More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0453 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0453  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  806    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.881492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2553  HI0933-like protein  57.07 
 
 
409 aa  425  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2154  hypothetical protein  57.14 
 
 
408 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3585  hypothetical protein  57.91 
 
 
395 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3087  HI0933-like protein  57.96 
 
 
409 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2481  HI0933 family protein  54.35 
 
 
411 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0212712  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4913  HI0933 family protein  59.1 
 
 
419 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  55.64 
 
 
410 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0839  HI0933 family protein  54.81 
 
 
407 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.612434  normal  0.0181973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4371  hypothetical protein  56.64 
 
 
404 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4431  hypothetical protein  55.06 
 
 
409 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803445  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0879  hypothetical protein  54.81 
 
 
407 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0087  hypothetical protein  52.14 
 
 
413 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2251  HI0933-like protein  54.73 
 
 
414 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294962  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3818  hypothetical protein  52.01 
 
 
404 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3158  putative transmembrane protein  50.24 
 
 
425 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3911  HI0933 family protein  53.33 
 
 
428 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1040  hypothetical protein  49.38 
 
 
402 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1005  hypothetical protein  49.38 
 
 
402 aa  373  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1928  hypothetical protein  55.31 
 
 
429 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744933  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0593  HI0933 family protein  56.4 
 
 
416 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568345  hitchhiker  0.000690115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4919  hypothetical protein  51.73 
 
 
425 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084695  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3007  hypothetical protein  50.63 
 
 
402 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3600  HI0933 family protein  49.39 
 
 
422 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.777632  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1520  hypothetical protein  50.13 
 
 
411 aa  365  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4677  HI0933 family protein  49.39 
 
 
422 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2458  hypothetical protein  48.9 
 
 
424 aa  362  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4296  hypothetical protein  49.63 
 
 
424 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4663  hypothetical protein  49.25 
 
 
412 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  48.87 
 
 
406 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0407  HI0933-like protein  50.92 
 
 
397 aa  352  5e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424008  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0805  HI0933 family protein  56.14 
 
 
414 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.0281532 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3503  HI0933 family protein  52.26 
 
 
416 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3538  HI0933 family protein  47.38 
 
 
421 aa  349  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  50.78 
 
 
392 aa  348  8e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1434  HI0933 family protein  48.28 
 
 
415 aa  348  8e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5009  putative flavoprotein oxidoreductase  48.06 
 
 
421 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.35364 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  50.52 
 
 
392 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0041  HI0933-like protein  48.36 
 
 
399 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.32138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3798  HI0933 family protein  49.88 
 
 
402 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3248  hypothetical protein  48.48 
 
 
402 aa  344  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1785  hypothetical protein  51.71 
 
 
419 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.928092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3724  hypothetical protein  52.1 
 
 
413 aa  341  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0655  hypothetical protein  47.7 
 
 
424 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000115775  normal  0.464819 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0053  HI0933 family protein  50.76 
 
 
406 aa  339  5e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000927745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4778  hypothetical protein  48.87 
 
 
413 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103411  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01510  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  45.99 
 
 
420 aa  338  8e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  50.78 
 
 
402 aa  338  9e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4640  hypothetical protein  48.02 
 
 
412 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626559  hitchhiker  0.00685408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0455  HI0933 family protein  50.83 
 
 
432 aa  335  9e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4765  hypothetical protein  47.77 
 
 
412 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0079112  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1738  putative transmembrane protein  48.15 
 
 
429 aa  333  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0364  hypothetical protein  42.43 
 
 
411 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113097  normal  0.426406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4321  hypothetical protein  48.33 
 
 
390 aa  331  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0420  putative transmembrane protein, NAD(FAD)-binding  46.38 
 
 
430 aa  328  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2326  HI0933 family protein  48.7 
 
 
412 aa  326  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  44.55 
 
 
458 aa  324  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2737  hypothetical protein  44.23 
 
 
422 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10020  HI0933-like protein  49.75 
 
 
410 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1159  hypothetical protein  48.12 
 
 
491 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1089  hypothetical protein  46.61 
 
 
458 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12770  hypothetical protein  47.03 
 
 
391 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117851  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2010  hypothetical protein  51.63 
 
 
405 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.170272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2187  hypothetical protein  43.4 
 
 
458 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2642  hypothetical protein  43.92 
 
 
482 aa  310  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148126  normal  0.0148984 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2353  hypothetical protein  44.37 
 
 
447 aa  307  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2266  HI0933-like protein  41.54 
 
 
468 aa  305  7e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1505  HI0933 family protein  43.92 
 
 
447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2768  hypothetical protein  46.35 
 
 
401 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2895  HI0933-like protein  39.78 
 
 
452 aa  290  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0628  flavoprotein  39.64 
 
 
398 aa  277  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0929211  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  32.61 
 
 
433 aa  139  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  27.71 
 
 
408 aa  138  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  33.84 
 
 
419 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  30 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  28.9 
 
 
430 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  29.06 
 
 
408 aa  121  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  28.57 
 
 
415 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  26.67 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 
409 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  29.67 
 
 
415 aa  112  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  24.34 
 
 
403 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  25.67 
 
 
424 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  28.4 
 
 
426 aa  106  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  26.51 
 
 
407 aa  106  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  26.53 
 
 
419 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.63 
 
 
403 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  23.9 
 
 
404 aa  103  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  23.37 
 
 
393 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  28.14 
 
 
410 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.68 
 
 
403 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  25.18 
 
 
406 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  25.91 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  25.67 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  27.27 
 
 
408 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  27.02 
 
 
435 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  24.02 
 
 
412 aa  93.6  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  26.83 
 
 
455 aa  94  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  25.25 
 
 
393 aa  90.9  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  23.39 
 
 
390 aa  90.5  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>