More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3600 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3158  putative transmembrane protein  84.01 
 
 		 425 aa  704    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3600  HI0933 family protein  100 
 
 		 422 aa  845    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.777632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4677  HI0933 family protein  100 
 
 		 422 aa  845    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2737  hypothetical protein  68.06 
 
 		 422 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2458  hypothetical protein  67.39 
 
 		 424 aa  551  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3538  HI0933 family protein  67 
 
 		 421 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0420  putative transmembrane protein, NAD(FAD)-binding  66.83 
 
 		 430 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5009  putative flavoprotein oxidoreductase  65.62 
 
 		 421 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.35364 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1738  putative transmembrane protein  64.73 
 
 		 429 aa  518  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4919  hypothetical protein  61.9 
 
 		 425 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4296  hypothetical protein  62.44 
 
 		 424 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2326  HI0933 family protein  65.47 
 
 		 412 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2266  HI0933-like protein  56.77 
 
 		 468 aa  488  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4663  hypothetical protein  60.49 
 
 		 412 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3007  hypothetical protein  61.92 
 
 		 402 aa  485  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0455  HI0933 family protein  63.74 
 
 		 432 aa  484  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4765  hypothetical protein  59.47 
 
 		 412 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0079112  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4640  hypothetical protein  59.22 
 
 		 412 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626559  hitchhiker  0.00685408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2187  hypothetical protein  59.37 
 
 		 458 aa  482  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4778  hypothetical protein  59.08 
 
 		 413 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2895  HI0933-like protein  56.7 
 
 		 452 aa  481  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0655  hypothetical protein  58.7 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000115775  normal  0.464819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12770  hypothetical protein  63.64 
 
 		 391 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2642  hypothetical protein  57.82 
 
 		 482 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148126  normal  0.0148984 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10020  HI0933-like protein  62.68 
 
 		 410 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148718  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1785  hypothetical protein  62.95 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.928092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1159  hypothetical protein  62.89 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  56.85 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1505  HI0933 family protein  56.98 
 
 		 447 aa  464  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2353  hypothetical protein  56.75 
 
 		 447 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3724  hypothetical protein  62.44 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0364  hypothetical protein  53.41 
 
 		 411 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113097  normal  0.426406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0087  hypothetical protein  58.52 
 
 		 413 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01510  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  54.85 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1005  hypothetical protein  51.36 
 
 		 402 aa  418  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1040  hypothetical protein  51.36 
 
 		 402 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2553  HI0933-like protein  55.26 
 
 		 409 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1520  hypothetical protein  53.79 
 
 		 411 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1089  hypothetical protein  56.7 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1434  HI0933 family protein  54.05 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3818  hypothetical protein  53.58 
 
 		 404 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2154  hypothetical protein  55.91 
 
 		 408 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2481  HI0933 family protein  53.43 
 
 		 411 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0212712  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3087  HI0933-like protein  54.96 
 
 		 409 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2251  HI0933-like protein  54.13 
 
 		 414 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294962  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  49.88 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0839  HI0933 family protein  52.94 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.612434  normal  0.0181973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4321  hypothetical protein  52.28 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  53.9 
 
 		 410 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0879  hypothetical protein  53.68 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3585  hypothetical protein  52.63 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3798  HI0933 family protein  50.86 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3503  HI0933 family protein  51.67 
 
 		 416 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4913  HI0933 family protein  53.19 
 
 		 419 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3911  HI0933 family protein  49.25 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4371  hypothetical protein  52.94 
 
 		 404 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0453  hypothetical protein  49.39 
 
 		 406 aa  364  1e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.881492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4431  hypothetical protein  49.88 
 
 		 409 aa  363  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803445  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3248  hypothetical protein  49.01 
 
 		 402 aa  354  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0805  HI0933 family protein  53.09 
 
 		 414 aa  350  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.0281532 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0593  HI0933 family protein  50.36 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568345  hitchhiker  0.000690115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2010  hypothetical protein  50.84 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170272 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0041  HI0933-like protein  46.9 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.32138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1928  hypothetical protein  49.03 
 
 		 429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744933  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0053  HI0933 family protein  48.64 
 
 		 406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000927745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  47.86 
 
 		 392 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  47.61 
 
 		 392 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0407  HI0933-like protein  46.21 
 
 		 397 aa  315  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2768  hypothetical protein  49.02 
 
 		 401 aa  313  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  46.04 
 
 		 402 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0628  flavoprotein  36.25 
 
 		 398 aa  290  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0929211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  31.33 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  29.44 
 
 		 430 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  30.12 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  27.9 
 
 		 414 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  28.71 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  25.42 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  25.6 
 
 		 424 aa  130  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  29.29 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  32.52 
 
 		 419 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  28.4 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  27.59 
 
 		 412 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  25.74 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  27.16 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  28.61 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  27.07 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  25.5 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  27.34 
 
 		 426 aa  116  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  26.92 
 
 		 406 aa  114  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  28.78 
 
 		 408 aa  113  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  25.36 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  26.51 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  22.72 
 
 		 446 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  24.82 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  25.9 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  24.82 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  29.08 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  22.87 
 
 		 420 aa  107  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  25.42 
 
 		 426 aa  106  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>