More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2553 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2553  HI0933-like protein  100 
 
 		 409 aa  802    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2154  hypothetical protein  79.41 
 
 		 408 aa  625  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3087  HI0933-like protein  72.03 
 
 		 409 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2481  HI0933 family protein  67.89 
 
 		 411 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0212712  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2251  HI0933-like protein  69.36 
 
 		 414 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294962  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  68.63 
 
 		 410 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3585  hypothetical protein  69.49 
 
 		 395 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3911  HI0933 family protein  60.44 
 
 		 428 aa  463  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3248  hypothetical protein  58.75 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4913  HI0933 family protein  63.88 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0087  hypothetical protein  58.66 
 
 		 413 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4431  hypothetical protein  60 
 
 		 409 aa  440  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803445  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0839  HI0933 family protein  58.39 
 
 		 407 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.612434  normal  0.0181973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0879  hypothetical protein  59.31 
 
 		 407 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4371  hypothetical protein  59.95 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0453  hypothetical protein  57.07 
 
 		 406 aa  425  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.881492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4919  hypothetical protein  54.68 
 
 		 425 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4677  HI0933 family protein  55.26 
 
 		 422 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3600  HI0933 family protein  55.26 
 
 		 422 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.777632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3158  putative transmembrane protein  54.83 
 
 		 425 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4296  hypothetical protein  53.35 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3818  hypothetical protein  52.99 
 
 		 404 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0593  HI0933 family protein  55.58 
 
 		 416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568345  hitchhiker  0.000690115 
 
 
-
 
NC_004310  BR1040  hypothetical protein  50.5 
 
 		 402 aa  401  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3007  hypothetical protein  53.87 
 
 		 402 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1005  hypothetical protein  50.25 
 
 		 402 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1738  putative transmembrane protein  53.68 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2737  hypothetical protein  50.96 
 
 		 422 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3798  HI0933 family protein  52.84 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1520  hypothetical protein  52.08 
 
 		 411 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3538  HI0933 family protein  52.14 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4663  hypothetical protein  50.75 
 
 		 412 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1928  hypothetical protein  56.7 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744933  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2458  hypothetical protein  51.97 
 
 		 424 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1785  hypothetical protein  54.5 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.928092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4640  hypothetical protein  52.12 
 
 		 412 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626559  hitchhiker  0.00685408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4765  hypothetical protein  52.12 
 
 		 412 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0079112  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0655  hypothetical protein  52.74 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000115775  normal  0.464819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0805  HI0933 family protein  57.73 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.0281532 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4321  hypothetical protein  52.44 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2010  hypothetical protein  60.72 
 
 		 405 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2642  hypothetical protein  50.67 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148126  normal  0.0148984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0420  putative transmembrane protein, NAD(FAD)-binding  51.98 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4778  hypothetical protein  52.12 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2187  hypothetical protein  51.81 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0455  HI0933 family protein  54.35 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  48.51 
 
 		 406 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3724  hypothetical protein  54.32 
 
 		 413 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2326  HI0933 family protein  53.92 
 
 		 412 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1159  hypothetical protein  52.23 
 
 		 491 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  48.52 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5009  putative flavoprotein oxidoreductase  50.85 
 
 		 421 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.35364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12770  hypothetical protein  52.04 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2353  hypothetical protein  51.47 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2266  HI0933-like protein  48.44 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1505  HI0933 family protein  51.47 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3503  HI0933 family protein  50.37 
 
 		 416 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10020  HI0933-like protein  52.74 
 
 		 410 aa  362  5.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148718  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2895  HI0933-like protein  48 
 
 		 452 aa  361  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0407  HI0933-like protein  52 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0041  HI0933-like protein  50 
 
 		 399 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.32138 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0053  HI0933 family protein  51.6 
 
 		 406 aa  353  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000927745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  51.74 
 
 		 392 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  51.49 
 
 		 392 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0364  hypothetical protein  44.94 
 
 		 411 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113097  normal  0.426406 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  51.24 
 
 		 402 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1434  HI0933 family protein  48.29 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01510  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  47.78 
 
 		 420 aa  333  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2768  hypothetical protein  51.12 
 
 		 401 aa  332  8e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1089  hypothetical protein  48.62 
 
 		 458 aa  309  5e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0628  flavoprotein  38.11 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0929211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  33.96 
 
 		 433 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  31.46 
 
 		 412 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  29.31 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  29.38 
 
 		 430 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  28.5 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  31.44 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  29.95 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  29.08 
 
 		 426 aa  129  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  28.92 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  28.86 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  26.51 
 
 		 436 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  26.14 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  26.56 
 
 		 427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  27.92 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  28.43 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  28.99 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  27.78 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  26.86 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  23.75 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  26.37 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  23.57 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  26.13 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  26.37 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  26.01 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  26.24 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  25.42 
 
 		 420 aa  110  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  25.36 
 
 		 423 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  25.36 
 
 		 423 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>