228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2266 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2266  HI0933-like protein  100 
 
 		 468 aa  942    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2187  hypothetical protein  76.39 
 
 		 458 aa  701    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2642  hypothetical protein  69.45 
 
 		 482 aa  600  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148126  normal  0.0148984 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2895  HI0933-like protein  67.98 
 
 		 452 aa  595  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1505  HI0933 family protein  67.12 
 
 		 447 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2353  hypothetical protein  66.67 
 
 		 447 aa  569  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  65.7 
 
 		 458 aa  561  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2326  HI0933 family protein  65.85 
 
 		 412 aa  545  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2458  hypothetical protein  59.24 
 
 		 424 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1785  hypothetical protein  62.86 
 
 		 419 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.928092 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1738  putative transmembrane protein  57.48 
 
 		 429 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3600  HI0933 family protein  57.81 
 
 		 422 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.777632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4677  HI0933 family protein  57.81 
 
 		 422 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2737  hypothetical protein  56.79 
 
 		 422 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5009  putative flavoprotein oxidoreductase  56.98 
 
 		 421 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.35364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3007  hypothetical protein  56.5 
 
 		 402 aa  478  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3158  putative transmembrane protein  55.84 
 
 		 425 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0420  putative transmembrane protein, NAD(FAD)-binding  54.73 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3538  HI0933 family protein  56.09 
 
 		 421 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4919  hypothetical protein  53.85 
 
 		 425 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4296  hypothetical protein  54.71 
 
 		 424 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4663  hypothetical protein  53.81 
 
 		 412 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0455  HI0933 family protein  56.82 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4765  hypothetical protein  53.76 
 
 		 412 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0079112  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10020  HI0933-like protein  54.27 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148718  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0655  hypothetical protein  53.78 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000115775  normal  0.464819 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4640  hypothetical protein  53.76 
 
 		 412 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626559  hitchhiker  0.00685408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4778  hypothetical protein  53.78 
 
 		 413 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12770  hypothetical protein  52.18 
 
 		 391 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0087  hypothetical protein  52.57 
 
 		 413 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1159  hypothetical protein  52.61 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01510  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  50.44 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0364  hypothetical protein  46.93 
 
 		 411 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113097  normal  0.426406 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3724  hypothetical protein  53.59 
 
 		 413 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1520  hypothetical protein  49.1 
 
 		 411 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1434  HI0933 family protein  49.44 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1040  hypothetical protein  47.2 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1005  hypothetical protein  47.43 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3818  hypothetical protein  48.65 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4321  hypothetical protein  47.82 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2553  HI0933-like protein  48.44 
 
 		 409 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1089  hypothetical protein  50.73 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0839  HI0933 family protein  47.98 
 
 		 407 aa  364  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.612434  normal  0.0181973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0879  hypothetical protein  48.21 
 
 		 407 aa  360  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3503  HI0933 family protein  49.33 
 
 		 416 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849047 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  46.28 
 
 		 406 aa  360  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3798  HI0933 family protein  48.53 
 
 		 402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2481  HI0933 family protein  46.24 
 
 		 411 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0212712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3585  hypothetical protein  47.38 
 
 		 395 aa  355  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  48.86 
 
 		 410 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2154  hypothetical protein  47.59 
 
 		 408 aa  353  5e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3248  hypothetical protein  46.15 
 
 		 402 aa  352  5.9999999999999994e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3087  HI0933-like protein  47.92 
 
 		 409 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4431  hypothetical protein  46.19 
 
 		 409 aa  347  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803445  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2251  HI0933-like protein  46.95 
 
 		 414 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294962  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0593  HI0933 family protein  46.78 
 
 		 416 aa  333  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568345  hitchhiker  0.000690115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4371  hypothetical protein  46.31 
 
 		 404 aa  329  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4913  HI0933 family protein  45.41 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0805  HI0933 family protein  47.37 
 
 		 414 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.0281532 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  44.27 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  44.27 
 
 		 392 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3911  HI0933 family protein  42.6 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1928  hypothetical protein  45.31 
 
 		 429 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744933  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0407  HI0933-like protein  44.39 
 
 		 397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0453  hypothetical protein  41.54 
 
 		 406 aa  305  9.000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.881492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0053  HI0933 family protein  44.14 
 
 		 406 aa  300  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000927745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0041  HI0933-like protein  42.12 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.32138 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  43.5 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2768  hypothetical protein  42.79 
 
 		 401 aa  290  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2010  hypothetical protein  45.56 
 
 		 405 aa  285  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170272 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0628  flavoprotein  35.55 
 
 		 398 aa  256  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0929211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  24.56 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  24.34 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  27.09 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  26.55 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  22.96 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  26.49 
 
 		 408 aa  106  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  26.85 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  26.98 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  27.19 
 
 		 412 aa  101  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  25.93 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  24.24 
 
 		 412 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  24.94 
 
 		 419 aa  94  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  26.95 
 
 		 419 aa  93.6  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  25.16 
 
 		 406 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  26.72 
 
 		 408 aa  91.7  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  25.76 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  24 
 
 		 455 aa  91.3  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  26.46 
 
 		 415 aa  88.2  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  22.32 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  25.66 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  22.32 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  24.5 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  24.14 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  24.95 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  21.99 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  26.75 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  23.25 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  25 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>