More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4765 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  71.16 
 
 		 432 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  71.16 
 
 		 432 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 430 aa  879    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 430 aa  879    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  70.93 
 
 		 432 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  90.91 
 
 		 430 aa  812    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  70.93 
 
 		 432 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  71.79 
 
 		 431 aa  652    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  90.91 
 
 		 430 aa  812    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  71.16 
 
 		 432 aa  637    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  71.16 
 
 		 432 aa  637    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  87.91 
 
 		 429 aa  781    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  71.56 
 
 		 431 aa  643    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  71.16 
 
 		 432 aa  637    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  70.93 
 
 		 432 aa  638    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  71.16 
 
 		 432 aa  637    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  70.93 
 
 		 432 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  71.16 
 
 		 432 aa  637    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  70.47 
 
 		 432 aa  637    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  70.7 
 
 		 432 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  82.09 
 
 		 430 aa  735    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  99.07 
 
 		 430 aa  871    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 430 aa  879    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  70.7 
 
 		 432 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  71.86 
 
 		 432 aa  641    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  70.93 
 
 		 432 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  72.09 
 
 		 432 aa  643    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  74.83 
 
 		 431 aa  683    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  72.03 
 
 		 430 aa  663    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  88.14 
 
 		 430 aa  790    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  70.93 
 
 		 432 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  71.16 
 
 		 432 aa  637    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  71.16 
 
 		 432 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  71.86 
 
 		 432 aa  642    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  88.37 
 
 		 430 aa  792    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  90.49 
 
 		 431 aa  806    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  70.47 
 
 		 432 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  71.4 
 
 		 432 aa  645    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  69.46 
 
 		 431 aa  632  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  70.47 
 
 		 432 aa  631  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  69.95 
 
 		 438 aa  629  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  69.61 
 
 		 432 aa  630  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  70.23 
 
 		 431 aa  628  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  70.23 
 
 		 431 aa  628  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  71.16 
 
 		 431 aa  624  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  70.23 
 
 		 431 aa  626  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  69.27 
 
 		 438 aa  625  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  69.77 
 
 		 432 aa  626  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  68.3 
 
 		 432 aa  624  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  70.23 
 
 		 431 aa  627  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  69.07 
 
 		 437 aa  623  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  68.84 
 
 		 431 aa  618  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0677  adenylosuccinate synthetase  69.7 
 
 		 429 aa  618  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  69.3 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  69.07 
 
 		 431 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  69.07 
 
 		 431 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0645  adenylosuccinate synthetase  70.16 
 
 		 429 aa  620  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  67.89 
 
 		 438 aa  620  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  68.84 
 
 		 431 aa  617  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  69.3 
 
 		 431 aa  618  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  68.76 
 
 		 431 aa  618  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  69.07 
 
 		 431 aa  615  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  67.68 
 
 		 432 aa  617  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  69.77 
 
 		 431 aa  617  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  69.14 
 
 		 431 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  68.91 
 
 		 431 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0550  adenylosuccinate synthetase  67.21 
 
 		 431 aa  606  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0526  adenylosuccinate synthetase  66.74 
 
 		 431 aa  606  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  67.75 
 
 		 431 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  67.75 
 
 		 431 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  66.82 
 
 		 432 aa  604  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1810  adenylosuccinate synthetase  67.37 
 
 		 429 aa  600  1e-170  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.518624 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0441  adenylosuccinate synthetase  66.13 
 
 		 435 aa  598  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.83493  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  67.98 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0577  adenylosuccinate synthetase  64.27 
 
 		 432 aa  596  1e-169  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  65.14 
 
 		 437 aa  593  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  64.42 
 
 		 432 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  63.64 
 
 		 431 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2076  adenylosuccinate synthetase  63.99 
 
 		 446 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  63.38 
 
 		 435 aa  561  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  62.33 
 
 		 430 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2096  adenylosuccinate synthetase  63.53 
 
 		 447 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1070  adenylosuccinate synthetase  63.99 
 
 		 446 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.763716  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1226  adenylosuccinate synthetase  63.99 
 
 		 446 aa  558  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000419397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  61.42 
 
 		 446 aa  561  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1162  adenylosuccinate synthetase  63.76 
 
 		 446 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502883 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  62.56 
 
 		 430 aa  557  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  62.33 
 
 		 430 aa  555  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  60.55 
 
 		 446 aa  556  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  62.91 
 
 		 435 aa  557  1e-157  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3013  adenylosuccinate synthetase  63.02 
 
 		 430 aa  553  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220071  normal  0.0269955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1712  adenylosuccinate synthetase  61.93 
 
 		 448 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12828  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0073  adenylosuccinate synthetase  62.39 
 
 		 448 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2344  adenylosuccinate synthetase  62.39 
 
 		 448 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2216  adenylosuccinate synthetase  62.61 
 
 		 448 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.130698  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1823  adenylosuccinate synthetase  62.39 
 
 		 448 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1825  adenylosuccinate synthetase  62.16 
 
 		 448 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.260214  normal  0.42401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1739  adenylosuccinate synthetase  61.93 
 
 		 448 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1801  adenylosuccinate synthetase  62.16 
 
 		 448 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1095  adenylosuccinate synthetase  62.39 
 
 		 448 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>