More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1068 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1068  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
428 aa  879    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  51.99 
 
 
427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
429 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_849  adenylosuccinate synthase  49.88 
 
 
432 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000104861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4594  adenylosuccinate synthase  48.6 
 
 
428 aa  441  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 
447 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 
428 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0867  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 
432 aa  435  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000883365  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  49.18 
 
 
426 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0976  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 
423 aa  429  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000393074  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  51.3 
 
 
807 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  51.54 
 
 
429 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 
432 aa  430  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  48.01 
 
 
444 aa  430  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  47.79 
 
 
433 aa  425  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 
427 aa  428  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  48.48 
 
 
437 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 
427 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  48.35 
 
 
428 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
428 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  48.1 
 
 
427 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  47.64 
 
 
439 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  48.01 
 
 
444 aa  422  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  48.37 
 
 
431 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 
427 aa  422  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  47.88 
 
 
439 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  47.52 
 
 
424 aa  419  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  47.9 
 
 
430 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  47.88 
 
 
428 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 
431 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  47.91 
 
 
431 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  47.07 
 
 
437 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  47.88 
 
 
439 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
431 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  48.48 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  48.25 
 
 
428 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 
427 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 
430 aa  415  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  46.01 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 
430 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  47.21 
 
 
432 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  47.67 
 
 
432 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 
428 aa  414  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  45.99 
 
 
430 aa  413  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  46.37 
 
 
436 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  46.85 
 
 
430 aa  415  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 
429 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  48.48 
 
 
429 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  46.14 
 
 
447 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  50.12 
 
 
426 aa  412  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  46.37 
 
 
436 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 
427 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  46.14 
 
 
447 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  47.55 
 
 
430 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4344  adenylosuccinate synthetase  46.98 
 
 
432 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  46.37 
 
 
449 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4214  adenylosuccinate synthase  47.89 
 
 
430 aa  408  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.855707  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0444  adenylosuccinate synthase  47.89 
 
 
430 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4777  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 
429 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  47.32 
 
 
430 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  46.67 
 
 
434 aa  409  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 
433 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  48.12 
 
 
431 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 
445 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  47.65 
 
 
432 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  46.35 
 
 
429 aa  411  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  47.52 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  48.68 
 
 
428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  47.06 
 
 
431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  47.31 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 
427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  46.14 
 
 
436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  45.96 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 
427 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  49.88 
 
 
428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  46.14 
 
 
437 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 
435 aa  404  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  47.53 
 
 
430 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  46.14 
 
 
437 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  45.9 
 
 
436 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  48.47 
 
 
425 aa  403  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  47.58 
 
 
438 aa  404  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  47.53 
 
 
430 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  46.82 
 
 
430 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  44.76 
 
 
434 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  46.57 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  46.24 
 
 
431 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  48.6 
 
 
430 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  46.12 
 
 
451 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1280  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 
427 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  46.19 
 
 
429 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  47.54 
 
 
431 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  47.54 
 
 
431 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  46.24 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  48.03 
 
 
438 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>