More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6908 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  70.79 
 
 		 427 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4777  adenylosuccinate synthetase  75.47 
 
 		 429 aa  649    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  78.32 
 
 		 431 aa  694    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38190  adenylosuccinate synthetase  85.51 
 
 		 428 aa  714    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5137  adenylosuccinate synthetase  78.74 
 
 		 433 aa  679    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  78.32 
 
 		 431 aa  694    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  79.67 
 
 		 428 aa  708    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4054  adenylosuccinate synthetase  76.87 
 
 		 428 aa  663    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.441295  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  78.09 
 
 		 431 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  77.8 
 
 		 432 aa  686    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  78.32 
 
 		 431 aa  694    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 429 aa  867    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  79.02 
 
 		 431 aa  701    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  70.85 
 
 		 427 aa  619  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  69.63 
 
 		 427 aa  618  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  70.38 
 
 		 427 aa  620  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  69.86 
 
 		 427 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  68.69 
 
 		 427 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  71.56 
 
 		 427 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  68.53 
 
 		 429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  67.06 
 
 		 427 aa  594  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  68.69 
 
 		 428 aa  597  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  65.89 
 
 		 429 aa  591  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4344  adenylosuccinate synthetase  66.67 
 
 		 432 aa  593  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  66.12 
 
 		 430 aa  589  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  64.95 
 
 		 432 aa  588  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  64.95 
 
 		 429 aa  584  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  67.38 
 
 		 428 aa  587  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4119  adenylosuccinate synthetase  65.89 
 
 		 428 aa  582  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0180773  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  64.25 
 
 		 807 aa  580  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0667  adenylosuccinate synthetase  64.02 
 
 		 429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  64.72 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0522  adenylosuccinate synthetase  63.55 
 
 		 429 aa  574  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  63.32 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  63.27 
 
 		 428 aa  559  1e-158  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  63.66 
 
 		 433 aa  555  1e-157  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02210  adenylosuccinate synthetase  63.08 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05720  adenylosuccinate synthetase  61.31 
 
 		 445 aa  544  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196579  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  59.25 
 
 		 434 aa  508  1e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  57.01 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  55.17 
 
 		 438 aa  492  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 		 427 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1958  adenylosuccinate synthetase  56.74 
 
 		 425 aa  477  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  52.97 
 
 		 430 aa  476  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  57.45 
 
 		 439 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  57.24 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  55.79 
 
 		 427 aa  468  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 		 428 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  52.02 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  55.04 
 
 		 451 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  53.41 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  51.41 
 
 		 429 aa  461  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  53.13 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0444  adenylosuccinate synthase  53.36 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 		 427 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  53.74 
 
 		 427 aa  461  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  52.45 
 
 		 426 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  52.58 
 
 		 447 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  52.11 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  52.11 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  52.58 
 
 		 447 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  52.11 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  52.11 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  52.93 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  51.41 
 
 		 437 aa  455  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 426 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  53.65 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  53.65 
 
 		 432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4214  adenylosuccinate synthase  52.9 
 
 		 430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.855707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  51.88 
 
 		 447 aa  448  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 444 aa  451  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0990  adenylosuccinate synthetase  55.06 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  52.71 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  53.13 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  52.71 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  53.18 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  53.41 
 
 		 433 aa  441  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 429 aa  443  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  51.88 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  52.47 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 437 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  53.41 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 424 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 444 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  52.24 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  52.47 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  51.41 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  49.77 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  52.91 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  51.17 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 		 433 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>