.18 
 
 		 427 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  25.24 
 
 		 423 aa  97.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  26.33 
 
 		 404 aa  96.7  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  25.56 
 
 		 435 aa  96.7  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  25.24 
 
 		 423 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  24.64 
 
 		 407 aa  96.3  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>