More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4054 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4054  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 428 aa  868    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.441295  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  81.54 
 
 		 432 aa  726    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  82.94 
 
 		 431 aa  736    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5137  adenylosuccinate synthetase  78.74 
 
 		 433 aa  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  84.58 
 
 		 428 aa  749    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  76.87 
 
 		 429 aa  662    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  83.41 
 
 		 431 aa  738    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  82.94 
 
 		 431 aa  736    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38190  adenylosuccinate synthetase  78.5 
 
 		 428 aa  657    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  82.94 
 
 		 431 aa  736    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  82.48 
 
 		 431 aa  735    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4777  adenylosuccinate synthetase  73.13 
 
 		 429 aa  619  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545109  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  69.16 
 
 		 427 aa  608  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  68.22 
 
 		 428 aa  597  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  67.99 
 
 		 427 aa  597  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  67.29 
 
 		 427 aa  596  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  66.82 
 
 		 427 aa  593  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  68.22 
 
 		 427 aa  592  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  68.22 
 
 		 427 aa  590  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  67.76 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  66.59 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  63.79 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  63.51 
 
 		 430 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  63.64 
 
 		 428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  62.88 
 
 		 429 aa  559  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0522  adenylosuccinate synthetase  62.38 
 
 		 429 aa  561  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0667  adenylosuccinate synthetase  62.38 
 
 		 429 aa  559  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  62.88 
 
 		 807 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  62.62 
 
 		 428 aa  556  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4344  adenylosuccinate synthetase  62.73 
 
 		 432 aa  554  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  64.02 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  61.68 
 
 		 432 aa  547  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  62.15 
 
 		 428 aa  546  1e-154  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  60.05 
 
 		 428 aa  538  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  60.89 
 
 		 433 aa  531  1e-149  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02210  adenylosuccinate synthetase  62.38 
 
 		 429 aa  526  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05720  adenylosuccinate synthetase  58.6 
 
 		 445 aa  523  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196579  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4119  adenylosuccinate synthetase  59.26 
 
 		 428 aa  511  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0180773  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  56.67 
 
 		 427 aa  498  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  57.14 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  55.63 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  53.63 
 
 		 427 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  57.01 
 
 		 438 aa  466  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  52.02 
 
 		 430 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  55.29 
 
 		 426 aa  468  9.999999999999999e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  51.54 
 
 		 430 aa  461  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  53.9 
 
 		 444 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  53.43 
 
 		 449 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  54.72 
 
 		 426 aa  458  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  53.19 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  54.85 
 
 		 427 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  53.43 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  53.43 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  52.25 
 
 		 444 aa  448  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  52.25 
 
 		 437 aa  448  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1958  adenylosuccinate synthetase  53.19 
 
 		 425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  52.48 
 
 		 439 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 		 430 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  54.14 
 
 		 439 aa  445  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 		 426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 424 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  52.24 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 428 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  52.48 
 
 		 427 aa  438  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  51.3 
 
 		 439 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  48.01 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 437 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  48.01 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  53.19 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  52.25 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  49.07 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  49.07 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 428 aa  428  1e-118  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  48.95 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  48.95 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  48.95 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  50.7 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>