More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2029 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 429 aa  874    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  61.07 
 
 		 429 aa  537  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  57.21 
 
 		 430 aa  521  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  55.24 
 
 		 433 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  57.34 
 
 		 431 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  55.94 
 
 		 432 aa  511  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  55.71 
 
 		 430 aa  511  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  55.94 
 
 		 432 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  55.71 
 
 		 431 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  55.01 
 
 		 430 aa  503  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  57.11 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  53.85 
 
 		 427 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  54.08 
 
 		 428 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  52.33 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  53.52 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  53.38 
 
 		 427 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  52.33 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  57.65 
 
 		 424 aa  490  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  55.66 
 
 		 451 aa  488  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  55.9 
 
 		 427 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  56.37 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  52.93 
 
 		 426 aa  485  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  52.71 
 
 		 424 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  55.92 
 
 		 427 aa  480  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  51.98 
 
 		 429 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  55.66 
 
 		 432 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  56.18 
 
 		 431 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  55.4 
 
 		 426 aa  475  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  55.66 
 
 		 432 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  55.43 
 
 		 432 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 		 447 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 		 447 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  55.12 
 
 		 430 aa  471  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  54.35 
 
 		 430 aa  471  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 430 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  51.98 
 
 		 447 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 		 444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  51.75 
 
 		 449 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  55.42 
 
 		 425 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  53.86 
 
 		 432 aa  465  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  53.85 
 
 		 431 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 444 aa  464  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 429 aa  463  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 437 aa  461  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  49.07 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  53.02 
 
 		 442 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  52.68 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  50.93 
 
 		 429 aa  455  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  53.02 
 
 		 426 aa  455  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  52.35 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  51.99 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  51.99 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 		 427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 432 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 427 aa  451  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 437 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  48.95 
 
 		 439 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 437 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  49.42 
 
 		 439 aa  448  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 436 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  54.59 
 
 		 439 aa  448  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  52.22 
 
 		 807 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 		 428 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 		 428 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  54.85 
 
 		 428 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  52.45 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  50.93 
 
 		 448 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  54.55 
 
 		 431 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  48.72 
 
 		 439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 		 427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 		 427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  49.18 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>