More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2737 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2737  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  851    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3538  HI0933 family protein  73.86 
 
 		 421 aa  599  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0420  putative transmembrane protein, NAD(FAD)-binding  73.37 
 
 		 430 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3158  putative transmembrane protein  70.39 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3600  HI0933 family protein  68.06 
 
 		 422 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.777632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4677  HI0933 family protein  68.06 
 
 		 422 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2458  hypothetical protein  65.07 
 
 		 424 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5009  putative flavoprotein oxidoreductase  66.42 
 
 		 421 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.35364 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1738  putative transmembrane protein  63.02 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2895  HI0933-like protein  56.57 
 
 		 452 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2326  HI0933 family protein  62.56 
 
 		 412 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2266  HI0933-like protein  56.79 
 
 		 468 aa  485  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1785  hypothetical protein  63.29 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.928092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3007  hypothetical protein  60.64 
 
 		 402 aa  482  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2187  hypothetical protein  56.85 
 
 		 458 aa  477  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4296  hypothetical protein  57.46 
 
 		 424 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4919  hypothetical protein  57.87 
 
 		 425 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2642  hypothetical protein  56.24 
 
 		 482 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148126  normal  0.0148984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1159  hypothetical protein  61.61 
 
 		 491 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0455  HI0933 family protein  60.73 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12770  hypothetical protein  60.45 
 
 		 391 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4765  hypothetical protein  57.39 
 
 		 412 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0079112  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  53.78 
 
 		 458 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2353  hypothetical protein  56.09 
 
 		 447 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1505  HI0933 family protein  56.56 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4640  hypothetical protein  56.9 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626559  hitchhiker  0.00685408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0655  hypothetical protein  58.27 
 
 		 424 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000115775  normal  0.464819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4663  hypothetical protein  55.5 
 
 		 412 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4778  hypothetical protein  56.9 
 
 		 413 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10020  HI0933-like protein  59.71 
 
 		 410 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148718  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3724  hypothetical protein  58.67 
 
 		 413 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0087  hypothetical protein  55.53 
 
 		 413 aa  435  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01510  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  55.28 
 
 		 420 aa  430  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1040  hypothetical protein  54.41 
 
 		 402 aa  423  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1005  hypothetical protein  54.17 
 
 		 402 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3818  hypothetical protein  51.72 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1434  HI0933 family protein  52.4 
 
 		 415 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2553  HI0933-like protein  50.96 
 
 		 409 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2481  HI0933 family protein  50.12 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0212712  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0364  hypothetical protein  48.65 
 
 		 411 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113097  normal  0.426406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2251  HI0933-like protein  50.87 
 
 		 414 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294962  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  49.75 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2154  hypothetical protein  51.21 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  50.38 
 
 		 410 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1520  hypothetical protein  49.05 
 
 		 411 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3798  HI0933 family protein  50.85 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4321  hypothetical protein  49.62 
 
 		 390 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3503  HI0933 family protein  51.47 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1089  hypothetical protein  52.67 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3585  hypothetical protein  49.25 
 
 		 395 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3087  HI0933-like protein  49.25 
 
 		 409 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0839  HI0933 family protein  48.77 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.612434  normal  0.0181973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4431  hypothetical protein  48.4 
 
 		 409 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803445  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0879  hypothetical protein  48.52 
 
 		 407 aa  349  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4371  hypothetical protein  48.16 
 
 		 404 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3248  hypothetical protein  45.91 
 
 		 402 aa  347  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3911  HI0933 family protein  44.84 
 
 		 428 aa  347  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1928  hypothetical protein  49.88 
 
 		 429 aa  333  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744933  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0593  HI0933 family protein  47.37 
 
 		 416 aa  332  8e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568345  hitchhiker  0.000690115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4913  HI0933 family protein  47.42 
 
 		 419 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0453  hypothetical protein  44.23 
 
 		 406 aa  324  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.881492 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  46 
 
 		 392 aa  322  6e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  46 
 
 		 392 aa  322  8e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0805  HI0933 family protein  48.41 
 
 		 414 aa  319  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.0281532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0053  HI0933 family protein  45.67 
 
 		 406 aa  309  6.999999999999999e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000927745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0041  HI0933-like protein  43.1 
 
 		 399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.32138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0407  HI0933-like protein  41.46 
 
 		 397 aa  299  6e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2768  hypothetical protein  45.89 
 
 		 401 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2010  hypothetical protein  47.45 
 
 		 405 aa  292  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170272 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  44.23 
 
 		 402 aa  292  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0628  flavoprotein  36.36 
 
 		 398 aa  281  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0929211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  29.72 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  29.76 
 
 		 433 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  26.65 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  26.91 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  28.64 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  27.93 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  27.55 
 
 		 406 aa  113  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  27.32 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  27.12 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  23.44 
 
 		 412 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  24.15 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.73 
 
 		 403 aa  106  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  24.88 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  25.54 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  27.75 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  23.36 
 
 		 424 aa  103  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  25.38 
 
 		 419 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  24.12 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  25.36 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  25.3 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  24.24 
 
 		 427 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  26 
 
 		 408 aa  94.4  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  24.94 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  22.74 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  23.79 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  23.79 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  23.79 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  25.28 
 
 		 455 aa  90.1  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>