More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2289 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 426 aa  873    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  64.62 
 
 		 451 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  65.33 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  63.06 
 
 		 424 aa  568  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  64.15 
 
 		 428 aa  564  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  57.78 
 
 		 425 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  55.4 
 
 		 429 aa  475  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  54.93 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  51.88 
 
 		 427 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  53.52 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  53.76 
 
 		 432 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  52.35 
 
 		 433 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  52.58 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  52.58 
 
 		 429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  53.52 
 
 		 430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 		 434 aa  450  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 449 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  51.18 
 
 		 427 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  50.83 
 
 		 429 aa  448  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  54.25 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  52.35 
 
 		 427 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  52.47 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  52.35 
 
 		 442 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  48.83 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  51.17 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 444 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  51.38 
 
 		 438 aa  438  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  53.65 
 
 		 432 aa  438  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  51.17 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  53.08 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 		 444 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  52.01 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  52 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  52 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  52.24 
 
 		 431 aa  431  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 		 424 aa  433  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 		 435 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  51.86 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  52 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  51.86 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  48.36 
 
 		 436 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  52.11 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  48.36 
 
 		 436 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  51.86 
 
 		 432 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  51.41 
 
 		 427 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  48.36 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  51.89 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 431 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 		 435 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  53.65 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1810  adenylosuccinate synthetase  52.2 
 
 		 429 aa  428  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.518624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 437 aa  430  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  50.94 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  48.83 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  51.89 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  52 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  50.94 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  51.04 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  51.66 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  52.24 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  49.18 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  51.88 
 
 		 431 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  51.41 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  51.17 
 
 		 430 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0645  adenylosuccinate synthetase  52.2 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  52 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  48.12 
 
 		 436 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  51.53 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  51.53 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  48.12 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  52 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  51.53 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 428 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>