More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0203 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 431 aa  880    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  67.37 
 
 		 433 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  66.67 
 
 		 432 aa  610  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  66.05 
 
 		 432 aa  608  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  66.43 
 
 		 430 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  65.35 
 
 		 431 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  65.27 
 
 		 430 aa  597  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  65.03 
 
 		 430 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  59.07 
 
 		 431 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  57.34 
 
 		 432 aa  521  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  57.58 
 
 		 432 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  57.58 
 
 		 432 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  57.34 
 
 		 429 aa  513  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  56.41 
 
 		 429 aa  508  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  57.68 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  56.64 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  56.24 
 
 		 451 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  54.78 
 
 		 427 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  54.59 
 
 		 428 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  55.48 
 
 		 427 aa  481  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  53.85 
 
 		 444 aa  474  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 428 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  53.61 
 
 		 447 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  53.61 
 
 		 447 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  53.1 
 
 		 446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  52.56 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  54.46 
 
 		 430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  55.56 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  54.55 
 
 		 432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  52.52 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 		 427 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  53.61 
 
 		 437 aa  467  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  53.63 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 		 431 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  51.75 
 
 		 435 aa  463  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  52.48 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  53.99 
 
 		 427 aa  461  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 		 435 aa  460  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  52.68 
 
 		 449 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  52.93 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  53.29 
 
 		 427 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  52.56 
 
 		 430 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  53.22 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  53.86 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  53.86 
 
 		 430 aa  458  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  54.48 
 
 		 424 aa  456  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 431 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 		 426 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  52.01 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  51.98 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  52.69 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  51.86 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  53.56 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  54.21 
 
 		 431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 		 430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 		 430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  53.02 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 		 430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 		 436 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  53.26 
 
 		 442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 		 430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 		 432 aa  448  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 439 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 439 aa  451  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  54.01 
 
 		 439 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  52.79 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  51.63 
 
 		 430 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  53.61 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  53.02 
 
 		 430 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 		 432 aa  450  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  51.41 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 424 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  51.63 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  52.11 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  52.55 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 		 439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  51.86 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  51.4 
 
 		 457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  51.67 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 		 436 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>