More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0183 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  72.07 
 
 		 424 aa  639    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 451 aa  930    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  76.06 
 
 		 427 aa  692    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  81.69 
 
 		 428 aa  734    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  64.62 
 
 		 426 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  65.73 
 
 		 425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  56.13 
 
 		 429 aa  502  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  56.37 
 
 		 432 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  56.13 
 
 		 432 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  55.66 
 
 		 429 aa  488  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  56.24 
 
 		 431 aa  490  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  55.66 
 
 		 433 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  55.42 
 
 		 431 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  55.9 
 
 		 430 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  54.95 
 
 		 442 aa  483  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  55.9 
 
 		 430 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  54.35 
 
 		 428 aa  477  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  55.53 
 
 		 427 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  55.42 
 
 		 430 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  52.11 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  54.48 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  52.55 
 
 		 433 aa  461  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  53.54 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 426 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 433 aa  458  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  53.18 
 
 		 427 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 444 aa  455  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  51.65 
 
 		 430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  53.54 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  52.17 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  51.41 
 
 		 429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  55.04 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  52.47 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  51.64 
 
 		 807 aa  448  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 		 428 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  53.3 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  51.65 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  53.3 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 		 427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  53.32 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  51.65 
 
 		 447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  51.65 
 
 		 447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  51.88 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  52.84 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  53.3 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  52.35 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  51.41 
 
 		 533 aa  443  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 439 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  52.59 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  51.78 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 448 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  54.01 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  52.48 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  52.13 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  51.54 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 427 aa  440  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 436 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  52.13 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  50.69 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  52 
 
 		 432 aa  438  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  50.93 
 
 		 437 aa  440  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  51.9 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  52.13 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  51.9 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  50.46 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  51.41 
 
 		 428 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  51.4 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 		 437 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 444 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  50.95 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 436 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  50.94 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 428 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  51.89 
 
 		 430 aa  438  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  51.9 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>