More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10020 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_10020  HI0933-like protein  100 
 
 
410 aa  799    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148718  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4663  hypothetical protein  68.69 
 
 
412 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4296  hypothetical protein  70.57 
 
 
424 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4919  hypothetical protein  67.73 
 
 
425 aa  547  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084695  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12770  hypothetical protein  70.28 
 
 
391 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117851  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0655  hypothetical protein  65.53 
 
 
424 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000115775  normal  0.464819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4765  hypothetical protein  64.55 
 
 
412 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0079112  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3724  hypothetical protein  71.75 
 
 
413 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1159  hypothetical protein  69.58 
 
 
491 aa  524  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4640  hypothetical protein  64.06 
 
 
412 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626559  hitchhiker  0.00685408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4778  hypothetical protein  64.3 
 
 
413 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103411  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3158  putative transmembrane protein  63.66 
 
 
425 aa  504  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4677  HI0933 family protein  62.68 
 
 
422 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3600  HI0933 family protein  62.68 
 
 
422 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.777632  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1738  putative transmembrane protein  65.36 
 
 
429 aa  490  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2458  hypothetical protein  62.08 
 
 
424 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5009  putative flavoprotein oxidoreductase  64.11 
 
 
421 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.35364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3538  HI0933 family protein  60.05 
 
 
421 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1785  hypothetical protein  64.13 
 
 
419 aa  472  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.928092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0420  putative transmembrane protein, NAD(FAD)-binding  60.64 
 
 
430 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2737  hypothetical protein  59.71 
 
 
422 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  57.21 
 
 
458 aa  461  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2187  hypothetical protein  55.88 
 
 
458 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2266  HI0933-like protein  54.27 
 
 
468 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2326  HI0933 family protein  60.68 
 
 
412 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2895  HI0933-like protein  54.57 
 
 
452 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3007  hypothetical protein  59.7 
 
 
402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0087  hypothetical protein  59.8 
 
 
413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2642  hypothetical protein  56.36 
 
 
482 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148126  normal  0.0148984 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2353  hypothetical protein  56.68 
 
 
447 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1505  HI0933 family protein  56.68 
 
 
447 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1005  hypothetical protein  56.53 
 
 
402 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1040  hypothetical protein  56.53 
 
 
402 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0455  HI0933 family protein  58.19 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01510  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  56.47 
 
 
420 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1434  HI0933 family protein  56.51 
 
 
415 aa  408  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0364  hypothetical protein  50.12 
 
 
411 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113097  normal  0.426406 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3818  hypothetical protein  56.11 
 
 
404 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1520  hypothetical protein  54.41 
 
 
411 aa  398  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4321  hypothetical protein  54.52 
 
 
390 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0839  HI0933 family protein  56.28 
 
 
407 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.612434  normal  0.0181973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2481  HI0933 family protein  52.55 
 
 
411 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0212712  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  51.76 
 
 
406 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2553  HI0933-like protein  52.74 
 
 
409 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0879  hypothetical protein  56.53 
 
 
407 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3798  HI0933 family protein  53.02 
 
 
402 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2154  hypothetical protein  53.04 
 
 
408 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  52.91 
 
 
410 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3503  HI0933 family protein  53.09 
 
 
416 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4431  hypothetical protein  53.48 
 
 
409 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803445  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4913  HI0933 family protein  55.11 
 
 
419 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2251  HI0933-like protein  51.93 
 
 
414 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294962  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3585  hypothetical protein  52.17 
 
 
395 aa  362  9e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1089  hypothetical protein  53.36 
 
 
458 aa  356  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3087  HI0933-like protein  51.09 
 
 
409 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3911  HI0933 family protein  49.88 
 
 
428 aa  350  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4371  hypothetical protein  53.87 
 
 
404 aa  342  8e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3248  hypothetical protein  49.25 
 
 
402 aa  341  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0453  hypothetical protein  49.75 
 
 
406 aa  339  5.9999999999999996e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.881492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0593  HI0933 family protein  51.28 
 
 
416 aa  333  4e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568345  hitchhiker  0.000690115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0805  HI0933 family protein  53.92 
 
 
414 aa  328  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.0281532 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0041  HI0933-like protein  48.99 
 
 
399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.32138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0407  HI0933-like protein  48.71 
 
 
397 aa  321  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424008  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  49.5 
 
 
392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  49.25 
 
 
392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2010  hypothetical protein  56.36 
 
 
405 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.170272 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0053  HI0933 family protein  48.48 
 
 
406 aa  303  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000927745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1928  hypothetical protein  48.16 
 
 
429 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744933  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  49.48 
 
 
402 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0628  flavoprotein  37.37 
 
 
398 aa  288  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0929211  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2768  hypothetical protein  47.86 
 
 
401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  32.29 
 
 
433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  32.13 
 
 
412 aa  139  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  27.45 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  29.26 
 
 
414 aa  126  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  30.13 
 
 
419 aa  123  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  31.28 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  28.67 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
409 aa  114  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  28.03 
 
 
408 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  23.28 
 
 
412 aa  109  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  25.71 
 
 
412 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  27.72 
 
 
419 aa  106  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.46 
 
 
403 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  25.61 
 
 
406 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  25.88 
 
 
446 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.21 
 
 
403 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  27.96 
 
 
457 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  29.8 
 
 
408 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  25.93 
 
 
455 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  25.95 
 
 
415 aa  96.7  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  28 
 
 
452 aa  95.9  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  27.01 
 
 
426 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  21.98 
 
 
403 aa  93.2  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  22.74 
 
 
420 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  25.06 
 
 
427 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  23.54 
 
 
412 aa  90.5  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  22.65 
 
 
424 aa  90.5  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  23.59 
 
 
390 aa  89  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  24.21 
 
 
406 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>