More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2004 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II2004  adenylosuccinate synthase  100 
 
 		 561 aa  1155    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00819563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0610  Adenylosuccinate synthase  47.6 
 
 		 507 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278665  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0498  Adenylosuccinate synthase  43.72 
 
 		 550 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000018536  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  37.98 
 
 		 338 aa  203  5e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  32.78 
 
 		 336 aa  194  3e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  33.14 
 
 		 337 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  35.8 
 
 		 337 aa  193  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  33.8 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  32.7 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  32.57 
 
 		 337 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  35.73 
 
 		 334 aa  189  9e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  31.94 
 
 		 338 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  35.53 
 
 		 336 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  34.29 
 
 		 334 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  32.97 
 
 		 333 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  34.29 
 
 		 332 aa  180  8e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  33.72 
 
 		 334 aa  177  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  31.52 
 
 		 337 aa  177  6e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  34.38 
 
 		 335 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  32.41 
 
 		 346 aa  171  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  32.01 
 
 		 350 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  31.62 
 
 		 337 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  30.25 
 
 		 337 aa  157  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  29.97 
 
 		 427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0403  adenylosuccinate synthetase  29.66 
 
 		 424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.841501 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  31.16 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  28.08 
 
 		 434 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0119  adenylosuccinate synthetase  30 
 
 		 423 aa  128  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  27.46 
 
 		 434 aa  126  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  28.08 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  31.7 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  30.7 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  29.18 
 
 		 426 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1701  adenylosuccinate synthetase  29.55 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.401877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  26.3 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  29.43 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  27.92 
 
 		 432 aa  121  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  30.99 
 
 		 430 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  27.7 
 
 		 438 aa  120  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  27.68 
 
 		 434 aa  120  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  31.82 
 
 		 429 aa  120  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  29.01 
 
 		 427 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  26.1 
 
 		 419 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26256  adenylosuccinate synthetase  28.95 
 
 		 526 aa  118  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  30.34 
 
 		 807 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  29.39 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  28.94 
 
 		 449 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  28.11 
 
 		 430 aa  117  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  27.82 
 
 		 432 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  28.34 
 
 		 429 aa  117  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  26.56 
 
 		 432 aa  117  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  28.37 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  27.36 
 
 		 432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  28.65 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  29.2 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  29.63 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  29.58 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1304  adenylosuccinate synthetase  30.48 
 
 		 421 aa  115  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4214  adenylosuccinate synthase  29.97 
 
 		 430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.855707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0368  adenylosuccinate synthetase  26.33 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.361154  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85387  predicted protein  27.32 
 
 		 430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.424834 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  25.68 
 
 		 435 aa  114  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  27.82 
 
 		 437 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  27.82 
 
 		 437 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0444  adenylosuccinate synthase  30.28 
 
 		 430 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  29.1 
 
 		 430 aa  114  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  27.17 
 
 		 432 aa  114  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  30.51 
 
 		 430 aa  114  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0172  adenylosuccinate synthetase  26.71 
 
 		 400 aa  114  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08766  adenylosuccinate synthetase  28.41 
 
 		 423 aa  114  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0287341  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  31.25 
 
 		 428 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  27.55 
 
 		 428 aa  113  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  30.2 
 
 		 431 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1671  adenylosuccinate synthetase  27.51 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  27.37 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1846  adenylosuccinate synthetase  27.51 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1490  adenylosuccinate synthetase  27.51 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  25.64 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  26.53 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  28.82 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  28.82 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  28.57 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7050  adenylosuccinate synthetase  30.08 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  25.8 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  24.88 
 
 		 416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19549  predicted protein  28.77 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.277088 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  29.18 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  28.81 
 
 		 423 aa  112  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  26.81 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  26.53 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  28.13 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  25.86 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  25.57 
 
 		 457 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  29.37 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  29.34 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  25.86 
 
 		 430 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2131  adenylosuccinate synthetase  26.43 
 
 		 416 aa  110  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  29.8 
 
 		 431 aa  110  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1365  adenylosuccinate synthetase  28.86 
 
 		 420 aa  110  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1927  adenylosuccinate synthetase  24.24 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>