More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1231 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  76.16 
 
 
432 aa  681    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  77.08 
 
 
432 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  97.2 
 
 
429 aa  845    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  96.97 
 
 
533 aa  849    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0285  adenylosuccinate synthetase  75.06 
 
 
429 aa  677    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  71.26 
 
 
430 aa  649    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  73.95 
 
 
430 aa  650    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
429 aa  865    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  74.88 
 
 
430 aa  678    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  72.33 
 
 
448 aa  651    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  74.71 
 
 
431 aa  648    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  74.54 
 
 
432 aa  671    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  74.88 
 
 
430 aa  669    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  70.86 
 
 
430 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  70.79 
 
 
457 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  73.49 
 
 
430 aa  658    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  74.65 
 
 
448 aa  669    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  78.7 
 
 
432 aa  705    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  76.62 
 
 
432 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  74.42 
 
 
430 aa  664    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  73.95 
 
 
430 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  72.33 
 
 
430 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  71.93 
 
 
431 aa  633  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  70.86 
 
 
430 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  72.33 
 
 
430 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  72.09 
 
 
430 aa  628  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  69.7 
 
 
430 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  69.46 
 
 
430 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  69.7 
 
 
430 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  70.53 
 
 
431 aa  618  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  69.46 
 
 
429 aa  615  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  70.3 
 
 
431 aa  614  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  69 
 
 
429 aa  614  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0558  adenylosuccinate synthetase  68.62 
 
 
429 aa  615  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  68.65 
 
 
437 aa  610  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  67.21 
 
 
430 aa  597  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  68.69 
 
 
428 aa  600  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  66.2 
 
 
429 aa  586  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  65.97 
 
 
429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0475  adenylosuccinate synthetase  66.43 
 
 
429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.636476  hitchhiker  0.00197029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2784  adenylosuccinate synthetase  63.17 
 
 
429 aa  555  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436445  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0337  adenylosuccinate synthetase  55.87 
 
 
425 aa  511  1e-144  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112659  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0564  adenylosuccinate synthetase  51.75 
 
 
431 aa  483  1e-135  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0461  adenylosuccinate synthetase  51.98 
 
 
430 aa  477  1e-133  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  56.25 
 
 
436 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5753  adenylosuccinate synthase  56.78 
 
 
429 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590489 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6526  adenylosuccinate synthetase  56.67 
 
 
432 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5832  adenylosuccinate synthase  56.91 
 
 
432 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6199  adenylosuccinate synthase  56.91 
 
 
453 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0247215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  53.13 
 
 
442 aa  467  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  52.93 
 
 
432 aa  462  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  54.44 
 
 
432 aa  463  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5326  adenylosuccinate synthase  57.85 
 
 
432 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0668634 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5997  adenylosuccinate synthase  56.31 
 
 
429 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140056  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6675  adenylosuccinate synthase  56.91 
 
 
432 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  53.94 
 
 
435 aa  455  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  54.13 
 
 
444 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  53.86 
 
 
430 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  54.1 
 
 
430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 
431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  54.08 
 
 
431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 
431 aa  448  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 
432 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  53.63 
 
 
430 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1434  adenylosuccinate synthetase  53.44 
 
 
459 aa  451  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104272  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  54.33 
 
 
429 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 
431 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  53.46 
 
 
438 aa  449  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1583  adenylosuccinate synthetase  53.21 
 
 
440 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147694  unclonable  0.000000227018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  53.74 
 
 
431 aa  448  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  53.56 
 
 
445 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  52.8 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  51.87 
 
 
432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  52.1 
 
 
431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 
432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  51.87 
 
 
432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 
431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 
427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  54.33 
 
 
430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 
430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  51.72 
 
 
446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  51.37 
 
 
446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 
432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 
432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 
432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 
432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  53.16 
 
 
430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>