More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0176 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  78.64 
 
 
428 aa  695    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
427 aa  878    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  76.06 
 
 
451 aa  692    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  68.78 
 
 
424 aa  623  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  65.33 
 
 
426 aa  580  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  63.85 
 
 
425 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  55.66 
 
 
429 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  55.9 
 
 
429 aa  487  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  53.63 
 
 
427 aa  480  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  53.77 
 
 
427 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  53.41 
 
 
427 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  53.65 
 
 
807 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 
432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  53.3 
 
 
430 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  51.89 
 
 
432 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  52.94 
 
 
427 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 
433 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 
431 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  52.94 
 
 
429 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  54.48 
 
 
427 aa  462  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 
442 aa  463  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 
428 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  52.59 
 
 
427 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 
431 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  51.88 
 
 
427 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
433 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 
429 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  50.7 
 
 
433 aa  457  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 
428 aa  457  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 
430 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  51.54 
 
 
429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 
427 aa  451  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  51.95 
 
 
438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 
430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 
429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 
427 aa  448  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 
448 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 
427 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  52.47 
 
 
432 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  52.48 
 
 
431 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  51.65 
 
 
432 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
430 aa  448  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 
429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  52.48 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 
426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  51.17 
 
 
428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  52.37 
 
 
431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  51.89 
 
 
533 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 
427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  52.48 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  52.48 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 
431 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4344  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 
432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 
444 aa  441  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  51.42 
 
 
448 aa  443  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 
429 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 
429 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 
428 aa  443  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 
429 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 
428 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  51.65 
 
 
431 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  51.66 
 
 
428 aa  443  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
430 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 
429 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
444 aa  444  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  51.3 
 
 
430 aa  442  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  51.89 
 
 
432 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 
427 aa  444  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 
427 aa  444  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 
428 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  52.25 
 
 
431 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  52.01 
 
 
431 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 
429 aa  441  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  51.42 
 
 
430 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 
424 aa  444  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 
429 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  51.41 
 
 
431 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 
428 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 
428 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  51.3 
 
 
429 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  51.3 
 
 
429 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 
432 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  51.18 
 
 
430 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 
431 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
432 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 
431 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 
431 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
432 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4119  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 
428 aa  440  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0180773  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
429 aa  438  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 
447 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 
431 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  51.65 
 
 
431 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  50.12 
 
 
430 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>