More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2266 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 425 aa  869    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  65.73 
 
 		 451 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  65.96 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  63.85 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  63.62 
 
 		 424 aa  545  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  56.37 
 
 		 429 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  57.78 
 
 		 426 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  55.42 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  55.56 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  54.48 
 
 		 430 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  53.43 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  55.9 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  53.43 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  54.91 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  54.91 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  54.91 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  51.89 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  53.3 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  52 
 
 		 427 aa  458  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  52.01 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  53.77 
 
 		 431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 432 aa  448  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  53.07 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 		 426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 		 437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  51.66 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 		 427 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 		 431 aa  441  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  52.01 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 		 427 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 429 aa  438  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  48.7 
 
 		 428 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  51.19 
 
 		 431 aa  438  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  51.9 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  51.9 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 		 429 aa  438  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 533 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  50.95 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  51.9 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  51.76 
 
 		 807 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  51.65 
 
 		 427 aa  438  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 448 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  52.37 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  51.9 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  51.66 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  50 
 
 		 433 aa  436  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  51.43 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  51.66 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  50.71 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  50.83 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 		 428 aa  431  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 		 444 aa  432  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  48.59 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  48.94 
 
 		 426 aa  433  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  51.17 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  47.87 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  49.76 
 
 		 430 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 430 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  50.95 
 
 		 430 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 		 427 aa  428  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 		 428 aa  428  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 		 431 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  50.83 
 
 		 432 aa  428  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  49.29 
 
 		 430 aa  425  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 		 430 aa  425  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 437 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  51.17 
 
 		 432 aa  425  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 		 427 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 		 430 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  48.59 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  49.77 
 
 		 437 aa  425  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  49.77 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>