More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1939 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 428 aa  880    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  81.69 
 
 		 451 aa  734    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  78.64 
 
 		 427 aa  695    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  70.89 
 
 		 424 aa  619  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  64.15 
 
 		 426 aa  564  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  65.96 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  55.42 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  56.37 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  54.59 
 
 		 431 aa  478  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  54.48 
 
 		 432 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  54.25 
 
 		 432 aa  475  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  53.77 
 
 		 430 aa  471  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  53.77 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 433 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  55.19 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  52.69 
 
 		 427 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 442 aa  463  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  53.3 
 
 		 438 aa  461  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  51.16 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 426 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  52.94 
 
 		 427 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  52.59 
 
 		 430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  53.77 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  53.79 
 
 		 430 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  52.96 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  52.96 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  52.59 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 		 428 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  52.96 
 
 		 431 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  51.17 
 
 		 428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  53.3 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  52.35 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  52.94 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  51.17 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  53.07 
 
 		 431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  53.3 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  53.07 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  53.07 
 
 		 431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  52.59 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 427 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  53.08 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  53.08 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  52.96 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  52.37 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  52.94 
 
 		 807 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 		 434 aa  442  1e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 		 533 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  53.08 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  51.94 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  53.19 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  49.77 
 
 		 428 aa  440  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 432 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 432 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 432 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 432 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  52.25 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  52.25 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 		 430 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 430 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  51.89 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  52.93 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  51.54 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  51.54 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  51.65 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  53.07 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 		 426 aa  436  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 		 448 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  51.89 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 		 432 aa  433  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  51.53 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4777  adenylosuccinate synthetase  54.59 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545109  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>