More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0552 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  75.81 
 
 		 433 aa  703    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  74.36 
 
 		 430 aa  677    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  71.33 
 
 		 430 aa  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  97.45 
 
 		 432 aa  866    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 432 aa  883    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  76.74 
 
 		 431 aa  716    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  72.03 
 
 		 430 aa  665    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  66.05 
 
 		 431 aa  608  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  60.51 
 
 		 432 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  60.51 
 
 		 432 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  60.51 
 
 		 432 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  59.91 
 
 		 431 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  55.94 
 
 		 429 aa  511  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  56.88 
 
 		 427 aa  506  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  57.55 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  54.31 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  52.91 
 
 		 428 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  55.71 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  52.68 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  52.45 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  54.31 
 
 		 429 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  56.37 
 
 		 451 aa  491  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  55.74 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  54.91 
 
 		 431 aa  484  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  53.61 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 		 432 aa  484  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  54.57 
 
 		 430 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  54.21 
 
 		 431 aa  484  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  54.57 
 
 		 430 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  54.57 
 
 		 430 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  54.57 
 
 		 430 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  53.74 
 
 		 431 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  55.06 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  55.24 
 
 		 437 aa  478  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  53.44 
 
 		 446 aa  480  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  53.63 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  51.99 
 
 		 429 aa  474  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  54.48 
 
 		 428 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  54.21 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  54.21 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  53.56 
 
 		 438 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  54.46 
 
 		 434 aa  473  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  53.76 
 
 		 427 aa  473  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  54.33 
 
 		 427 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  52.63 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  54.06 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  53.29 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  52.98 
 
 		 438 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 431 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  53.38 
 
 		 432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  53.38 
 
 		 432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  53.97 
 
 		 429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 		 431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 		 431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  54.8 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 		 432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  53.38 
 
 		 432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  53.38 
 
 		 432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  53.46 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 430 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  51.16 
 
 		 429 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  51.16 
 
 		 429 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 430 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  53.61 
 
 		 432 aa  465  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 431 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  51.16 
 
 		 429 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  51.86 
 
 		 444 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 		 431 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  53.86 
 
 		 427 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 		 432 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  51.98 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  54.12 
 
 		 426 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  54.82 
 
 		 427 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  51.16 
 
 		 429 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 		 430 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 		 431 aa  463  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  53.61 
 
 		 432 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  51.53 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  52.87 
 
 		 438 aa  462  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  54.23 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 		 431 aa  463  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  52.33 
 
 		 432 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 431 aa  463  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 		 432 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  52.09 
 
 		 447 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 		 428 aa  458  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1162  adenylosuccinate synthetase  52.06 
 
 		 446 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>