More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1523 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
442 aa  911    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  59.81 
 
 
430 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  60.05 
 
 
430 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  57.97 
 
 
432 aa  511  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  57.71 
 
 
430 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  57.71 
 
 
430 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  58.41 
 
 
429 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  57.94 
 
 
431 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  58.18 
 
 
430 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  56.57 
 
 
430 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  57.71 
 
 
431 aa  511  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  58.04 
 
 
431 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  58.18 
 
 
430 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  57.94 
 
 
430 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  55.76 
 
 
448 aa  504  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  57.94 
 
 
430 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  57.91 
 
 
431 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  57.94 
 
 
430 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  57.91 
 
 
432 aa  503  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  57.67 
 
 
431 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  57.91 
 
 
431 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  56.91 
 
 
431 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  57.67 
 
 
431 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  56.07 
 
 
431 aa  500  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  57.67 
 
 
431 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  56.48 
 
 
432 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  56.48 
 
 
432 aa  497  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  56.48 
 
 
432 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  55.45 
 
 
432 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  55.86 
 
 
435 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  56.48 
 
 
432 aa  497  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  56.48 
 
 
432 aa  497  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  55.76 
 
 
432 aa  497  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  56.25 
 
 
432 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  56.25 
 
 
432 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  56.48 
 
 
432 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  56.48 
 
 
432 aa  497  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  57.67 
 
 
431 aa  497  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  56.51 
 
 
431 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  56.51 
 
 
431 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  56.48 
 
 
432 aa  497  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  57.81 
 
 
437 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  56.48 
 
 
432 aa  497  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  56.51 
 
 
431 aa  494  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  56.02 
 
 
432 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  56.51 
 
 
431 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  56.38 
 
 
432 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  56.38 
 
 
432 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  56.02 
 
 
432 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  56.25 
 
 
432 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  56.38 
 
 
432 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  56.38 
 
 
432 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  56.74 
 
 
431 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  55.43 
 
 
432 aa  491  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  56.41 
 
 
431 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  54.06 
 
 
433 aa  488  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  57.54 
 
 
431 aa  490  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  55.94 
 
 
431 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  56.15 
 
 
432 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1473  adenylosuccinate synthetase  57.57 
 
 
448 aa  491  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209737  normal  0.290596 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  54.95 
 
 
451 aa  491  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5102  adenylosuccinate synthetase  57.11 
 
 
448 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  54.42 
 
 
430 aa  488  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  56.64 
 
 
431 aa  488  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1409  adenylosuccinate synthetase  57.34 
 
 
448 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000087591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1606  adenylosuccinate synthetase  56.65 
 
 
448 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54976  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  56.15 
 
 
432 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  56.64 
 
 
431 aa  490  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  55.56 
 
 
432 aa  491  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  55.79 
 
 
432 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  56.88 
 
 
431 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2216  adenylosuccinate synthetase  56.42 
 
 
448 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.130698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1333  adenylosuccinate synthetase  56.42 
 
 
448 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.018876  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2344  adenylosuccinate synthetase  56.42 
 
 
448 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  56.18 
 
 
431 aa  485  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2178  adenylosuccinate synthetase  56.42 
 
 
448 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1095  adenylosuccinate synthetase  56.42 
 
 
448 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  55.61 
 
 
430 aa  485  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0073  adenylosuccinate synthetase  56.42 
 
 
448 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1823  adenylosuccinate synthetase  56.42 
 
 
448 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  55.92 
 
 
432 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2530  adenylosuccinate synthetase  56.19 
 
 
448 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00750177  hitchhiker  0.00000299679 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1712  adenylosuccinate synthetase  56.65 
 
 
448 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12828  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1739  adenylosuccinate synthetase  56.65 
 
 
448 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  55.15 
 
 
437 aa  484  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  53.49 
 
 
429 aa  487  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  55.32 
 
 
432 aa  483  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  55.45 
 
 
432 aa  481  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  55.32 
 
 
430 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2245  adenylosuccinate synthetase  56.42 
 
 
448 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  54.4 
 
 
430 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1825  adenylosuccinate synthetase  56.42 
 
 
448 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.260214  normal  0.42401 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1889  adenylosuccinate synthetase  57.98 
 
 
431 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1564  Adenylosuccinate synthase  57.98 
 
 
431 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128883 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  55.05 
 
 
438 aa  482  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1070  adenylosuccinate synthetase  55.96 
 
 
446 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.763716  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1162  adenylosuccinate synthetase  55.73 
 
 
446 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.502883 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6278  adenylosuccinate synthetase  56.42 
 
 
448 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1801  adenylosuccinate synthetase  56.42 
 
 
448 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  54.86 
 
 
430 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0852587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>