More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2958 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 428 aa  877    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  99.53 
 
 		 428 aa  874    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  60.89 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  56.16 
 
 		 430 aa  511  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  56.64 
 
 		 430 aa  513  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  56.97 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  55.06 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  53.29 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  53.88 
 
 		 424 aa  488  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  54.33 
 
 		 427 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  54.5 
 
 		 427 aa  480  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  53.99 
 
 		 428 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  56.03 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  53.86 
 
 		 427 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  53.99 
 
 		 428 aa  478  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  53.86 
 
 		 427 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  53.38 
 
 		 427 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  53.29 
 
 		 429 aa  471  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  54.85 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 		 429 aa  472  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  55.16 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  55.16 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  55.16 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  55.16 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0069  adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215485  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  51.17 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 		 437 aa  462  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  51.52 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  53.94 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 		 427 aa  455  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  53.3 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 		 449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  51.41 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  52.01 
 
 		 427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  54.46 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  54.69 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  49.42 
 
 		 447 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  49.18 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  54.46 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  54.23 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  48.95 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 		 432 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  54.46 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  49.31 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 437 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 		 436 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  49.42 
 
 		 444 aa  443  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  53.99 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 		 436 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 436 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 436 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  54.08 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  51.41 
 
 		 425 aa  440  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  49.77 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1280  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  50.71 
 
 		 807 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  48.48 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 428 aa  435  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  49.18 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  49.19 
 
 		 446 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  48.95 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  48.95 
 
 		 439 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  50.95 
 
 		 429 aa  431  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 431 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 		 430 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  51.18 
 
 		 426 aa  433  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 431 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  49.42 
 
 		 439 aa  430  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 427 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>