More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0677 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_38190  adenylosuccinate synthetase  79.44 
 
 
428 aa  657    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4054  adenylosuccinate synthetase  82.48 
 
 
428 aa  712    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.441295  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  81.78 
 
 
428 aa  726    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  95.8 
 
 
431 aa  837    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  96.04 
 
 
431 aa  838    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  96.04 
 
 
431 aa  839    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  79.02 
 
 
429 aa  679    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5137  adenylosuccinate synthetase  77.8 
 
 
433 aa  663    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  86.54 
 
 
432 aa  766    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  96.04 
 
 
431 aa  839    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
431 aa  868    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4777  adenylosuccinate synthetase  74.77 
 
 
429 aa  631  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  67.54 
 
 
427 aa  595  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  68.07 
 
 
427 aa  595  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  65.89 
 
 
427 aa  588  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  67.92 
 
 
428 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  65.89 
 
 
429 aa  578  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  67.52 
 
 
427 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  67.52 
 
 
427 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  65.89 
 
 
807 aa  578  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  67.06 
 
 
427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  66.59 
 
 
427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  64.5 
 
 
430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  64.25 
 
 
429 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  65.42 
 
 
427 aa  570  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0667  adenylosuccinate synthetase  63.08 
 
 
429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0522  adenylosuccinate synthetase  62.38 
 
 
429 aa  562  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  65.03 
 
 
429 aa  560  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  63.49 
 
 
432 aa  555  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4344  adenylosuccinate synthetase  63.66 
 
 
432 aa  557  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  62.59 
 
 
428 aa  548  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  62.88 
 
 
428 aa  551  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  60.9 
 
 
428 aa  537  1e-151  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  59.81 
 
 
428 aa  532  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  60.66 
 
 
433 aa  525  1e-148  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05720  adenylosuccinate synthetase  59.19 
 
 
445 aa  527  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196579  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02210  adenylosuccinate synthetase  61.68 
 
 
429 aa  524  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4119  adenylosuccinate synthetase  59.81 
 
 
428 aa  519  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0180773  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  58.31 
 
 
434 aa  493  9.999999999999999e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  56.31 
 
 
427 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  54.02 
 
 
438 aa  478  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 
427 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  51.75 
 
 
430 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  54.23 
 
 
447 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  54.23 
 
 
447 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 
430 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  53.05 
 
 
444 aa  461  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  53.52 
 
 
447 aa  458  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 
426 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 
428 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 
430 aa  454  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  52.44 
 
 
430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  55.32 
 
 
427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  51.87 
 
 
428 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 
428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  52.58 
 
 
437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  55.86 
 
 
438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  53.54 
 
 
426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  53.18 
 
 
433 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 
429 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  52.11 
 
 
449 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  52.11 
 
 
444 aa  449  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  52.09 
 
 
429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  52.09 
 
 
429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  51.85 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  52.09 
 
 
429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  52.09 
 
 
429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  53.3 
 
 
426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  51.87 
 
 
430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  49.64 
 
 
427 aa  442  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 
424 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  52.2 
 
 
430 aa  443  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  53.47 
 
 
430 aa  441  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1958  adenylosuccinate synthetase  54.14 
 
 
425 aa  443  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 
432 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 
424 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  53.29 
 
 
427 aa  438  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0444  adenylosuccinate synthase  51.76 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
432 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  50.82 
 
 
432 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  53.12 
 
 
432 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
432 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
432 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
432 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
432 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 
427 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
432 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
432 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  53.12 
 
 
432 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
432 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  51.3 
 
 
429 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
432 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
432 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  53.12 
 
 
432 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
432 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  50.82 
 
 
432 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>