More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3069 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  74.71 
 
 		 432 aa  671    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  74.71 
 
 		 432 aa  671    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  90.95 
 
 		 431 aa  817    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  77.49 
 
 		 432 aa  705    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  72.08 
 
 		 437 aa  659    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  75.81 
 
 		 431 aa  681    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  74.48 
 
 		 432 aa  674    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  90.02 
 
 		 431 aa  810    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  74.94 
 
 		 432 aa  674    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  74.71 
 
 		 432 aa  671    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  75.17 
 
 		 432 aa  678    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  75.41 
 
 		 432 aa  686    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  74.94 
 
 		 432 aa  674    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  74.25 
 
 		 432 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  74.25 
 
 		 432 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  88.4 
 
 		 431 aa  789    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  74.71 
 
 		 432 aa  671    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  75.17 
 
 		 432 aa  677    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  89.56 
 
 		 431 aa  804    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  75.17 
 
 		 432 aa  680    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  74.54 
 
 		 438 aa  674    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  89.56 
 
 		 431 aa  796    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  74.71 
 
 		 432 aa  671    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  90.49 
 
 		 431 aa  809    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  90.49 
 
 		 431 aa  814    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  74.71 
 
 		 432 aa  671    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  90.95 
 
 		 431 aa  816    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  74.71 
 
 		 432 aa  674    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  90.72 
 
 		 431 aa  815    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  74.48 
 
 		 432 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  74.71 
 
 		 432 aa  671    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  89.33 
 
 		 431 aa  798    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  73.17 
 
 		 438 aa  669    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  74.25 
 
 		 432 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  74.71 
 
 		 432 aa  671    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  77.67 
 
 		 432 aa  702    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  74.31 
 
 		 438 aa  676    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  74.48 
 
 		 432 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  70.23 
 
 		 432 aa  635    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  90.26 
 
 		 431 aa  813    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  90.26 
 
 		 431 aa  813    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  88.17 
 
 		 431 aa  791    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  91.18 
 
 		 431 aa  821    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 431 aa  885    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  90.26 
 
 		 431 aa  814    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  74.25 
 
 		 432 aa  672    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  74.71 
 
 		 432 aa  671    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  74.94 
 
 		 432 aa  673    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  69.53 
 
 		 431 aa  626  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  69.07 
 
 		 430 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  68.14 
 
 		 431 aa  617  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  68.6 
 
 		 430 aa  616  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  69.3 
 
 		 430 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  69.07 
 
 		 430 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  69.3 
 
 		 430 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  69.07 
 
 		 430 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  67.67 
 
 		 430 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  67.44 
 
 		 430 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  68.6 
 
 		 430 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  67.44 
 
 		 431 aa  605  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0577  adenylosuccinate synthetase  66.13 
 
 		 432 aa  606  9.999999999999999e-173  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  67.44 
 
 		 429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  65.43 
 
 		 430 aa  599  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  67.06 
 
 		 432 aa  590  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  66.74 
 
 		 431 aa  587  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  63.57 
 
 		 431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  64.27 
 
 		 437 aa  580  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  64.73 
 
 		 431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1810  adenylosuccinate synthetase  64.04 
 
 		 429 aa  571  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.518624 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0645  adenylosuccinate synthetase  64.97 
 
 		 429 aa  571  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0677  adenylosuccinate synthetase  64.5 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0550  adenylosuccinate synthetase  63.49 
 
 		 431 aa  560  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0526  adenylosuccinate synthetase  63.02 
 
 		 431 aa  559  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  62.65 
 
 		 432 aa  559  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  62.56 
 
 		 432 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0441  adenylosuccinate synthetase  61.06 
 
 		 435 aa  551  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.83493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  61.4 
 
 		 430 aa  548  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  63.43 
 
 		 431 aa  547  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  60.36 
 
 		 446 aa  538  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  60.93 
 
 		 431 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1094  adenylosuccinate synthetase  62.61 
 
 		 440 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.562394  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2076  adenylosuccinate synthetase  61.33 
 
 		 446 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  59.82 
 
 		 446 aa  531  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2096  adenylosuccinate synthetase  60.5 
 
 		 447 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  59.53 
 
 		 430 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3013  adenylosuccinate synthetase  60.7 
 
 		 430 aa  528  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220071  normal  0.0269955 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  59.3 
 
 		 430 aa  524  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1473  adenylosuccinate synthetase  60.18 
 
 		 448 aa  521  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209737  normal  0.290596 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  59.4 
 
 		 435 aa  521  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  61.24 
 
 		 436 aa  522  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1825  adenylosuccinate synthetase  60.41 
 
 		 448 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.260214  normal  0.42401 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6278  adenylosuccinate synthetase  60.41 
 
 		 448 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1712  adenylosuccinate synthetase  60.18 
 
 		 448 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12828  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1739  adenylosuccinate synthetase  60.18 
 
 		 448 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1801  adenylosuccinate synthetase  60.41 
 
 		 448 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2344  adenylosuccinate synthetase  60.5 
 
 		 448 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2296  adenylosuccinate synthetase  58.76 
 
 		 458 aa  520  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16562  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1606  adenylosuccinate synthetase  60.05 
 
 		 448 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54976  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2198  adenylosuccinate synthetase  59.86 
 
 		 443 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  58.41 
 
 		 435 aa  519  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>