More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_05641 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  68.58 
 
 
449 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  84.4 
 
 
437 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
437 aa  892    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  69.72 
 
 
447 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  69.79 
 
 
447 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  81.46 
 
 
439 aa  754    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  81.46 
 
 
439 aa  753    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  82.76 
 
 
436 aa  761    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  73.56 
 
 
444 aa  679    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  83.07 
 
 
439 aa  770    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  83.68 
 
 
436 aa  761    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  69.79 
 
 
447 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  82.53 
 
 
436 aa  761    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  70.02 
 
 
444 aa  658    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
437 aa  892    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  69.11 
 
 
437 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  82.3 
 
 
436 aa  758    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  70.25 
 
 
445 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  54.82 
 
 
427 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  54.98 
 
 
427 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 
430 aa  479  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 
428 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  54.1 
 
 
427 aa  477  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  52.01 
 
 
428 aa  471  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  53.79 
 
 
427 aa  473  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 
430 aa  473  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0069  adenylosuccinate synthetase  51.41 
 
 
432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  51.19 
 
 
429 aa  467  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  51.98 
 
 
430 aa  463  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
429 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  51.16 
 
 
433 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 
434 aa  461  9.999999999999999e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  52.45 
 
 
430 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  52.71 
 
 
427 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  51.16 
 
 
431 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  53.18 
 
 
430 aa  458  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  51.16 
 
 
432 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  51.98 
 
 
430 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  52.34 
 
 
430 aa  455  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1280  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 
427 aa  455  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  51.16 
 
 
432 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 
427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  51.5 
 
 
438 aa  450  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  50.83 
 
 
424 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
426 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
429 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 
429 aa  450  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1958  adenylosuccinate synthetase  51.9 
 
 
425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  52.66 
 
 
438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  50.83 
 
 
428 aa  444  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  48.93 
 
 
427 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
427 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  49.88 
 
 
433 aa  443  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
429 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  52.1 
 
 
428 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  49.76 
 
 
427 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
428 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
428 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  48.22 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 
429 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 
429 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  49.64 
 
 
426 aa  436  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 
429 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
433 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  52.27 
 
 
428 aa  436  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  51.3 
 
 
426 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 
429 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  49.04 
 
 
434 aa  438  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
428 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  48.83 
 
 
431 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 
427 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 
439 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  51.17 
 
 
430 aa  434  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  48.56 
 
 
434 aa  429  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  49.77 
 
 
430 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  48.45 
 
 
435 aa  429  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  48.51 
 
 
446 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 
427 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 
451 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 
427 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 
434 aa  425  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  47.97 
 
 
429 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  48.46 
 
 
807 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  48.14 
 
 
431 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 
434 aa  427  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  47.76 
 
 
430 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 
424 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  49.19 
 
 
432 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  49.19 
 
 
432 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  49.77 
 
 
431 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  49.19 
 
 
432 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 
429 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 
431 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  48.72 
 
 
442 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 
428 aa  421  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 
428 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 
428 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>