More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0879 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0839  HI0933 family protein  96.81 
 
 		 407 aa  761    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.612434  normal  0.0181973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0879  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  783    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0805  HI0933 family protein  84.22 
 
 		 414 aa  593  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.0281532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4371  hypothetical protein  65.66 
 
 		 404 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4913  HI0933 family protein  67.85 
 
 		 419 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2553  HI0933-like protein  59.8 
 
 		 409 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2010  hypothetical protein  69.5 
 
 		 405 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2251  HI0933-like protein  60.79 
 
 		 414 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294962  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3585  hypothetical protein  60 
 
 		 395 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3087  HI0933-like protein  59.59 
 
 		 409 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2154  hypothetical protein  59.7 
 
 		 408 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  61.5 
 
 		 410 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3248  hypothetical protein  59.55 
 
 		 402 aa  418  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2481  HI0933 family protein  57.75 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0212712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0087  hypothetical protein  58.15 
 
 		 413 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3911  HI0933 family protein  56.05 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3007  hypothetical protein  56.25 
 
 		 402 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3818  hypothetical protein  54.77 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4431  hypothetical protein  56.42 
 
 		 409 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803445  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3600  HI0933 family protein  53.68 
 
 		 422 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.777632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4677  HI0933 family protein  53.68 
 
 		 422 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0453  hypothetical protein  54.81 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.881492 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1005  hypothetical protein  50.75 
 
 		 402 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1040  hypothetical protein  51 
 
 		 402 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4919  hypothetical protein  55.53 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4296  hypothetical protein  54.36 
 
 		 424 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2458  hypothetical protein  54.48 
 
 		 424 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3158  putative transmembrane protein  52.2 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4321  hypothetical protein  52.34 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1928  hypothetical protein  57.75 
 
 		 429 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744933  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  49.87 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4663  hypothetical protein  52.87 
 
 		 412 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5009  putative flavoprotein oxidoreductase  51.58 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.35364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10020  HI0933-like protein  56.53 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148718  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3798  HI0933 family protein  52.53 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1738  putative transmembrane protein  52.36 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4904  hypothetical protein  49.1 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2266  HI0933-like protein  48.21 
 
 		 468 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0593  HI0933 family protein  54.68 
 
 		 416 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568345  hitchhiker  0.000690115 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01510  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  50.24 
 
 		 420 aa  363  3e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0455  HI0933 family protein  54.16 
 
 		 432 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1785  hypothetical protein  53.77 
 
 		 419 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.928092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12770  hypothetical protein  53.33 
 
 		 391 aa  359  6e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3538  HI0933 family protein  50.64 
 
 		 421 aa  358  9e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570912  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2642  hypothetical protein  47.85 
 
 		 482 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.148126  normal  0.0148984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2737  hypothetical protein  48.52 
 
 		 422 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3503  HI0933 family protein  52.39 
 
 		 416 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4765  hypothetical protein  50.13 
 
 		 412 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0079112  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0053  HI0933 family protein  52.64 
 
 		 406 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000927745 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4640  hypothetical protein  50 
 
 		 412 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626559  hitchhiker  0.00685408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0420  putative transmembrane protein, NAD(FAD)-binding  50.51 
 
 		 430 aa  352  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0655  hypothetical protein  50.51 
 
 		 424 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000115775  normal  0.464819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2187  hypothetical protein  48.86 
 
 		 458 aa  351  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1520  hypothetical protein  49.23 
 
 		 411 aa  351  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2326  HI0933 family protein  51.81 
 
 		 412 aa  349  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0836  putative flavoprotein  52.71 
 
 		 392 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538979  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0364  hypothetical protein  42.86 
 
 		 411 aa  343  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113097  normal  0.426406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2494  hypothetical protein  52.71 
 
 		 392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4778  hypothetical protein  49.75 
 
 		 413 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3724  hypothetical protein  53.12 
 
 		 413 aa  340  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1159  hypothetical protein  51.37 
 
 		 491 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1434  HI0933 family protein  50.5 
 
 		 415 aa  338  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1505  HI0933 family protein  47.19 
 
 		 447 aa  335  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  52.7 
 
 		 402 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2353  hypothetical protein  47.19 
 
 		 447 aa  334  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.839309  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2895  HI0933-like protein  44.84 
 
 		 452 aa  332  6e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0407  HI0933-like protein  49.61 
 
 		 397 aa  330  4e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2768  hypothetical protein  51.76 
 
 		 401 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0041  HI0933-like protein  48.45 
 
 		 399 aa  315  8e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.32138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1089  hypothetical protein  49.77 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0628  flavoprotein  38.36 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0929211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  33.02 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  32.59 
 
 		 412 aa  142  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  34.29 
 
 		 419 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  28.64 
 
 		 430 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 409 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  28.82 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  31.41 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  26.25 
 
 		 403 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  26 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  31.88 
 
 		 408 aa  119  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  26.33 
 
 		 406 aa  119  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  26.09 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  29.59 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  26.86 
 
 		 414 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  29.37 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  31 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  28.72 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  27.65 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  27.44 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  27.07 
 
 		 435 aa  106  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  27.34 
 
 		 404 aa  106  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  26.72 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  28.19 
 
 		 415 aa  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  28.68 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  26.79 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  25.31 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  24.7 
 
 		 424 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  26.38 
 
 		 435 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  23.24 
 
 		 412 aa  99.4  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>