More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0407 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0407  HI0933-like protein  100 
 
 
397 aa  799    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424008  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  61.82 
 
 
392 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  61.3 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0041  HI0933-like protein  60.05 
 
 
399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.32138 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  62.11 
 
 
402 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0053  HI0933 family protein  58.21 
 
 
406 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000927745 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2768  hypothetical protein  55.22 
 
 
401 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2553  HI0933-like protein  52 
 
 
409 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2481  HI0933 family protein  52 
 
 
411 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0212712  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2154  hypothetical protein  51.68 
 
 
408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  53.09 
 
 
410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2251  HI0933-like protein  52.96 
 
 
414 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294962  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0453  hypothetical protein  50.92 
 
 
406 aa  352  5e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.881492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0087  hypothetical protein  50.76 
 
 
413 aa  346  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  46.35 
 
 
406 aa  332  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1040  hypothetical protein  47.24 
 
 
402 aa  332  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3818  hypothetical protein  49.35 
 
 
404 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3585  hypothetical protein  50.65 
 
 
395 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1005  hypothetical protein  47.24 
 
 
402 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2458  hypothetical protein  47.26 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0839  HI0933 family protein  49.35 
 
 
407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.612434  normal  0.0181973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3007  hypothetical protein  48.33 
 
 
402 aa  326  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3087  HI0933-like protein  49.23 
 
 
409 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4431  hypothetical protein  50.13 
 
 
409 aa  325  9e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803445  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5009  putative flavoprotein oxidoreductase  46.59 
 
 
421 aa  322  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.35364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3538  HI0933 family protein  46.17 
 
 
421 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4371  hypothetical protein  50.52 
 
 
404 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0879  hypothetical protein  49.61 
 
 
407 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4919  hypothetical protein  47.81 
 
 
425 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084695  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4913  HI0933 family protein  49.62 
 
 
419 aa  316  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4321  hypothetical protein  48.66 
 
 
390 aa  316  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2326  HI0933 family protein  48.05 
 
 
412 aa  316  6e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3600  HI0933 family protein  46.21 
 
 
422 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.777632  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4677  HI0933 family protein  46.21 
 
 
422 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2187  hypothetical protein  45.92 
 
 
458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0364  hypothetical protein  43.29 
 
 
411 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113097  normal  0.426406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4296  hypothetical protein  47.81 
 
 
424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0593  HI0933 family protein  51.01 
 
 
416 aa  313  4.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568345  hitchhiker  0.000690115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3911  HI0933 family protein  47.55 
 
 
428 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2266  HI0933-like protein  44.39 
 
 
468 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1520  hypothetical protein  46.04 
 
 
411 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3798  HI0933 family protein  47.33 
 
 
402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1785  hypothetical protein  50.12 
 
 
419 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.928092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4663  hypothetical protein  47.3 
 
 
412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2895  HI0933-like protein  42.82 
 
 
452 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  44.55 
 
 
458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3503  HI0933 family protein  47.45 
 
 
416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849047 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3248  hypothetical protein  46.55 
 
 
402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1738  putative transmembrane protein  44.47 
 
 
429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4778  hypothetical protein  46.33 
 
 
413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103411  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0420  putative transmembrane protein, NAD(FAD)-binding  46.56 
 
 
430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0805  HI0933 family protein  49.87 
 
 
414 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.0281532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10020  HI0933-like protein  47.16 
 
 
410 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148718  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0655  hypothetical protein  47.09 
 
 
424 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000115775  normal  0.464819 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2353  hypothetical protein  45.93 
 
 
447 aa  300  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2737  hypothetical protein  41.46 
 
 
422 aa  299  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0455  HI0933 family protein  47.76 
 
 
432 aa  299  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1505  HI0933 family protein  45.22 
 
 
447 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4640  hypothetical protein  46.08 
 
 
412 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626559  hitchhiker  0.00685408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4765  hypothetical protein  46.08 
 
 
412 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0079112  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3158  putative transmembrane protein  43.13 
 
 
425 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1928  hypothetical protein  47.07 
 
 
429 aa  291  9e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744933  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12770  hypothetical protein  44.27 
 
 
391 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117851  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1159  hypothetical protein  45.66 
 
 
491 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2642  hypothetical protein  43.22 
 
 
482 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148126  normal  0.0148984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2010  hypothetical protein  48.9 
 
 
405 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.170272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3724  hypothetical protein  47.46 
 
 
413 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01510  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  43.3 
 
 
420 aa  272  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1089  hypothetical protein  44.92 
 
 
458 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1434  HI0933 family protein  45.24 
 
 
415 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0628  flavoprotein  35.32 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0929211  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  27.98 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  28.13 
 
 
430 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  29.51 
 
 
408 aa  124  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  25.32 
 
 
393 aa  124  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  29.66 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  24.57 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 
409 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  27.6 
 
 
408 aa  116  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  26.2 
 
 
390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  29.31 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.72 
 
 
403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  29.76 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  26.19 
 
 
436 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  26.05 
 
 
427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  27.1 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  26.93 
 
 
408 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  25.81 
 
 
423 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  25.87 
 
 
423 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  25.59 
 
 
426 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  25.42 
 
 
423 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  25.64 
 
 
423 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  25.41 
 
 
423 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  25.64 
 
 
423 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  25.64 
 
 
423 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  25.41 
 
 
423 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  25.41 
 
 
423 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  24.15 
 
 
412 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  25 
 
 
423 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  25.06 
 
 
406 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>