More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2768 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2768  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  770    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  61.21 
 
 		 392 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  61.54 
 
 		 392 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  61.22 
 
 		 402 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0407  HI0933-like protein  55.22 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0053  HI0933 family protein  58.99 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000927745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0041  HI0933-like protein  54.11 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.32138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1520  hypothetical protein  50.86 
 
 		 411 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3798  HI0933 family protein  52.35 
 
 		 402 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2481  HI0933 family protein  51.21 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0212712  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3818  hypothetical protein  49.88 
 
 		 404 aa  335  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2553  HI0933-like protein  51.12 
 
 		 409 aa  332  8e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4431  hypothetical protein  49.28 
 
 		 409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803445  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2458  hypothetical protein  49.28 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5009  putative flavoprotein oxidoreductase  49.27 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.35364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0839  HI0933 family protein  51.26 
 
 		 407 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.612434  normal  0.0181973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3503  HI0933 family protein  50.86 
 
 		 416 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849047 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4321  hypothetical protein  49.36 
 
 		 390 aa  318  9e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  49.75 
 
 		 410 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2251  HI0933-like protein  49.62 
 
 		 414 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294962  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3158  putative transmembrane protein  48.33 
 
 		 425 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3007  hypothetical protein  48.54 
 
 		 402 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  45.79 
 
 		 406 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2154  hypothetical protein  49.23 
 
 		 408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4677  HI0933 family protein  49.02 
 
 		 422 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4371  hypothetical protein  51.82 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3600  HI0933 family protein  49.02 
 
 		 422 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.777632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0087  hypothetical protein  50 
 
 		 413 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3585  hypothetical protein  49.37 
 
 		 395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3087  HI0933-like protein  50.65 
 
 		 409 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0879  hypothetical protein  51.76 
 
 		 407 aa  310  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4913  HI0933 family protein  53.96 
 
 		 419 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1005  hypothetical protein  46.35 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1040  hypothetical protein  46.6 
 
 		 402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2737  hypothetical protein  45.89 
 
 		 422 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2326  HI0933 family protein  47.18 
 
 		 412 aa  296  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4919  hypothetical protein  46.38 
 
 		 425 aa  295  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1785  hypothetical protein  48.8 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.928092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4296  hypothetical protein  45.39 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2642  hypothetical protein  44.03 
 
 		 482 aa  293  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148126  normal  0.0148984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0364  hypothetical protein  42.51 
 
 		 411 aa  292  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113097  normal  0.426406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0453  hypothetical protein  46.35 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.881492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12770  hypothetical protein  49.36 
 
 		 391 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1738  putative transmembrane protein  46.81 
 
 		 429 aa  290  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  45.48 
 
 		 458 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2266  HI0933-like protein  42.79 
 
 		 468 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2895  HI0933-like protein  43.39 
 
 		 452 aa  289  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3248  hypothetical protein  45.66 
 
 		 402 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1159  hypothetical protein  47.77 
 
 		 491 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2187  hypothetical protein  44.8 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3538  HI0933 family protein  46.72 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4663  hypothetical protein  44.28 
 
 		 412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0593  HI0933 family protein  48.4 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568345  hitchhiker  0.000690115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0420  putative transmembrane protein, NAD(FAD)-binding  45.84 
 
 		 430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4778  hypothetical protein  44.72 
 
 		 413 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4640  hypothetical protein  45.61 
 
 		 412 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626559  hitchhiker  0.00685408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4765  hypothetical protein  45.45 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0079112  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3911  HI0933 family protein  43.37 
 
 		 428 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0805  HI0933 family protein  49.37 
 
 		 414 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.0281532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2010  hypothetical protein  50.13 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1928  hypothetical protein  46.8 
 
 		 429 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744933  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0655  hypothetical protein  45.54 
 
 		 424 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000115775  normal  0.464819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10020  HI0933-like protein  47.86 
 
 		 410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148718  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01510  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.74 
 
 		 420 aa  266  5e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3724  hypothetical protein  47.3 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2353  hypothetical protein  42.52 
 
 		 447 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1089  hypothetical protein  47.33 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1505  HI0933 family protein  42.29 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0455  HI0933 family protein  45.65 
 
 		 432 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1434  HI0933 family protein  43.56 
 
 		 415 aa  250  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0628  flavoprotein  34.5 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0929211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  32.44 
 
 		 412 aa  133  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  30.81 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  27.42 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  26.17 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  27 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  32.22 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  29.54 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  28.5 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  26.89 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  30.25 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  27.6 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  26.42 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  26.42 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  26.42 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  26.42 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  26.42 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  26.42 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  26.42 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  25.94 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  25.19 
 
 		 397 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  26.18 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  25.94 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  27.42 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  23.82 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  22.88 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  26.42 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  27.5 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  31.01 
 
 		 393 aa  96.7  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>