More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1452 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
433 aa  883    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  60.71 
 
 
434 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  61.43 
 
 
435 aa  544  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  61.19 
 
 
434 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  60 
 
 
434 aa  535  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  60.24 
 
 
434 aa  533  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  60.24 
 
 
434 aa  534  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  59.29 
 
 
429 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  54.74 
 
 
427 aa  481  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  53.21 
 
 
428 aa  481  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  53.68 
 
 
428 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  55.45 
 
 
427 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  54.03 
 
 
427 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  52.27 
 
 
442 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  52.71 
 
 
427 aa  472  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  54.5 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  53.79 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  52.84 
 
 
428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  53.55 
 
 
427 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
429 aa  466  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 
427 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  54.21 
 
 
434 aa  468  9.999999999999999e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 
424 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  52.02 
 
 
429 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  52.93 
 
 
433 aa  464  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  54.27 
 
 
427 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  52.96 
 
 
433 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 
431 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  51.9 
 
 
427 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  51.54 
 
 
432 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 
432 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  54.5 
 
 
428 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  51.54 
 
 
430 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 
428 aa  456  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  52.02 
 
 
429 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  52.02 
 
 
429 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  52.02 
 
 
429 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  52.01 
 
 
431 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  52.02 
 
 
429 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 
424 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  52.61 
 
 
427 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 
451 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 
428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  51.07 
 
 
430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 
426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  52.25 
 
 
428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  52.84 
 
 
447 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  52.13 
 
 
444 aa  451  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  51.31 
 
 
428 aa  450  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  52.84 
 
 
447 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
430 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  54.27 
 
 
427 aa  451  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  51.9 
 
 
449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  51.07 
 
 
426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 
426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 
430 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  50.69 
 
 
438 aa  443  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  52.25 
 
 
807 aa  443  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  52.25 
 
 
429 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  52.25 
 
 
430 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  51.78 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  52.01 
 
 
425 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  51.78 
 
 
429 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  52.84 
 
 
427 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  53.79 
 
 
428 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 
437 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
437 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
427 aa  435  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
428 aa  437  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  51.31 
 
 
429 aa  438  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  52.94 
 
 
438 aa  435  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
437 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 
447 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  51.44 
 
 
439 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  51.31 
 
 
429 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
437 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
428 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  51.31 
 
 
429 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  50.35 
 
 
426 aa  435  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
430 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  51.83 
 
 
438 aa  434  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
432 aa  432  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
428 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 
429 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
430 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  52.06 
 
 
439 aa  432  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
428 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 
429 aa  430  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
444 aa  428  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
432 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
439 aa  431  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
432 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 
427 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 
429 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 
427 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 
432 aa  431  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 
430 aa  430  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
432 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1460  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
427 aa  431  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>