More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  79.21 
 
 		 428 aa  702    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  78.27 
 
 		 431 aa  690    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  85.51 
 
 		 429 aa  734    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  79.21 
 
 		 432 aa  699    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  78.5 
 
 		 431 aa  691    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4054  adenylosuccinate synthetase  78.5 
 
 		 428 aa  674    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.441295  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5137  adenylosuccinate synthetase  78.04 
 
 		 433 aa  674    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4777  adenylosuccinate synthetase  74.77 
 
 		 429 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545109  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  78.5 
 
 		 431 aa  691    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38190  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 428 aa  864    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  78.5 
 
 		 431 aa  691    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  79.44 
 
 		 431 aa  699    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  70.79 
 
 		 427 aa  632  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  72.04 
 
 		 427 aa  623  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  72.27 
 
 		 427 aa  623  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  68.22 
 
 		 427 aa  607  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  71.73 
 
 		 427 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  69.16 
 
 		 427 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  68.69 
 
 		 428 aa  606  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  71.87 
 
 		 427 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  66.12 
 
 		 429 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4344  adenylosuccinate synthetase  65.97 
 
 		 432 aa  593  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  67.06 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  66.82 
 
 		 429 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  65.65 
 
 		 429 aa  585  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  65.19 
 
 		 430 aa  585  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  65.19 
 
 		 807 aa  585  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  68.09 
 
 		 428 aa  586  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  65.42 
 
 		 428 aa  582  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  64.72 
 
 		 428 aa  579  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  63.79 
 
 		 432 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4119  adenylosuccinate synthetase  64.72 
 
 		 428 aa  571  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0180773  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0667  adenylosuccinate synthetase  64.02 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  64.02 
 
 		 428 aa  569  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0522  adenylosuccinate synthetase  63.79 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05720  adenylosuccinate synthetase  63.12 
 
 		 445 aa  561  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196579  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02210  adenylosuccinate synthetase  66.35 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  62.5 
 
 		 433 aa  552  1e-156  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  60.66 
 
 		 434 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  56.44 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  55.63 
 
 		 438 aa  492  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  53.68 
 
 		 430 aa  486  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  53.86 
 
 		 427 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  58.39 
 
 		 439 aa  479  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  56 
 
 		 426 aa  480  1e-134  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  52.26 
 
 		 430 aa  472  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  53.54 
 
 		 430 aa  471  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  52.96 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  56.78 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  52.48 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  54.61 
 
 		 447 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  54.61 
 
 		 447 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  55.32 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1958  adenylosuccinate synthetase  55.56 
 
 		 425 aa  463  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 429 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 429 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  53.9 
 
 		 444 aa  460  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 		 427 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 429 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 426 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 		 429 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  55.04 
 
 		 427 aa  460  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  51.17 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  51.07 
 
 		 427 aa  457  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0444  adenylosuccinate synthase  52.67 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  53.9 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0990  adenylosuccinate synthetase  56 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  53.3 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  52.25 
 
 		 428 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  52.48 
 
 		 449 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  51.54 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  52.25 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  52.82 
 
 		 430 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  51.87 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  52.79 
 
 		 430 aa  448  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  52.56 
 
 		 432 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  52.94 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  52.24 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4214  adenylosuccinate synthase  52.67 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.855707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  53.66 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  52.01 
 
 		 444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  52.33 
 
 		 432 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  54.91 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  54.08 
 
 		 437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  52.61 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  52.61 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  52.61 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  49.18 
 
 		 427 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  49.18 
 
 		 427 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  53.18 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  52.61 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  52.61 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  53.18 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  52.2 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>