220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2895 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2895  HI0933-like protein  100 
 
 		 452 aa  909    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2187  hypothetical protein  68.57 
 
 		 458 aa  598  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2266  HI0933-like protein  67.98 
 
 		 468 aa  589  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2642  hypothetical protein  66.59 
 
 		 482 aa  568  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148126  normal  0.0148984 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1505  HI0933 family protein  65.6 
 
 		 447 aa  545  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2326  HI0933 family protein  64.73 
 
 		 412 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2353  hypothetical protein  65.14 
 
 		 447 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  62.5 
 
 		 458 aa  521  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2458  hypothetical protein  59.01 
 
 		 424 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2737  hypothetical protein  56.57 
 
 		 422 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5009  putative flavoprotein oxidoreductase  58.07 
 
 		 421 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.35364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1785  hypothetical protein  60.49 
 
 		 419 aa  488  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.928092 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3600  HI0933 family protein  56.7 
 
 		 422 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.777632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4677  HI0933 family protein  56.7 
 
 		 422 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3538  HI0933 family protein  55.96 
 
 		 421 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1738  putative transmembrane protein  57.05 
 
 		 429 aa  468  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0420  putative transmembrane protein, NAD(FAD)-binding  55.84 
 
 		 430 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3007  hypothetical protein  55.46 
 
 		 402 aa  461  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3158  putative transmembrane protein  55.09 
 
 		 425 aa  458  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4919  hypothetical protein  54.12 
 
 		 425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4296  hypothetical protein  53.35 
 
 		 424 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12770  hypothetical protein  54.94 
 
 		 391 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4640  hypothetical protein  54.34 
 
 		 412 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626559  hitchhiker  0.00685408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4765  hypothetical protein  54.34 
 
 		 412 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0079112  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1159  hypothetical protein  54.59 
 
 		 491 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10020  HI0933-like protein  54.57 
 
 		 410 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148718  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4663  hypothetical protein  52.01 
 
 		 412 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0455  HI0933 family protein  56.24 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0655  hypothetical protein  53.71 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000115775  normal  0.464819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4778  hypothetical protein  53.65 
 
 		 413 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01510  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  50.67 
 
 		 420 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3724  hypothetical protein  53.01 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0087  hypothetical protein  51.23 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0364  hypothetical protein  47.1 
 
 		 411 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113097  normal  0.426406 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1434  HI0933 family protein  48.32 
 
 		 415 aa  385  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1040  hypothetical protein  45.86 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1005  hypothetical protein  45.86 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1089  hypothetical protein  49.06 
 
 		 458 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3818  hypothetical protein  47.01 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  46.53 
 
 		 406 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4321  hypothetical protein  47.59 
 
 		 390 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2553  HI0933-like protein  48 
 
 		 409 aa  361  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1520  hypothetical protein  45.95 
 
 		 411 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3503  HI0933 family protein  46.43 
 
 		 416 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849047 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3798  HI0933 family protein  45.98 
 
 		 402 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2481  HI0933 family protein  45.09 
 
 		 411 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0212712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3585  hypothetical protein  44.87 
 
 		 395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2154  hypothetical protein  45.29 
 
 		 408 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3087  HI0933-like protein  44.69 
 
 		 409 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  45.33 
 
 		 410 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2251  HI0933-like protein  45.03 
 
 		 414 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294962  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0839  HI0933 family protein  44.62 
 
 		 407 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.612434  normal  0.0181973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4431  hypothetical protein  44.84 
 
 		 409 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803445  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4913  HI0933 family protein  45.98 
 
 		 419 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3248  hypothetical protein  43.38 
 
 		 402 aa  329  7e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0879  hypothetical protein  44.84 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3911  HI0933 family protein  42.2 
 
 		 428 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4371  hypothetical protein  44.3 
 
 		 404 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0593  HI0933 family protein  44.27 
 
 		 416 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568345  hitchhiker  0.000690115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0407  HI0933-like protein  42.82 
 
 		 397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  42.47 
 
 		 392 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  42.47 
 
 		 392 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0805  HI0933 family protein  43.52 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.0281532 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0041  HI0933-like protein  40.67 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.32138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1928  hypothetical protein  42.5 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744933  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0453  hypothetical protein  39.78 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.881492 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2768  hypothetical protein  43.39 
 
 		 401 aa  289  7e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0053  HI0933 family protein  42.25 
 
 		 406 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000927745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  42.01 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2010  hypothetical protein  43.72 
 
 		 405 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170272 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0628  flavoprotein  32.8 
 
 		 398 aa  252  9.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0929211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  28.07 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  27.07 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  28.09 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  27.51 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 409 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  27.31 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  24.62 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  26.68 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  25.85 
 
 		 426 aa  99  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  23.92 
 
 		 422 aa  96.7  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  23.92 
 
 		 422 aa  96.7  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  26.71 
 
 		 410 aa  96.3  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  22.54 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  25.33 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  22.54 
 
 		 403 aa  94  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  26.3 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  24.24 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  23.7 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  24.31 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  26.34 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  21.35 
 
 		 406 aa  87.4  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  27.57 
 
 		 419 aa  87  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  26.03 
 
 		 446 aa  86.7  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  21.35 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  23.64 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  24.63 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  23.29 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  22.39 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  22.83 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>