More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0444 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0444  adenylosuccinate synthase  100 
 
 
430 aa  873    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  74.41 
 
 
430 aa  664    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4214  adenylosuccinate synthase  93.26 
 
 
430 aa  830    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.855707  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4594  adenylosuccinate synthase  59.16 
 
 
428 aa  546  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  51.63 
 
 
427 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  53.3 
 
 
427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  51.66 
 
 
429 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  51.66 
 
 
429 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  51.66 
 
 
429 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0867  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
432 aa  451  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000883365  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  51.66 
 
 
429 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_849  adenylosuccinate synthase  50.24 
 
 
432 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000104861  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  50.95 
 
 
430 aa  449  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 
429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0976  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 
423 aa  444  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000393074  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
430 aa  444  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  53.36 
 
 
429 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
427 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  54.1 
 
 
447 aa  441  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  54.1 
 
 
447 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  49.18 
 
 
424 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  52.24 
 
 
431 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  52.24 
 
 
431 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  52.24 
 
 
431 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 
431 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  52.24 
 
 
431 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 
430 aa  436  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  51.66 
 
 
429 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  51.66 
 
 
429 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 
428 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 
428 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 
429 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 
429 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
427 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 
429 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 
426 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
428 aa  431  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  50.95 
 
 
429 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  51.4 
 
 
427 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 
427 aa  425  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5137  adenylosuccinate synthetase  51.74 
 
 
433 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  51.99 
 
 
437 aa  428  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 
429 aa  427  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  51.53 
 
 
432 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  51.4 
 
 
427 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  48.14 
 
 
428 aa  424  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 
449 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 
427 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 
447 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38190  adenylosuccinate synthetase  52.67 
 
 
428 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 
428 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 
427 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 
427 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  46.45 
 
 
429 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 
437 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
437 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
437 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 
444 aa  419  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
434 aa  419  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
436 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  47 
 
 
433 aa  420  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 
428 aa  420  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4344  adenylosuccinate synthetase  49.43 
 
 
432 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
444 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  49.19 
 
 
807 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  49.19 
 
 
429 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  48.6 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 
427 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 
439 aa  411  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 
436 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 
427 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  49.07 
 
 
427 aa  413  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
439 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  48.83 
 
 
431 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  47.67 
 
 
427 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  47.44 
 
 
432 aa  408  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  49.07 
 
 
427 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1068  adenylosuccinate synthetase  47.89 
 
 
428 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 
445 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 
432 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  46.01 
 
 
424 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  52.1 
 
 
430 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0069  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 
432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215485  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  47.91 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 
432 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  49.41 
 
 
426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 
426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  48.36 
 
 
433 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  47.67 
 
 
428 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 
428 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 
439 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  46.03 
 
 
428 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  46.03 
 
 
428 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4777  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
429 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545109  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05720  adenylosuccinate synthetase  48.2 
 
 
445 aa  401  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196579  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  47.79 
 
 
430 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  47.88 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>