244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1434 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1434  HI0933 family protein  100 
 
 
415 aa  827    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01510  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  69.65 
 
 
420 aa  558  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2458  hypothetical protein  56.42 
 
 
424 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4296  hypothetical protein  56.3 
 
 
424 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5009  putative flavoprotein oxidoreductase  57.04 
 
 
421 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.35364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4663  hypothetical protein  53.61 
 
 
412 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4919  hypothetical protein  54.48 
 
 
425 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084695  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  53.23 
 
 
458 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3600  HI0933 family protein  54.05 
 
 
422 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.777632  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4677  HI0933 family protein  54.05 
 
 
422 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3007  hypothetical protein  55.67 
 
 
402 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3538  HI0933 family protein  54.66 
 
 
421 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0655  hypothetical protein  53.49 
 
 
424 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000115775  normal  0.464819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3158  putative transmembrane protein  53.19 
 
 
425 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1738  putative transmembrane protein  54.68 
 
 
429 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1785  hypothetical protein  57.46 
 
 
419 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.928092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2737  hypothetical protein  52.4 
 
 
422 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0087  hypothetical protein  55.58 
 
 
413 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10020  HI0933-like protein  56.51 
 
 
410 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4640  hypothetical protein  51.69 
 
 
412 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626559  hitchhiker  0.00685408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4765  hypothetical protein  51.45 
 
 
412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0079112  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2266  HI0933-like protein  49.44 
 
 
468 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0420  putative transmembrane protein, NAD(FAD)-binding  52.66 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2326  HI0933 family protein  55.81 
 
 
412 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12770  hypothetical protein  53.42 
 
 
391 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117851  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4778  hypothetical protein  52.42 
 
 
413 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103411  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2187  hypothetical protein  48.55 
 
 
458 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0455  HI0933 family protein  55.48 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2642  hypothetical protein  50.68 
 
 
482 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148126  normal  0.0148984 
 
 
-
 
NC_004310  BR1040  hypothetical protein  51.74 
 
 
402 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3724  hypothetical protein  56.58 
 
 
413 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1005  hypothetical protein  51.99 
 
 
402 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2895  HI0933-like protein  48.32 
 
 
452 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3818  hypothetical protein  54.21 
 
 
404 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1505  HI0933 family protein  50.12 
 
 
447 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1159  hypothetical protein  54.66 
 
 
491 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2353  hypothetical protein  50.12 
 
 
447 aa  388  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  49.5 
 
 
406 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0364  hypothetical protein  47.88 
 
 
411 aa  385  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113097  normal  0.426406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4321  hypothetical protein  52.43 
 
 
390 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0453  hypothetical protein  47.79 
 
 
406 aa  358  7e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.881492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1089  hypothetical protein  51.88 
 
 
458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3503  HI0933 family protein  51.49 
 
 
416 aa  356  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1520  hypothetical protein  48.76 
 
 
411 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2481  HI0933 family protein  48.15 
 
 
411 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0212712  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3798  HI0933 family protein  50.25 
 
 
402 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0839  HI0933 family protein  50.5 
 
 
407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.612434  normal  0.0181973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4913  HI0933 family protein  50.86 
 
 
419 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  50.37 
 
 
410 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0879  hypothetical protein  50.5 
 
 
407 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2553  HI0933-like protein  48.29 
 
 
409 aa  342  8e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2251  HI0933-like protein  47.78 
 
 
414 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294962  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3087  HI0933-like protein  50.13 
 
 
409 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2154  hypothetical protein  47.79 
 
 
408 aa  339  7e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3585  hypothetical protein  49.37 
 
 
395 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4371  hypothetical protein  50.86 
 
 
404 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4431  hypothetical protein  47.75 
 
 
409 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803445  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3911  HI0933 family protein  45.2 
 
 
428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0041  HI0933-like protein  46.4 
 
 
399 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.32138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3248  hypothetical protein  45.15 
 
 
402 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0805  HI0933 family protein  50.12 
 
 
414 aa  299  8e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.0281532 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  47.83 
 
 
392 aa  292  9e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  47.57 
 
 
392 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1928  hypothetical protein  46.42 
 
 
429 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744933  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0593  HI0933 family protein  44.39 
 
 
416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568345  hitchhiker  0.000690115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2010  hypothetical protein  48.88 
 
 
405 aa  282  9e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.170272 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0053  HI0933 family protein  46.63 
 
 
406 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000927745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0628  flavoprotein  36.75 
 
 
398 aa  273  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0929211  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0407  HI0933-like protein  45.24 
 
 
397 aa  270  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424008  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  45.78 
 
 
402 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2768  hypothetical protein  43.56 
 
 
401 aa  255  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  32.2 
 
 
433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 
409 aa  127  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  29.33 
 
 
408 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  30.51 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  28.92 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  28.4 
 
 
430 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  28.21 
 
 
419 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  26.75 
 
 
414 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  27.86 
 
 
457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  25.96 
 
 
406 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  24.35 
 
 
403 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  27.07 
 
 
415 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  27.67 
 
 
408 aa  110  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  27 
 
 
408 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.43 
 
 
403 aa  106  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  27.69 
 
 
415 aa  103  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  29.85 
 
 
419 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  22.69 
 
 
412 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  25.54 
 
 
435 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  25.29 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  25.65 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  26.65 
 
 
422 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  26.65 
 
 
422 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  25.71 
 
 
435 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  24.16 
 
 
412 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  26.49 
 
 
436 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  24.58 
 
 
404 aa  95.5  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  25.55 
 
 
420 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  24.7 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>