More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4927 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  100 
 
 
427 aa  871    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  62.06 
 
 
428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  61.36 
 
 
427 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  61.14 
 
 
426 aa  558  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  61.12 
 
 
428 aa  554  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  62.06 
 
 
427 aa  551  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  60.89 
 
 
428 aa  548  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  61.61 
 
 
427 aa  546  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  59.91 
 
 
429 aa  537  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  58.77 
 
 
444 aa  532  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  57.86 
 
 
430 aa  530  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  57.14 
 
 
430 aa  524  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  57.11 
 
 
447 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  58.19 
 
 
427 aa  520  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  55.16 
 
 
429 aa  521  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  57.11 
 
 
447 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  59.2 
 
 
429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  59.2 
 
 
429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  58.55 
 
 
427 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  59.2 
 
 
429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  59.2 
 
 
429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  57.45 
 
 
430 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  55.92 
 
 
449 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  57.45 
 
 
430 aa  513  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  59.91 
 
 
429 aa  509  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  56.64 
 
 
433 aa  511  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  56.88 
 
 
431 aa  510  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  59.67 
 
 
429 aa  508  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  55.92 
 
 
447 aa  510  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  58.06 
 
 
427 aa  510  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  57.58 
 
 
424 aa  511  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  56.4 
 
 
444 aa  511  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  56.87 
 
 
439 aa  508  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  59.43 
 
 
429 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  59.67 
 
 
429 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  59.67 
 
 
429 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  59.2 
 
 
429 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  56.16 
 
 
439 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  55.82 
 
 
427 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  57.08 
 
 
432 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  57.55 
 
 
432 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  56.53 
 
 
427 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  56.78 
 
 
426 aa  503  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  57.48 
 
 
427 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  57.68 
 
 
431 aa  500  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  53.99 
 
 
433 aa  501  1e-140  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  56.94 
 
 
432 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  55.42 
 
 
430 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  54.16 
 
 
424 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  56.28 
 
 
430 aa  495  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  54.98 
 
 
437 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  56.84 
 
 
430 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  57.58 
 
 
427 aa  498  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  57.38 
 
 
434 aa  495  1e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  54.85 
 
 
807 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  55.21 
 
 
439 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  55.32 
 
 
429 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  54.98 
 
 
437 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  54.98 
 
 
437 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0069  adenylosuccinate synthetase  54.98 
 
 
432 aa  491  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215485  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  53.92 
 
 
428 aa  489  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  57.01 
 
 
427 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  53.38 
 
 
429 aa  491  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  52.62 
 
 
427 aa  486  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  56.07 
 
 
428 aa  486  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  54.27 
 
 
437 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  57.01 
 
 
431 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 
427 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  56.54 
 
 
431 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  56.54 
 
 
431 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 
427 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  56.54 
 
 
431 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  55.79 
 
 
428 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  58.16 
 
 
428 aa  482  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  56.87 
 
 
445 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4777  adenylosuccinate synthetase  58.87 
 
 
429 aa  483  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  54.8 
 
 
429 aa  482  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1280  adenylosuccinate synthetase  54.57 
 
 
427 aa  483  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  56.31 
 
 
431 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  55.27 
 
 
428 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  54.25 
 
 
438 aa  479  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  57.01 
 
 
429 aa  481  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  54.03 
 
 
436 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  53.32 
 
 
436 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  53.32 
 
 
436 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  54.01 
 
 
429 aa  481  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  53.55 
 
 
428 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  54.39 
 
 
430 aa  479  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05720  adenylosuccinate synthetase  54.2 
 
 
445 aa  477  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196579  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  52.48 
 
 
426 aa  474  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  53.32 
 
 
436 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  54.8 
 
 
429 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  53.38 
 
 
428 aa  478  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 
428 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4054  adenylosuccinate synthetase  56.67 
 
 
428 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.441295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  54.42 
 
 
426 aa  478  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  52.71 
 
 
433 aa  472  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  53.08 
 
 
429 aa  472  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  54.42 
 
 
430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  52.73 
 
 
432 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>