More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7050 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7050  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 432 aa  894    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  57.75 
 
 		 423 aa  522  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  55.87 
 
 		 423 aa  507  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1202  adenylosuccinate synthetase  57.24 
 
 		 425 aa  502  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.609737  normal  0.550164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1608  adenylosuccinate synthetase  56.25 
 
 		 428 aa  501  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.395219  normal  0.555835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4579  adenylosuccinate synthetase  55.09 
 
 		 431 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08766  adenylosuccinate synthetase  55.14 
 
 		 423 aa  500  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0287341  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1701  adenylosuccinate synthetase  56.31 
 
 		 431 aa  499  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.401877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0464  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  47.2 
 
 		 434 aa  403  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  46.77 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5638  adenylosuccinate synthetase  48.84 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0744769  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  47.32 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  46.74 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  46.54 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  47.31 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  46.34 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  44.47 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  45.14 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  47.44 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  46.33 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  45.91 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  46.22 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  44.78 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  45.35 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  46 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  45.48 
 
 		 430 aa  363  2e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  45.58 
 
 		 428 aa  364  2e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  44.26 
 
 		 419 aa  362  9e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  44.63 
 
 		 428 aa  360  2e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  45.73 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  45.41 
 
 		 431 aa  360  3e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  45.64 
 
 		 432 aa  359  5e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  45.64 
 
 		 432 aa  359  6e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  43.79 
 
 		 430 aa  359  6e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  43.95 
 
 		 429 aa  358  9e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  43.02 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  43.02 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  44.65 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  42.39 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  42.39 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  42.39 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  43.93 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  44.14 
 
 		 437 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  43.56 
 
 		 427 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  44.84 
 
 		 429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1068  adenylosuccinate synthetase  43.56 
 
 		 428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 		 425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  43.33 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  42.59 
 
 		 431 aa  353  4e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  43.33 
 
 		 430 aa  352  5e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  45.06 
 
 		 429 aa  352  5e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  43.22 
 
 		 416 aa  353  5e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  43.19 
 
 		 428 aa  353  5e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  42.86 
 
 		 427 aa  352  7e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  43.33 
 
 		 430 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  42.42 
 
 		 427 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  43.59 
 
 		 427 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  43.53 
 
 		 428 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  43.02 
 
 		 427 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  45.01 
 
 		 427 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  44.06 
 
 		 431 aa  350  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  44.16 
 
 		 425 aa  350  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  43.33 
 
 		 430 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  44.52 
 
 		 430 aa  349  5e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  41.96 
 
 		 432 aa  349  6e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  41.31 
 
 		 426 aa  349  6e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  43.29 
 
 		 433 aa  349  6e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  44.37 
 
 		 430 aa  349  6e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  43.09 
 
 		 432 aa  349  7e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  43.09 
 
 		 432 aa  349  7e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  43.09 
 
 		 432 aa  349  7e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  43.09 
 
 		 432 aa  349  7e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  43.09 
 
 		 432 aa  349  7e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  43.09 
 
 		 432 aa  349  7e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  43.09 
 
 		 432 aa  349  7e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  43.09 
 
 		 432 aa  349  7e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  43.09 
 
 		 432 aa  349  7e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  44.19 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  42.63 
 
 		 430 aa  348  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  45.62 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  41.45 
 
 		 432 aa  347  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4469  adenylosuccinate synthetase  44.24 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  42.62 
 
 		 432 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  42.62 
 
 		 432 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  43.29 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  43.94 
 
 		 442 aa  348  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  41.92 
 
 		 432 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  44.34 
 
 		 436 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  41.92 
 
 		 432 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  42.69 
 
 		 431 aa  346  4e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  41.92 
 
 		 432 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  43.32 
 
 		 430 aa  346  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  42.09 
 
 		 431 aa  346  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  43.9 
 
 		 430 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  44.39 
 
 		 429 aa  345  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  43.9 
 
 		 430 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  42.99 
 
 		 430 aa  346  6e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>