More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5306 on replicon NC_010182
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010182  BcerKBAB4_5306  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
359 aa  750    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1873  DNA-directed DNA polymerase  31.13 
 
 
755 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000393429  normal  0.0429969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  27.48 
 
 
846 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  29.78 
 
 
893 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  29.78 
 
 
893 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1966  DNA polymerase I  28.4 
 
 
986 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.378529 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0748  DNA polymerase I  29.84 
 
 
986 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  26.98 
 
 
875 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0693  DNA polymerase I  28.07 
 
 
998 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.433628  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15881  DNA polymerase I  29.52 
 
 
986 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.65374  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  26.9 
 
 
888 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  29.34 
 
 
877 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  29.34 
 
 
877 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  26.09 
 
 
912 aa  116  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  29.34 
 
 
877 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  29.34 
 
 
877 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  28.85 
 
 
877 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  27.85 
 
 
876 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  29.34 
 
 
891 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  29.34 
 
 
891 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  29.34 
 
 
891 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  29.34 
 
 
877 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  29.34 
 
 
877 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  27 
 
 
893 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12141  DNA polymerase I  28.07 
 
 
985 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.503839 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08691  DNA polymerase I  28.91 
 
 
986 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  29.02 
 
 
877 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  27.6 
 
 
880 aa  113  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  27.85 
 
 
876 aa  113  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  27.85 
 
 
876 aa  113  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  28.53 
 
 
982 aa  113  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  26.69 
 
 
890 aa  112  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  26.95 
 
 
884 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  26.69 
 
 
878 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  29.14 
 
 
870 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  28.53 
 
 
855 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  28.18 
 
 
879 aa  110  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  28.71 
 
 
877 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1478  DNA polymerase I  27.03 
 
 
941 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.495398 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  25.9 
 
 
951 aa  109  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1666  DNA polymerase I  25 
 
 
907 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0551454 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  27.38 
 
 
885 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  27.16 
 
 
924 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  29.41 
 
 
934 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  25.15 
 
 
886 aa  107  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  25.29 
 
 
903 aa  107  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  27.93 
 
 
977 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  27.43 
 
 
876 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  26.2 
 
 
898 aa  105  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  27.55 
 
 
866 aa  105  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  27.11 
 
 
906 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1542  DNA polymerase I  27.03 
 
 
940 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  26.17 
 
 
1000 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  25.3 
 
 
891 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  26.4 
 
 
953 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13041  DNA polymerase I  26.98 
 
 
976 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  27.53 
 
 
912 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  25.66 
 
 
908 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  26.03 
 
 
941 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  27.22 
 
 
944 aa  103  4e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  25.98 
 
 
944 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  28.13 
 
 
908 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  27.49 
 
 
957 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13291  DNA polymerase I  26.35 
 
 
976 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  29.41 
 
 
896 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  25.78 
 
 
938 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  28.39 
 
 
850 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0546  DNA polymerase I  27.78 
 
 
1045 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  25.95 
 
 
896 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  26.1 
 
 
940 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  26.67 
 
 
972 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  26.67 
 
 
972 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  27.19 
 
 
899 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  27.19 
 
 
899 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  30.19 
 
 
896 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  25.71 
 
 
957 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  26.69 
 
 
982 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  25.4 
 
 
934 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  26.49 
 
 
878 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  25.15 
 
 
915 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  25.99 
 
 
917 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  26.15 
 
 
934 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  25.99 
 
 
917 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  25.4 
 
 
861 aa  100  4e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  28.31 
 
 
945 aa  100  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13151  DNA polymerase I  26.35 
 
 
976 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  25.69 
 
 
917 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  24.92 
 
 
968 aa  100  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  26.23 
 
 
939 aa  100  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  27.16 
 
 
945 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1725  DNA polymerase I  27.07 
 
 
875 aa  100  4e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  26.93 
 
 
916 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  27.16 
 
 
911 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  26.76 
 
 
894 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  25.08 
 
 
937 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  25.53 
 
 
917 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  25.53 
 
 
917 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  25.53 
 
 
917 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  25.29 
 
 
936 aa  99.8  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1236  DNA polymerase I  26.33 
 
 
976 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>